RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544823.5

QKI-215, Transcript of QKI, KH domain containing RNA binding, human

TSL 2

Gene QKI, Length 597 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
QKI-215	ENST00000544823	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		7.32	□□□□□ -1.24
QKI-215	ENST00000544823	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
QKI-215	ENST00000544823	FAM129B	Q96TA1	746 aa		7.32	□□□□□ -1.24
QKI-215	ENST00000544823	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		7.32	□□□□□ -1.24
QKI-215	ENST00000544823	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		7.32	□□□□□ -1.24
QKI-215	ENST00000544823	ITPKA	P23677	461 aa		7.31	□□□□□ -1.24
QKI-215	ENST00000544823	OGFOD2	Q6N063	350 aa		7.31	□□□□□ -1.24
QKI-215	ENST00000544823	WDR18	Q9BV38	432 aa		7.31	□□□□□ -1.24
QKI-215	ENST00000544823	ABCB6	Q9NP58	842 aa		7.31	□□□□□ -1.24
QKI-215	ENST00000544823	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		7.31	□□□□□ -1.24
QKI-215	ENST00000544823	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
QKI-215	ENST00000544823	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		7.3	□□□□□ -1.24
QKI-215	ENST00000544823	FCGRT	P55899	365 aa		7.3	□□□□□ -1.24
QKI-215	ENST00000544823	PI16	Q6UXB8	463 aa		7.3	□□□□□ -1.24
QKI-215	ENST00000544823	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		7.3	□□□□□ -1.24
QKI-215	ENST00000544823	GATA6	Q92908	595 aa		7.3	□□□□□ -1.24
QKI-215	ENST00000544823	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
QKI-215	ENST00000544823	CITED4	Q96RK1	184 aa		7.3	□□□□□ -1.24
QKI-215	ENST00000544823	CSRNP1	Q96S65	589 aa		7.3	□□□□□ -1.24
QKI-215	ENST00000544823	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		7.3	□□□□□ -1.24
QKI-215	ENST00000544823	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
QKI-215	ENST00000544823	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
QKI-215	ENST00000544823	FAAP100	Q0VG06	881 aa		7.29	□□□□□ -1.24
QKI-215	ENST00000544823	AP3B2	Q13367	1082 aa		7.29	□□□□□ -1.24
QKI-215	ENST00000544823	GRM2	Q14416	872 aa		7.29	□□□□□ -1.24
QKI-215	ENST00000544823	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	7.29	□□□□□ -1.24
QKI-215	ENST00000544823	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		7.29	□□□□□ -1.24
QKI-215	ENST00000544823	FLCN	Q8NFG4	579 aa		7.29	□□□□□ -1.24
QKI-215	ENST00000544823	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
QKI-215	ENST00000544823	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
QKI-215	ENST00000544823	PIDD1	Q9HB75	910 aa		7.29	□□□□□ -1.24
QKI-215	ENST00000544823	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
QKI-215	ENST00000544823	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
QKI-215	ENST00000544823	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
QKI-215	ENST00000544823	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		7.28	□□□□□ -1.24
QKI-215	ENST00000544823	KCNB2	Q92953	911 aa		7.28	□□□□□ -1.24
QKI-215	ENST00000544823	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		7.28	□□□□□ -1.24
QKI-215	ENST00000544823	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		7.28	□□□□□ -1.24
QKI-215	ENST00000544823	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		7.28	□□□□□ -1.24
QKI-215	ENST00000544823	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		7.28	□□□□□ -1.24
QKI-215	ENST00000544823	SLFN14	P0C7P3	912 aa		7.27	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	CYP27A1	Q02318	531 aa		7.27	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	CDK5R2	Q13319	367 aa		7.27	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	FBXL18	Q96ME1	805 aa		7.27	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		7.27	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		7.27	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	C8A	P07357	584 aa		7.26	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		7.26	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	TMPRSS2	O15393	492 aa		7.25	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	ZNF862	O60290	1169 aa		7.25	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	IGHA2	P01877	340 aa		7.25	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		7.25	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		7.25	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		7.25	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		7.25	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	PRNP	P04156	253 aa		7.24	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	FAM87A	P0C7U9	286 aa		7.24	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	ID3	Q02535	119 aa		7.24	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		7.24	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	TTLL4	Q14679	1199 aa		7.24	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		7.24	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		7.24	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		7.24	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	BCO2	Q9BYV7	579 aa		7.24	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		7.24	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		7.24	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		7.23	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	BNIP3	Q12983	259 aa		7.23	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		7.23	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		7.23	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	TMC7	Q7Z402	723 aa		7.23	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		7.23	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		7.23	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	CBX8	Q9HC52	389 aa		7.23	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	DISC1	Q9NRI5	854 aa		7.23	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	MAPK1	P28482	360 aa		7.22	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	PDE4C	Q08493	712 aa		7.22	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	COL19A1	Q14993	1142 aa		7.22	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	7.22	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	STK35	Q8TDR2	534 aa		7.22	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		7.22	□□□□□ -1.25
QKI-215	ENST00000544823	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		7.21	□□□□□ -1.26
QKI-215	ENST00000544823	PLCB3	Q01970	1234 aa		7.21	□□□□□ -1.26
QKI-215	ENST00000544823	PLCL1	Q15111	1095 aa		7.21	□□□□□ -1.26
QKI-215	ENST00000544823	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
QKI-215	ENST00000544823	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		7.21	□□□□□ -1.26
QKI-215	ENST00000544823	SPRED2	Q7Z698	418 aa		7.21	□□□□□ -1.26
QKI-215	ENST00000544823	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
QKI-215	ENST00000544823	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		7.21	□□□□□ -1.26
QKI-215	ENST00000544823	CSAD	Q9Y600	493 aa		7.21	□□□□□ -1.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms