RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522091.1

CHTF8-208, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 8, human

TSL 2 BASIC

Gene CHTF8, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHTF8-208	ENST00000522091	GNAI3	P08754	354 aa		27.92	■■■□□ 2.06
CHTF8-208	ENST00000522091	CCL15	Q16663	113 aa		27.92	■■■□□ 2.06
CHTF8-208	ENST00000522091	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		27.92	■■■□□ 2.06
CHTF8-208	ENST00000522091	CCDC102B	Q68D86	513 aa		27.91	■■■□□ 2.06
CHTF8-208	ENST00000522091	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		27.91	■■■□□ 2.06
CHTF8-208	ENST00000522091	FAM151A	Q8WW52	585 aa		27.91	■■■□□ 2.06
CHTF8-208	ENST00000522091	ERO1A	Q96HE7	468 aa		27.91	■■■□□ 2.06
CHTF8-208	ENST00000522091	TNN	Q9UQP3	1299 aa		27.91	■■■□□ 2.06
CHTF8-208	ENST00000522091	SRGAP3	O43295	1099 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CHTF8-208	ENST00000522091	TRIM27	P14373	513 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CHTF8-208	ENST00000522091	MTX1	Q13505	466 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CHTF8-208	ENST00000522091	DCAF15	Q66K64	600 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CHTF8-208	ENST00000522091	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CHTF8-208	ENST00000522091	ZBTB22	O15209	634 aa		27.89	■■■□□ 2.06
CHTF8-208	ENST00000522091	BCAR3	O75815	825 aa		27.89	■■■□□ 2.06
CHTF8-208	ENST00000522091	TIMM10	P62072	90 aa		27.89	■■■□□ 2.06
CHTF8-208	ENST00000522091	CAP1	Q01518	475 aa		27.89	■■■□□ 2.06
CHTF8-208	ENST00000522091	SP3	Q02447	781 aa		27.89	■■■□□ 2.06
CHTF8-208	ENST00000522091	TCP10	Q12799	353 aa		27.89	■■■□□ 2.06
CHTF8-208	ENST00000522091	NFIA	Q12857	509 aa		27.89	■■■□□ 2.06
CHTF8-208	ENST00000522091	ERO1B	Q86YB8	467 aa		27.89	■■■□□ 2.06
CHTF8-208	ENST00000522091	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		27.89	■■■□□ 2.06
CHTF8-208	ENST00000522091	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
CHTF8-208	ENST00000522091	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
CHTF8-208	ENST00000522091	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		27.88	■■■□□ 2.05
CHTF8-208	ENST00000522091	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		27.88	■■■□□ 2.05
CHTF8-208	ENST00000522091	TFCP2	Q12800	502 aa		27.87	■■■□□ 2.05
CHTF8-208	ENST00000522091	RASGRF1	Q13972	1273 aa		27.87	■■■□□ 2.05
CHTF8-208	ENST00000522091	USP40	Q9NVE5	1235 aa		27.87	■■■□□ 2.05
CHTF8-208	ENST00000522091	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		27.87	■■■□□ 2.05
CHTF8-208	ENST00000522091	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
CHTF8-208	ENST00000522091		A0A1B0GUL7	405 aa		27.86	■■■□□ 2.05
CHTF8-208	ENST00000522091	IRF6	O14896	467 aa		27.86	■■■□□ 2.05
CHTF8-208	ENST00000522091	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		27.86	■■■□□ 2.05
CHTF8-208	ENST00000522091	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
CHTF8-208	ENST00000522091	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		27.86	■■■□□ 2.05
CHTF8-208	ENST00000522091	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		27.86	■■■□□ 2.05
CHTF8-208	ENST00000522091	AK9	Q5TCS8	1911 aa		27.86	■■■□□ 2.05
CHTF8-208	ENST00000522091	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		27.86	■■■□□ 2.05
CHTF8-208	ENST00000522091	CETP	P11597	493 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CHTF8-208	ENST00000522091	INPP5B	P32019	993 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CHTF8-208	ENST00000522091	PPIL2	Q13356	520 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CHTF8-208	ENST00000522091	XAGE2	Q96GT9	111 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CHTF8-208	ENST00000522091	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
CHTF8-208	ENST00000522091	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CHTF8-208	ENST00000522091	EFCC1	Q9HA90	598 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CHTF8-208	ENST00000522091	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CHTF8-208	ENST00000522091	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CHTF8-208	ENST00000522091	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
