RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506510.6

PDE4D-215, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4

Gene PDE4D, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-215ENST00000506510 KCNB2Q92953 911 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 FRMD6Q96NE9 622 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF862O60290 1169 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 CELA3AP09093 270 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 RAB6AP20340 208 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 NME2P22392 152 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 CEP44Q9C0F1 390 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 CBX8Q9HC52 389 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 FAM105AQ9NUU6 356 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
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PDE4D-215ENST00000506510 TMPRSS2O15393 492 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 GSC2O15499 205 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 ARNTP27540 789 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 FGD1P98174 961 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 RNF43Q68DV7 783 aa8.33□□□□□ -1.08
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PDE4D-215ENST00000506510 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 PARP2Q9UGN5 583 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 NFKBIBQ15653 356 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 FAM161BQ96MY7 647 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 DBNDD2Q9BQY9 259 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 YIPF2Q9BWQ6 316 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 KRT82Q9NSB4 513 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 AK5Q9Y6K8 562 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 ASPAP45381 313 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 Q8N3U1 123 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 MFSD14AQ96MC6 490 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 RNF112Q9ULX5 631 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 ZBTB7CA1YPR0 619 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 TGFB1P01137 390 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 NFICP08651 508 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 BMP6P22004 513 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 ID3Q02535 119 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 PSMD2Q13200 908 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 RASIP1Q5U651 963 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 PAOXQ6QHF9 649 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 SLC51AQ86UW1 340 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 SHKBP1Q8TBC3 707 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 GPBAR1Q8TDU6 330 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 ANKRD24Q8TF21 1146 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 ACSBG1Q96GR2 724 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 SAMM50Q9Y512 469 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 SLFN14P0C7P3 912 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 DAB2P98082 770 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.084e-6■□□□□ 11.2
PDE4D-215ENST00000506510 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 PCNX4Q63HM2 1172 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 FBXL6Q8N531 539 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 FANCD2OSQ96PS1 177 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 SEMA6CQ9H3T2 930 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 ACSS3Q9H6R3 686 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 CRIM1Q9NZV1 1036 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 ERCC3P19447 782 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 MEI1Q5TIA1 1274 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 LLGL2Q6P1M3 1020 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 SHISA5Q8N114 240 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 LGR6Q9HBX8 967 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-215ENST00000506510 WDR64B1ANS9 1081 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-215ENST00000506510 MAP7Q14244 749 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-215ENST00000506510 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-215ENST00000506510 TMCO4Q5TGY1 634 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-215ENST00000506510 TMC4Q7Z404 712 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-215ENST00000506510 ATXN3LQ9H3M9 355 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-215ENST00000506510 PIDD1Q9HB75 910 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-215ENST00000506510 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-215ENST00000506510 F13BP05160 661 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-215ENST00000506510 ADMP35318 185 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-215ENST00000506510 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-215ENST00000506510 LRP8Q14114 963 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-215ENST00000506510 SV2BQ7L1I2 683 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-215ENST00000506510 TBC1D32Q96NH3 1257 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-215ENST00000506510 DISC1Q9NRI5 854 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-215ENST00000506510 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-215ENST00000506510 PRR19A6NJB7 356 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-215ENST00000506510 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-215ENST00000506510 TRIM37O94972 964 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-215ENST00000506510 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-215ENST00000506510 SSTR4P31391 388 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-215ENST00000506510 TTLL4Q14679 1199 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-215ENST00000506510 LRRC14Q15048 493 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-215ENST00000506510 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-215ENST00000506510 ARTNQ5T4W7 220 aa8.25□□□□□ -1.09
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