RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517323.2

TRPS1-206, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRPS1, Length 2,171 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-206ENST00000517323 NBPF3Q9H094 633 aa18.54■□□□□ 0.56
TRPS1-206ENST00000517323 CACNB3P54284 484 aa18.53■□□□□ 0.56
TRPS1-206ENST00000517323 GRIPAP1Q4V328 841 aa18.53■□□□□ 0.56
TRPS1-206ENST00000517323 IFNL3Q8IZI9 196 aa18.53■□□□□ 0.56
TRPS1-206ENST00000517323 JDP2Q8WYK2 163 aa18.53■□□□□ 0.56
TRPS1-206ENST00000517323 MCCP23508 829 aa18.52■□□□□ 0.56
TRPS1-206ENST00000517323 TACC3Q9Y6A5 838 aa18.52■□□□□ 0.56
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF541Q9H0D2 1346 aa18.52■□□□□ 0.56
TRPS1-206ENST00000517323 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP18.52■□□□□ 0.56
TRPS1-206ENST00000517323 CTDSPL2Q05D32 466 aa18.52■□□□□ 0.56
TRPS1-206ENST00000517323 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
TRPS1-206ENST00000517323 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 CYP2D6P10635 497 aa18.51■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa18.51■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 ZBTB22O15209 634 aa18.51■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 CASTP20810 708 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 TDO2P48775 406 aa18.51■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 CHST3Q7LGC8 479 aa18.51■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa18.51■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 GJA3Q9Y6H8 435 aa18.51■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 DTNBO60941 627 aa18.5■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 CRKP46108 304 aa18.5■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 NEK4P51957 841 aa18.5■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 TICAM2Q86XR7 235 aa18.5■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 TBC1D10CQ8IV04 446 aa18.5■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa18.5■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
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TRPS1-206ENST00000517323 EGFRP00533 1210 aa18.49■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 SLURP2P0DP57 97 aa18.49■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 RHBDL3P58872 404 aa18.49■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 LRRC2Q9BYS8 371 aa18.49■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 NAPBQ9H115 298 aa18.49■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa18.49■□□□□ 0.55
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TRPS1-206ENST00000517323 USP17L8P0C7I0 530 aa18.49■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 GSTO1P78417 241 aa18.49■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 PICALMQ13492 652 aa18.49■□□□□ 0.55
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TRPS1-206ENST00000517323 GAKO14976 1311 aa18.49■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 GPR162Q16538 588 aa18.48■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 TBC1D2Q9BYX2 928 aa18.48■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 LTBP3Q9NS15 1303 aa18.48■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 CIAPIN1Q6FI81 312 aa18.48■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 KCNB2Q92953 911 aa18.48■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 TEKT1Q969V4 418 aa18.48■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 GMLQ99445 158 aa18.48■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 E7EWF7 191 aa18.47■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 NFIAQ12857 509 aa18.47■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 TEX11Q8IYF3 940 aa18.47■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
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TRPS1-206ENST00000517323 USP17L21D6R901 530 aa18.47■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 USP5P45974 858 aa18.47■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa18.47■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 CTR9Q6PD62 1173 aa18.47■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 RNF181Q9P0P0 153 aa18.47■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 NEDD4P46934 1319 aa18.46■□□□□ 0.55
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TRPS1-206ENST00000517323 ZNF213O14771 459 aa18.46■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 LDHCP07864 332 aa18.46■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 CFAP100Q494V2 611 aa18.46■□□□□ 0.55
TRPS1-206ENST00000517323 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
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TRPS1-206ENST00000517323 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
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TRPS1-206ENST00000517323 LMNB1P20700 586 aa18.45■□□□□ 0.54
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TRPS1-206ENST00000517323 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
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TRPS1-206ENST00000517323 CLRN2A0PK11 232 aa18.45■□□□□ 0.54
TRPS1-206ENST00000517323 GNAT2P19087 354 aa18.45■□□□□ 0.54
TRPS1-206ENST00000517323 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
TRPS1-206ENST00000517323 PPP4CP60510 307 aa18.45■□□□□ 0.54
TRPS1-206ENST00000517323 TCP10Q12799 353 aa18.45■□□□□ 0.54
TRPS1-206ENST00000517323 RABEP1Q15276 862 aa18.45■□□□□ 0.54
TRPS1-206ENST00000517323 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
TRPS1-206ENST00000517323 FOXD4L1Q9NU39 408 aa18.45■□□□□ 0.54
TRPS1-206ENST00000517323 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa18.45■□□□□ 0.54
TRPS1-206ENST00000517323 FOCADQ5VW36 1801 aa18.45■□□□□ 0.54
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