RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519106.1

CLDN23-201, Transcript of claudin 23, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN23, Length 2,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23-201ENST00000519106 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.56
CLDN23-201ENST00000519106 PDRG1Q9NUG6 133 aa24.83■■□□□ 1.56
CLDN23-201ENST00000519106 E7EWF7 191 aa24.82■■□□□ 1.56
CLDN23-201ENST00000519106 ALX1Q15699 326 aa24.82■■□□□ 1.56
CLDN23-201ENST00000519106 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CLDN23-201ENST00000519106 F8W031 263 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
CLDN23-201ENST00000519106 TDO2P48775 406 aa24.81■■□□□ 1.56
CLDN23-201ENST00000519106 BCS1LQ9Y276 419 aa24.81■■□□□ 1.56
CLDN23-201ENST00000519106 MYH2Q9UKX2 1941 aa24.81■■□□□ 1.56
CLDN23-201ENST00000519106 NLGN2Q8NFZ4 835 aa24.81■■□□□ 1.56
CLDN23-201ENST00000519106 TCEANC2Q96MN5 208 aa24.81■■□□□ 1.56
CLDN23-201ENST00000519106 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa24.81■■□□□ 1.56
CLDN23-201ENST00000519106 LDHCP07864 332 aa24.8■■□□□ 1.56
CLDN23-201ENST00000519106 RPS6KB1P23443 525 aa24.8■■□□□ 1.56
CLDN23-201ENST00000519106 MCM2P49736 904 aa24.8■■□□□ 1.56
CLDN23-201ENST00000519106 AK2P54819 239 aa24.8■■□□□ 1.56
CLDN23-201ENST00000519106 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
CLDN23-201ENST00000519106 SCN9AQ15858 1988 aa24.8■■□□□ 1.56
CLDN23-201ENST00000519106 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa24.79■■□□□ 1.56
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CLDN23-201ENST00000519106 LARGE2Q8N3Y3 721 aa24.79■■□□□ 1.56
CLDN23-201ENST00000519106 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
CLDN23-201ENST00000519106 UTRNP46939 3433 aa24.79■■□□□ 1.56
CLDN23-201ENST00000519106 ZMYM6O95789 1325 aa24.79■■□□□ 1.56
CLDN23-201ENST00000519106 STRIP1Q5VSL9 837 aa24.78■■□□□ 1.56
CLDN23-201ENST00000519106 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
CLDN23-201ENST00000519106 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa24.78■■□□□ 1.56
CLDN23-201ENST00000519106 BAG3O95817 575 aa24.78■■□□□ 1.56
CLDN23-201ENST00000519106 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
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CLDN23-201ENST00000519106 FOXD4L1Q9NU39 408 aa24.78■■□□□ 1.56
CLDN23-201ENST00000519106 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
CLDN23-201ENST00000519106 USP17L3A6NCW0 530 aa24.77■■□□□ 1.56
CLDN23-201ENST00000519106 USP17L4A6NCW7 530 aa24.77■■□□□ 1.56
CLDN23-201ENST00000519106 USP17L1Q7RTZ2 530 aa24.77■■□□□ 1.56
CLDN23-201ENST00000519106 SLF2Q8IX21 1173 aa24.77■■□□□ 1.56
CLDN23-201ENST00000519106 YDJCA8MPS7 323 aa24.77■■□□□ 1.56
CLDN23-201ENST00000519106 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
CLDN23-201ENST00000519106 TMX3Q96JJ7 454 aa24.77■■□□□ 1.56
CLDN23-201ENST00000519106 DACT2Q5SW24 774 aa24.76■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 BTDP43251 543 aa24.76■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 TBC1D10CQ8IV04 446 aa24.76■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 LAMA4Q16363 1823 aa24.75■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 SCNN1DP51172 638 aa24.75■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 CTDSPL2Q05D32 466 aa24.75■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa24.74■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 MINDY4BA8MYZ0 360 aa24.74■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 PPP4CP60510 307 aa24.74■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 KIAA0825Q8IV33 1275 aa24.74■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 TAOK3Q9H2K8 898 aa24.74■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 LRRC2Q9BYS8 371 aa24.74■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 INCENPQ9NQS7 918 aa24.74■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa24.74■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 IARSP41252 1262 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 CHST3Q7LGC8 479 aa24.73■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 STK11IPQ8N1F8 1099 aa24.73■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 VPS33BQ9H267 617 aa24.73■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa24.73■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa24.73■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 GAKO14976 1311 aa24.73■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 GIMAP6Q6P9H5 292 aa24.73■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 NCOA7Q8NI08 942 aa24.73■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 COL4A5P29400 1685 aa24.72■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 USP5P45974 858 aa24.72■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa24.72■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa24.71■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 NFKBIEO00221 500 aa24.71■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 RAD17O75943 681 aa24.71■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 PPARAQ07869 468 aa24.71■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 TRDNQ13061 729 aa24.71■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 Q6ZUG5 572 aa24.71■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 USP17L12C9JPN9 530 aa24.71■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 USP17L21D6R901 530 aa24.71■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 FGD1P98174 961 aa24.71■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 CTR9Q6PD62 1173 aa24.71■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 NIM1KQ8IY84 436 aa24.71■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa24.71■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 SMIM22K7EJ46 135 aa24.7■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
CLDN23-201ENST00000519106 ANKRD1Q15327 319 aa24.7■■□□□ 1.54
CLDN23-201ENST00000519106 AKNAD1Q5T1N1 836 aa24.7■■□□□ 1.54
CLDN23-201ENST00000519106 CERS3Q8IU89 383 aa24.7■■□□□ 1.54
CLDN23-201ENST00000519106 TEKT1Q969V4 418 aa24.7■■□□□ 1.54
CLDN23-201ENST00000519106 TACC3Q9Y6A5 838 aa24.7■■□□□ 1.54
CLDN23-201ENST00000519106 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
CLDN23-201ENST00000519106 PLCG2P16885 1265 aa24.69■■□□□ 1.54
CLDN23-201ENST00000519106 MFSD6Q6ZSS7 791 aa24.69■■□□□ 1.54
CLDN23-201ENST00000519106 TEX11Q8IYF3 940 aa24.69■■□□□ 1.54
CLDN23-201ENST00000519106 MCM9Q9NXL9 1143 aa24.69■■□□□ 1.54
CLDN23-201ENST00000519106 TPCN1Q9ULQ1 816 aa24.69■■□□□ 1.54
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