RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NCANO14594 1321 aa2.63□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A096LPE4 126 aa2.62□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A1W2PP55 124 aa2.62□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A1W2PPZ6 126 aa2.62□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMPRSS2O15393 492 aa2.62□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FZD6O60353 706 aa2.62□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC24A1O60721 1099 aa2.62□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AOC2O75106 756 aa2.62□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATG7O95352 703 aa2.62□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EDN3P14138 238 aa2.62□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATP2B4P23634 1241 aa2.62□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 POU4F3Q15319 338 aa2.62□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 USPL1Q5W0Q7 1092 aa2.62□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KSR1Q8IVT5 923 aa2.62□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 STK11IPQ8N1F8 1099 aa2.62□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FLAD1Q8NFF5 587 aa2.62□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NETO1Q8TDF5 533 aa2.62□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SNX29Q8TEQ0 813 aa2.62□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 YIPF2Q9BWQ6 316 aa2.62□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF576Q9H609 170 aa2.62□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LRRC10BA6NIK2 292 aa2.61□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BIN1O00499 593 aa2.61□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRRG2O14669 202 aa2.61□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF862O60290 1169 aa2.61□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 B3GALT4O96024 378 aa2.61□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NEFMP07197 916 aa2.61□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CYP27A1Q02318 531 aa2.61□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRKCQQ04759 706 aa2.61□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ECM1Q16610 540 aa2.61□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LILRA6Q6PI73 481 aa2.61□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM214BQ7L5A3 538 aa2.61□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MISP3Q96FF7 219 aa2.61□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KCNK12Q9HB15 430 aa2.61□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa2.61□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DISC1Q9NRI5 854 aa2.61□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCDC87Q9NVE4 849 aa2.61□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C19orf73Q9NVV2 129 aa2.61□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LMCD1Q9NZU5 365 aa2.61□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa2.61□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TSPAN15O95858 294 aa2.6□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CEACAM5P06731 702 aa2.6□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NPR3P17342 541 aa2.6□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LIG1P18858 919 aa2.6□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAAP100Q0VG06 881 aa2.6□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PKN1Q16512 942 aa2.6□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MLANAQ16655 118 aa2.6□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AOC3Q16853 763 aa2.6□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa2.6□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TTLL10Q6ZVT0 673 aa2.6□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UBE3DQ7Z6J8 389 aa2.6□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZSWIM9Q86XI8 627 aa2.6□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GALNT12Q8IXK2 581 aa2.6□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GJD3Q8N144 294 aa2.6□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PI4K2BQ8TCG2 481 aa2.6□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PMEPA1Q969W9 287 aa2.6□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM84AQ96KN4 292 aa2.6□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FANCD2OSQ96PS1 177 aa2.6□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DUSP23Q9BVJ7 150 aa2.6□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TNKS2Q9H2K2 1166 aa2.6□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 VAV3Q9UKW4 847 aa2.6□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CYP11A1P05108 521 aa2.59□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C1QTNF9P0C862 333 aa2.59□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ITIH2P19823 946 aa2.59□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KRTAP10-2P60368 255 aa2.59□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC23A3Q6PIS1 610 aa2.59□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRR23BQ6ZRT6 265 aa2.59□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPACA3Q8IXA5 215 aa2.59□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 STK35Q8TDR2 534 aa2.59□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LIN7BQ9HAP6 207 aa2.59□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ABCB6Q9NP58 842 aa2.59□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RAD18Q9NS91 495 aa2.59□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CTNND2Q9UQB3 1225 aa2.59□□□□□ -1.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 B8ZZF3 427 aa2.58□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ITPKAP23677 461 aa2.58□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NTF4P34130 210 aa2.58□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RAP1GAPP47736 663 aa2.58□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PDE3AQ14432 1141 aa2.58□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TTLL4Q14679 1199 aa2.58□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NKPD1Q17RQ9 610 aa2.58□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CYP27C1Q4G0S4 372 aa2.58□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KIAA0319Q5VV43 1072 aa2.58□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa2.58□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PDZD3Q86UT5 571 aa2.58□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TOP6BLQ8N6T0 577 aa2.58□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ISL2Q96A47 359 aa2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms