RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	FSD1	Q9BTV5	496 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	TRIM5	Q9C035	493 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	COPRS	Q9NQ92	184 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	SLIT3	O75094	1523 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	NEDD4	P46934	1319 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	TSPOAP1	O95153	1857 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	USP27X	A6NNY8	438 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	KCNA6	P17658	529 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	MMP16	P51512	607 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	ARID5B	Q14865	1188 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	CEP135	Q66GS9	1140 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	KIF18A	Q8NI77	898 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	NEK1	Q96PY6	1258 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	HAUS7	Q99871	368 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	CFAP45	Q9UL16	551 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746		A0A1W2PQ27	194 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746		A0A1W2PQ64	194 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746		A0A1W2PQD8	194 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC69	A6NI79	296 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	CYP21A2	P08686	494 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	SLFN14	P0C7P3	912 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	KCNJ6	P48051	423 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	SCRN1	Q12765	414 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	STK3	Q13188	491 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	GCKR	Q14397	625 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	TNNI3K	Q59H18	835 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746		Q6ZUG5	572 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	NBPF11	Q86T75	865 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	DRC7	Q8IY82	874 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	FBXL16	Q8N461	479 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	BICD2	Q8TD16	824 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	ANO10	Q9NW15	660 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	USP16	Q9Y5T5	823 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	MST1R	Q04912	1400 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	PALLD	Q8WX93	1383 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746		H3BQV1	296 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	SOCS7	O14512	581 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	S1PR4	O95977	384 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	CHGB	P05060	677 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	SKIL	P12757	684 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	CASP7	P55210	303 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	EVC	P57679	992 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	GSDMD	P57764	484 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	TFCP2	Q12800	502 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	PTPRN	Q16849	979 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC93	Q567U6	631 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	IFFO2	Q5TF58	517 aa		5.8	□□□□□ -1.48

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