RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491292.5

ERCC3-208, Transcript of ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit, human

TSL 2

Gene ERCC3, Length 4,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC3-208	ENST00000491292	LIG3	P49916	1009 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	ATL3	Q6DD88	541 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	DEPDC5	O75140	1603 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	YEATS4	O95619	227 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	CASP1	P29466	404 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	VSTM4	Q8IW00	320 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	RABGGTA	Q92696	567 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	KIF28P	B7ZC32	967 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	ZBTB43	O43298	467 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	CMA1	P23946	247 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC35F6	Q8N357	371 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	PSMB7	Q99436	277 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292		A0A1W2PQ27	194 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292		A0A1W2PQ64	194 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292		A0A1W2PQD8	194 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292		H3BQF6	201 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	ZEB2	O60315	1214 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	PI16	Q6UXB8	463 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	KIAA0754	O94854	1291 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	LRRC24	Q50LG9	513 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	TSPOAP1	O95153	1857 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	ATP2C2	O75185	946 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	IGKV5-2	P06315	115 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	CABP4	P57796	275 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	AIDA	Q96BJ3	306 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	BTBD18	B2RXH4	712 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	FGA	P02671	866 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	POSTN	Q15063	836 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	METTL24	Q5JXM2	366 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	POTEB2	H3BUK9	544 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	TDO2	P48775	406 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	EXOC4	Q96A65	974 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	CABP5	Q9NP86	173 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292		M0R2C6	588 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	TEX33	O43247	280 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	CASP14	P31944	242 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	RBL2	Q08999	1139 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	BRD3	Q15059	726 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	CCDC181	Q5TID7	509 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	HAUS7	Q99871	368 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	POLD4	Q9HCU8	107 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	INCENP	Q9NQS7	918 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	SHTN1	A0MZ66	631 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	11.17	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC39A14	Q15043	492 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	PLIN2	Q99541	437 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	USP32	Q8NFA0	1604 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	CCDC151	A5D8V7	595 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	PDE4B	Q07343	736 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	SRL	Q86TD4	932 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	OSBP2	Q969R2	916 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	11.16	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	NAPB	Q9H115	298 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERCC3-208	ENST00000491292	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		11.16	□□□□□ -0.62

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