RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527622.5

CTTN-211, Transcript of cortactin, humanhuman

TSL 4

Gene CTTN, Length 597 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTN-211ENST00000527622 TMOD2Q9NZR1 351 aa23.4■■□□□ 1.34
CTTN-211ENST00000527622 DENND2AQ9ULE3 1009 aa23.4■■□□□ 1.34
CTTN-211ENST00000527622 HPS5Q9UPZ3 1129 aa23.4■■□□□ 1.34
CTTN-211ENST00000527622 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa23.4■■□□□ 1.34
CTTN-211ENST00000527622 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CTTN-211ENST00000527622 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa23.39■■□□□ 1.33
CTTN-211ENST00000527622 TIMM10P62072 90 aa23.39■■□□□ 1.33
CTTN-211ENST00000527622 TFCP2Q12800 502 aa23.39■■□□□ 1.33
CTTN-211ENST00000527622 NFIAQ12857 509 aa23.39■■□□□ 1.33
CTTN-211ENST00000527622 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa23.39■■□□□ 1.33
CTTN-211ENST00000527622 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
CTTN-211ENST00000527622 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
CTTN-211ENST00000527622 A0A1B0GUL7 405 aa23.38■■□□□ 1.33
CTTN-211ENST00000527622 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
CTTN-211ENST00000527622 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CTTN-211ENST00000527622 TMEM57Q8N5G2 664 aa23.38■■□□□ 1.33
CTTN-211ENST00000527622 BRI3BPQ8WY22 251 aa23.38■■□□□ 1.33
CTTN-211ENST00000527622 GAKO14976 1311 aa23.37■■□□□ 1.33
CTTN-211ENST00000527622 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CTTN-211ENST00000527622 SPDYE5A6NIY4 337 aa23.37■■□□□ 1.33
CTTN-211ENST00000527622 GNAI2P04899 355 aa23.37■■□□□ 1.33
CTTN-211ENST00000527622 LDHBP07195 334 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CTTN-211ENST00000527622 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CTTN-211ENST00000527622 CRHR2Q13324 411 aa23.37■■□□□ 1.33
CTTN-211ENST00000527622 XAGE2Q96GT9 111 aa23.37■■□□□ 1.33
CTTN-211ENST00000527622 FAM198AQ9UFP1 575 aa23.37■■□□□ 1.33
CTTN-211ENST00000527622 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa23.37■■□□□ 1.33
CTTN-211ENST00000527622 ATRNL1Q5VV63 1379 aa23.37■■□□□ 1.33
CTTN-211ENST00000527622 PTPRFP10586 1907 aa23.36■■□□□ 1.33
CTTN-211ENST00000527622 CAP1Q01518 475 aa23.36■■□□□ 1.33
CTTN-211ENST00000527622 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
CTTN-211ENST00000527622 FAM151AQ8WW52 585 aa23.36■■□□□ 1.33
CTTN-211ENST00000527622 WRNIP1Q96S55 665 aa23.36■■□□□ 1.33
CTTN-211ENST00000527622 SOX10P56693 466 aa23.35■■□□□ 1.33
CTTN-211ENST00000527622 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa23.35■■□□□ 1.33
CTTN-211ENST00000527622 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
CTTN-211ENST00000527622 OTUD5Q96G74 571 aa23.35■■□□□ 1.33
CTTN-211ENST00000527622 CSADQ9Y600 493 aa23.35■■□□□ 1.33
CTTN-211ENST00000527622 ZNF384Q8TF68 577 aa23.34■■□□□ 1.33
CTTN-211ENST00000527622 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
CTTN-211ENST00000527622 MAST2Q6P0Q8 1798 aa23.34■■□□□ 1.33
CTTN-211ENST00000527622 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
CTTN-211ENST00000527622 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa23.34■■□□□ 1.33
CTTN-211ENST00000527622 PHIPQ8WWQ0 1821 aa23.33■■□□□ 1.33
CTTN-211ENST00000527622 ZNF112Q9UJU3 913 aa23.33■■□□□ 1.33
CTTN-211ENST00000527622 AKAP2Q9Y2D5 859 aa23.33■■□□□ 1.33
CTTN-211ENST00000527622 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa23.32■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 RLBP1P12271 317 aa23.32■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 INPP5BP32019 993 aa23.32■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 GTF2A2P52657 109 aa23.32■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 TCP10Q12799 353 aa23.32■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 POLA2Q14181 598 aa23.32■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 CCL15Q16663 113 aa23.32■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 DCAF15Q66K64 600 aa23.32■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 MIGA2Q7L4E1 593 aa23.32■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 OTOP1Q7RTM1 612 aa23.32■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 ERO1BQ86YB8 467 aa23.32■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 ZFPM1Q8IX07 1006 aa23.32■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 FAM43AQ8N2R8 423 aa23.32■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 HOOK2Q96ED9 719 aa23.32■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 DOCK1Q14185 1865 aa23.32■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 IRF6O14896 467 aa23.31■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa23.31■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 PI16Q6UXB8 463 aa23.31■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 ZNF341Q9BYN7 854 aa23.31■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 USP40Q9NVE5 1235 aa23.31■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.31■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 PPIL2Q13356 520 aa23.3■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 SSH3Q8TE77 659 aa23.3■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 IDI2Q9BXS1 227 aa23.3■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 HMG20BQ9P0W2 317 aa23.3■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 FOCADQ5VW36 1801 aa23.29■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa23.29■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 CD99L2Q8TCZ2 262 aa23.29■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 ABCF2Q9UG63 623 aa23.29■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 TRIM17Q9Y577 477 aa23.29■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa23.29■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 SIPA1L1O43166 1804 aa23.29■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 RGS3P49796 1198 aa23.28■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.28■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 ATAD5Q96QE3 1844 aa23.27■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 MCAMP43121 646 aa23.27■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 RHBDL3P58872 404 aa23.27■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 MECOMQ03112 1051 aa23.27■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 ERO1AQ96HE7 468 aa23.27■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 NEUROD6Q96NK8 337 aa23.27■■□□□ 1.32
CTTN-211ENST00000527622 BTBD19C9JJ37 291 aa23.26■■□□□ 1.31
CTTN-211ENST00000527622 ENTPD3O75355 529 aa23.26■■□□□ 1.31
CTTN-211ENST00000527622 SP3Q02447 781 aa23.26■■□□□ 1.31
CTTN-211ENST00000527622 PPATQ06203 517 aa23.26■■□□□ 1.31
CTTN-211ENST00000527622 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
CTTN-211ENST00000527622 SPATA5Q8NB90 893 aa23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms