RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515835.2

PDE4D-225, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene PDE4D, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-225ENST00000515835 FHOD3Q2V2M9 1422 aa9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-225ENST00000515835 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-225ENST00000515835 SORBS3O60504 671 aa9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-225ENST00000515835 APBA3O96018 575 aa9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-225ENST00000515835 USP17L7P0C7H9 530 aa9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-225ENST00000515835 CD68P34810 354 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-225ENST00000515835 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-225ENST00000515835 GRIK4Q16099 956 aa9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-225ENST00000515835 KLHDC7BQ96G42 594 aa9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-225ENST00000515835 AKAP2Q9Y2D5 859 aa9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-225ENST00000515835 PLEKHD1A6NEE1 506 aa9.73□□□□□ -0.85
PDE4D-225ENST00000515835 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PDE4D-225ENST00000515835 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PDE4D-225ENST00000515835 FAM161BQ96MY7 647 aa9.73□□□□□ -0.85
PDE4D-225ENST00000515835 ABCA9Q8IUA7 1624 aa9.73□□□□□ -0.85
PDE4D-225ENST00000515835 NEO1Q92859 1461 aa9.72□□□□□ -0.85
PDE4D-225ENST00000515835 C9orf172C9J069 976 aa9.72□□□□□ -0.85
PDE4D-225ENST00000515835 HGSNATQ68CP4 663 aa9.72□□□□□ -0.85
PDE4D-225ENST00000515835 TMEM151AQ8N4L1 468 aa9.72□□□□□ -0.85
PDE4D-225ENST00000515835 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PDE4D-225ENST00000515835 ADGRL1O94910 1474 aa9.72□□□□□ -0.85
PDE4D-225ENST00000515835 KRBA1A5PL33 1030 aa9.71□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 GDF11O95390 407 aa9.71□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 SELPP16109 830 aa9.71□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 GSTM4Q03013 218 aa9.71□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 FAAP100Q0VG06 881 aa9.71□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 CEP44Q9C0F1 390 aa9.71□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 PPP2R3AQ06190 1150 aa9.7□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 TMEM39AQ9NV64 488 aa9.7□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 KCNK4Q9NYG8 393 aa9.7□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 VTI1BQ9UEU0 232 aa9.7□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 FMN1Q68DA7 1419 aa9.7□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 ADAM11O75078 769 aa9.69□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 SHISA2Q6UWI4 295 aa9.69□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 CRELD1Q96HD1 420 aa9.69□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 CTSHP09668 335 aa9.68□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 NLRP12P59046 1061 aa9.68□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 AP3B2Q13367 1082 aa9.68□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 TMEM130Q8N3G9 435 aa9.68□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 USP21Q9UK80 565 aa9.68□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 CYP11A1P05108 521 aa9.67□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 TPTE2Q6XPS3 522 aa9.67□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 NRSN2Q9GZP1 204 aa9.67□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 ST13P50502 369 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 ADGRE1Q14246 886 aa9.66□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 DUOXA2Q1HG44 320 aa9.66□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 SV2BQ7L1I2 683 aa9.66□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 CD163Q86VB7 1156 aa9.66□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa9.66□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 USP31Q70CQ4 1352 aa9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 RAPGEF3O95398 923 aa9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 CHRNA4P43681 627 aa9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-225ENST00000515835 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa9.64□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 F8W735 103 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 ENC1O14682 589 aa9.64□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 FBXO24O75426 580 aa9.64□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 WISP1O95388 367 aa9.64□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 VAMP1P23763 118 aa9.64□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 MBTPS1Q14703 1052 aa9.64□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 POU4F3Q15319 338 aa9.64□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 MEI1Q5TIA1 1274 aa9.64□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa9.64□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 ACAD11Q709F0 780 aa9.64□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 UBASH3BQ8TF42 649 aa9.64□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 USP26Q9BXU7 913 aa9.64□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 AKTIPQ9H8T0 292 aa9.64□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP9.64□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 FANCAO15360 1455 aa9.64□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 AKNAQ7Z591 1439 aa9.64□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 NME2P22392 152 aa9.63□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 MAOBP27338 520 aa9.63□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa9.63□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 CORO1BQ9BR76 489 aa9.63□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 SAMM50Q9Y512 469 aa9.63□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 PLCH2O75038 1416 aa9.63□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 CFAP74Q9C0B2 1584 aa9.63□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 MEGF11A6BM72 1044 aa9.62□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 SULF2Q8IWU5 870 aa9.62□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 WFDC12Q8WWY7 111 aa9.62□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
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