CHTF8-208	ENST00000522091	SNAPC2	Q13487	334 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CHTF8-208	ENST00000522091	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CHTF8-208	ENST00000522091	GAK	O14976	1311 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CHTF8-208	ENST00000522091	CENPF	P49454	3210 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CHTF8-208	ENST00000522091	BTBD19	C9JJ37	291 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CHTF8-208	ENST00000522091	GNAI2	P04899	355 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CHTF8-208	ENST00000522091	PPAT	Q06203	517 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CHTF8-208	ENST00000522091	ABCF2	Q9UG63	623 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CHTF8-208	ENST00000522091	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
CHTF8-208	ENST00000522091	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
CHTF8-208	ENST00000522091	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CHTF8-208	ENST00000522091	IDI2	Q9BXS1	227 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CHTF8-208	ENST00000522091	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
CHTF8-208	ENST00000522091	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CHTF8-208	ENST00000522091	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CHTF8-208	ENST00000522091	DOCK2	Q92608	1830 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CHTF8-208	ENST00000522091	RGS3	P49796	1198 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CHTF8-208	ENST00000522091	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
CHTF8-208	ENST00000522091	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CHTF8-208	ENST00000522091	TLR2	O60603	784 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CHTF8-208	ENST00000522091	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
CHTF8-208	ENST00000522091	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CHTF8-208	ENST00000522091	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
CHTF8-208	ENST00000522091	ENTPD3	O75355	529 aa		27.77	■■■□□ 2.04
CHTF8-208	ENST00000522091	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
CHTF8-208	ENST00000522091	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		27.76	■■■□□ 2.04
CHTF8-208	ENST00000522091	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
CHTF8-208	ENST00000522091	BTD	P43251	543 aa		27.76	■■■□□ 2.03
CHTF8-208	ENST00000522091	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		27.76	■■■□□ 2.03
CHTF8-208	ENST00000522091	PI16	Q6UXB8	463 aa		27.76	■■■□□ 2.03
CHTF8-208	ENST00000522091	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		27.76	■■■□□ 2.03
CHTF8-208	ENST00000522091	SLF2	Q8IX21	1173 aa		27.76	■■■□□ 2.03
CHTF8-208	ENST00000522091	ZNF384	Q8TF68	577 aa		27.76	■■■□□ 2.03
CHTF8-208	ENST00000522091	ARMC5	Q96C12	935 aa		27.76	■■■□□ 2.03
CHTF8-208	ENST00000522091	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		27.76	■■■□□ 2.03
CHTF8-208	ENST00000522091	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		27.76	■■■□□ 2.03
CHTF8-208	ENST00000522091	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		27.75	■■■□□ 2.03
CHTF8-208	ENST00000522091	POTEF	A5A3E0	1075 aa		27.75	■■■□□ 2.03
CHTF8-208	ENST00000522091	MECOM	Q03112	1051 aa		27.75	■■■□□ 2.03
CHTF8-208	ENST00000522091	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		27.75	■■■□□ 2.03
CHTF8-208	ENST00000522091	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
CHTF8-208	ENST00000522091	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
CHTF8-208	ENST00000522091	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		27.74	■■■□□ 2.03
CHTF8-208	ENST00000522091	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	27.74	■■■□□ 2.03
CHTF8-208	ENST00000522091	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	27.74	■■■□□ 2.03
CHTF8-208	ENST00000522091	ARHGEF6	Q15052	776 aa		27.74	■■■□□ 2.03
CHTF8-208	ENST00000522091	MIER1	Q8N108	512 aa		27.74	■■■□□ 2.03
CHTF8-208	ENST00000522091	SPATA5	Q8NB90	893 aa		27.74	■■■□□ 2.03
CHTF8-208	ENST00000522091	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		27.74	■■■□□ 2.03
CHTF8-208	ENST00000522091	MOGS	Q13724	837 aa		27.73	■■■□□ 2.03
CHTF8-208	ENST00000522091	GORAB	Q5T7V8	394 aa		27.73	■■■□□ 2.03

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