RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506453.1

GRSF1-205, Transcript of G-rich RNA sequence binding factor 1, human

TSL 3

Gene GRSF1, Length 925 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRSF1-205	ENST00000506453	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRSF1-205	ENST00000506453	RUNDC1	Q96C34	613 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRSF1-205	ENST00000506453	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRSF1-205	ENST00000506453	GREM2	Q9H772	168 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRSF1-205	ENST00000506453	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GRSF1-205	ENST00000506453	CD209	Q9NNX6	404 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRSF1-205	ENST00000506453	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRSF1-205	ENST00000506453	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	DLL1	O00548	723 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	IL1R1	P14778	569 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	RALBP1	Q15311	655 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	FBXW7	Q969H0	707 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	OPTN	Q96CV9	577 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	MBIP	Q9NS73	344 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	FZD1	Q9UP38	647 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453		H7C1W4	665 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	TLR2	O60603	784 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	IGKV5-2	P06315	115 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	CSF1R	P07333	972 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	RASA3	Q14644	834 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	KSR2	Q6VAB6	950 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	CERS5	Q8N5B7	392 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	CEP290	O15078	2479 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	KIF22	Q14807	665 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	CFAP100	Q494V2	611 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	NBPF3	Q9H094	633 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	IFT57	Q9NWB7	429 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	GJA8	P48165	433 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	GNAI1	P63096	354 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	NEUROD2	Q15784	382 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	11.11	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	TEPSIN	Q96N21	525 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	MYH3	P11055	1940 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	GJB1	P08034	283 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	CETP	P11597	493 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	ITGA6	P23229	1130 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	KLRK1	P26718	216 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	CHRND	Q07001	517 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	CCL15	Q16663	113 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	DDX12P	Q92771	950 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	SHISA4	Q96DD7	197 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	ELP3	Q9H9T3	547 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	CLRN2	A0PK11	232 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	HOXD10	P28358	340 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	KCNJ4	P48050	445 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	VGLL4	Q14135	290 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	DPF3	Q92784	378 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	VEZT	Q9HBM0	779 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	CSAD	Q9Y600	493 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GRSF1-205	ENST00000506453	BCAM	P50895	628 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GRSF1-205	ENST00000506453	CASP7	P55210	303 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GRSF1-205	ENST00000506453	C17orf99	Q6UX52	265 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GRSF1-205	ENST00000506453	ERO1B	Q86YB8	467 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GRSF1-205	ENST00000506453	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
GRSF1-205	ENST00000506453	SRRD	Q9UH36	339 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GRSF1-205	ENST00000506453	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GRSF1-205	ENST00000506453	OTOF	Q9HC10	1997 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GRSF1-205	ENST00000506453	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
GRSF1-205	ENST00000506453	TNNI2	P48788	182 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GRSF1-205	ENST00000506453	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
GRSF1-205	ENST00000506453	SNAPC2	Q13487	334 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GRSF1-205	ENST00000506453	GCKR	Q14397	625 aa		11.07	□□□□□ -0.64

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