RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PTPRK-218ENST00000525459 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF532Q9HCE3 1301 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRK-218ENST00000525459 HIP1O00291 1037 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRK-218ENST00000525459 BTDP43251 543 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRK-218ENST00000525459 RGS3P49796 1198 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRK-218ENST00000525459 TNFAIP1Q13829 316 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRK-218ENST00000525459 NBPF9Q3BBW0 867 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRK-218ENST00000525459 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRK-218ENST00000525459 RILPL2Q969X0 211 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRK-218ENST00000525459 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRK-218ENST00000525459 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
PTPRK-218ENST00000525459 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
PTPRK-218ENST00000525459 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRK-218ENST00000525459 FKBP1CQ5VVH2 108 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRK-218ENST00000525459 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
PTPRK-218ENST00000525459 GGA3Q9NZ52 723 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRK-218ENST00000525459 NAV1Q8NEY1 1877 aa22.58■■□□□ 1.2
PTPRK-218ENST00000525459 TOMM70O94826 608 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRK-218ENST00000525459 PPP4CP60510 307 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRK-218ENST00000525459 APPBP2Q92624 585 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRK-218ENST00000525459 CLEC11AQ9Y240 323 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRK-218ENST00000525459 TRPM7Q96QT4 1865 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRK-218ENST00000525459 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PTPRK-218ENST00000525459 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PTPRK-218ENST00000525459 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PTPRK-218ENST00000525459 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRK-218ENST00000525459 MYH1P12882 1939 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRK-218ENST00000525459 SDSP20132 328 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRK-218ENST00000525459 TNNI2P48788 182 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRK-218ENST00000525459 CHADLQ6NUI6 762 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRK-218ENST00000525459 ADGRA1Q86SQ6 560 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRK-218ENST00000525459 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRK-218ENST00000525459 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.2
PTPRK-218ENST00000525459 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRK-218ENST00000525459 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRK-218ENST00000525459 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRK-218ENST00000525459 SULF1Q8IWU6 871 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRK-218ENST00000525459 USP40Q9NVE5 1235 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRK-218ENST00000525459 NPM3O75607 178 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
PTPRK-218ENST00000525459 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
PTPRK-218ENST00000525459 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
PTPRK-218ENST00000525459 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
PTPRK-218ENST00000525459 CLRN2A0PK11 232 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRK-218ENST00000525459 POTEIP0CG38 1075 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRK-218ENST00000525459 POTEJP0CG39 1038 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRK-218ENST00000525459 RHBDL3P58872 404 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRK-218ENST00000525459 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRK-218ENST00000525459 FAM83AQ86UY5 434 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRK-218ENST00000525459 AIDAQ96BJ3 306 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRK-218ENST00000525459 IDI2Q9BXS1 227 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRK-218ENST00000525459 VEZTQ9HBM0 779 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRK-218ENST00000525459 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRK-218ENST00000525459 MIGA1Q8NAN2 632 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRK-218ENST00000525459 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PTPRK-218ENST00000525459 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRK-218ENST00000525459 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRK-218ENST00000525459 FSTL1Q12841 308 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRK-218ENST00000525459 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRK-218ENST00000525459 TEX11Q8IYF3 940 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRK-218ENST00000525459 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PTPRK-218ENST00000525459 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
PTPRK-218ENST00000525459 SKAP1Q86WV1 359 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRK-218ENST00000525459 LAMB1P07942 1786 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRK-218ENST00000525459 ENTPD3O75355 529 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRK-218ENST00000525459 MBD4O95243 580 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRK-218ENST00000525459 GNAT2P19087 354 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRK-218ENST00000525459 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
PTPRK-218ENST00000525459 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
PTPRK-218ENST00000525459 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
PTPRK-218ENST00000525459 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
PTPRK-218ENST00000525459 RAD50Q92878 1312 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRK-218ENST00000525459 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
PTPRK-218ENST00000525459 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
PTPRK-218ENST00000525459 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRK-218ENST00000525459 OSBP2Q969R2 916 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRK-218ENST00000525459 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
PTPRK-218ENST00000525459 LCORLQ8N3X6 602 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRK-218ENST00000525459 FAM151AQ8WW52 585 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRK-218ENST00000525459 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRK-218ENST00000525459 TCP10L2B9ZVM9 353 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRK-218ENST00000525459 GPAA1O43292 621 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRK-218ENST00000525459 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRK-218ENST00000525459 HOOK2Q96ED9 719 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRK-218ENST00000525459 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRK-218ENST00000525459 CNTNAP1P78357 1384 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRK-218ENST00000525459 USP5P45974 858 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRK-218ENST00000525459 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PTPRK-218ENST00000525459 RASA3Q14644 834 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRK-218ENST00000525459 CASC1Q6TDU7 716 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRK-218ENST00000525459 ARMT1Q9H993 441 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRK-218ENST00000525459 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRK-218ENST00000525459 ATRNL1Q5VV63 1379 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRK-218ENST00000525459 MYH8P13535 1937 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRK-218ENST00000525459 CHGBP05060 677 aa22.45■■□□□ 1.19
PTPRK-218ENST00000525459 CACNB3P54284 484 aa22.45■■□□□ 1.19
PTPRK-218ENST00000525459 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.19
PTPRK-218ENST00000525459 FAM198AQ9UFP1 575 aa22.45■■□□□ 1.19
PTPRK-218ENST00000525459 FLT1P17948 1338 aa22.45■■□□□ 1.19
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