RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512299.5

PAQR3-208, Transcript of progestin and adipoQ receptor family member 3, human

TSL 4

Gene PAQR3, Length 597 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAQR3-208	ENST00000512299	BRF1	Q92994	677 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	TMEM87B	Q96K49	555 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	NAPB	Q9H115	298 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	MMP10	P09238	476 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	CYP7A1	P22680	504 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	ATP2B4	P23634	1241 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	NT5C2	P49902	561 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	KRT23	Q9C075	422 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	MTMR6	Q9Y217	621 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299		A0A1B0GUL6	1792 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	PRC1	O43663	620 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	DPEP1	P16444	411 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	KCNA3	P22001	575 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	ABHD8	Q96I13	439 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	RAI14	Q9P0K7	980 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	RNF181	Q9P0P0	153 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	COL4A1	P02462	1669 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	RGS19	P49795	217 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	HAND2	P61296	217 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	SCRN1	Q12765	414 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	CERS3	Q8IU89	383 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	ARMT1	Q9H993	441 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	ABCF2	Q9UG63	623 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PAQR3-208	ENST00000512299	FSD2	A1L4K1	749 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	TDO2	P48775	406 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	GSTO1	P78417	241 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	DDR1	Q08345	913 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	APOBR	Q0VD83	1088 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	TMTC2	Q8N394	836 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	LIFR	P42702	1097 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	RCAN1	P53805	252 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	STK3	Q13188	491 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	ATL3	Q6DD88	541 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	SP8	Q8IXZ3	490 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	LCORL	Q8N3X6	602 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	NBPF3	Q9H094	633 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	GGA1	Q9UJY5	639 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	CDKL5	O76039	1030 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	LDHC	P07864	332 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	PDE6B	P35913	854 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	ANTXR2	P58335	489 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	ZNF445	P59923	1031 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	CREBZF	Q9NS37	354 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PAQR3-208	ENST00000512299	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55

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