RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498524.5

ANKRD28-213, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,289 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-213ENST00000498524 LIG1P18858 919 aa4.59□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF445P59923 1031 aa4.59□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 PRKG1Q13976 671 aa4.59□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 CCDC158Q5M9N0 1113 aa4.59□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 LRSAM1Q6UWE0 723 aa4.59□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 PPP1R9BQ96SB3 815 aa4.59□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 MSRAQ9UJ68 235 aa4.59□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 CREB3O43889 395 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 CCL15Q16663 113 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 AOC3Q16853 763 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 SMYD5Q6GMV2 418 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 SMC3Q9UQE7 1217 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 A1BGP04217 495 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 USP14P54578 494 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 IKQ13123 557 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 TTC22Q5TAA0 569 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 TBC1D9BQ66K14 1250 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 ANKRD23Q86SG2 305 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 CCDC155Q8N6L0 562 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 CXorf38Q8TB03 319 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 UBXN4Q92575 508 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 PRIMPOLQ96LW4 560 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 SGIP1Q9BQI5 828 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 KIF3AQ9Y496 699 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 RAD50Q92878 1312 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 QRICH2Q9H0J4 1663 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 TM4SF1P30408 202 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF697Q5TEC3 545 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 CREBRFQ8IUR6 639 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 RUFY2Q8WXA3 655 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 MTA3Q9BTC8 594 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 IGBP1P78318 339 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 STRIP1Q5VSL9 837 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 GADL1Q6ZQY3 521 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 MYD88Q99836 296 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 SPOCK3Q9BQ16 436 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 NALCNQ8IZF0 1738 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 ZMYND10O75800 440 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 GNAI3P08754 354 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 NBPF9Q3BBW0 867 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 ERO1BQ86YB8 467 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 XAGE3Q8WTP9 111 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 CDCA5Q96FF9 252 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 RNF208Q9H0X6 261 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 A0A1W2PPC1 479 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC4A2P04920 1241 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 SRGAP2BP0DMP2 458 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 SSR1P43307 286 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 SLIT3O75094 1523 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 CCT4P50991 539 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 ATP2B2Q01814 1243 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 SCARF1Q14162 830 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 UVSSAQ2YD98 709 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 SOCS4Q8WXH5 440 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP4.57□□□□□ -1.687e-7■■■■□ 20.5
ANKRD28-213ENST00000498524 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 GNAI2P04899 355 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 CCDC192P0DO97 292 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 TCF3P15923 654 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 CNGA1P29973 690 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 CXCL9Q07325 125 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 CCDC183Q5T5S1 534 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 FAM205AQ6ZU69 1335 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 KCPQ6ZWJ8 1503 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 TTC6Q86TZ1 520 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 GAS2L3Q86XJ1 694 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 DENND2AQ9ULE3 1009 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 CNPY2Q9Y2B0 182 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-213ENST00000498524 STK25O00506 426 aa4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.7 ms