RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 SSH3Q8TE77 659 aa19.28■□□□□ 0.68
NISCH-213ENST00000489895 CCDC113Q9H0I3 377 aa19.28■□□□□ 0.68
NISCH-213ENST00000489895 UGGT1Q9NYU2 1555 aa19.28■□□□□ 0.68
NISCH-213ENST00000489895 METP08581 1390 aa19.27■□□□□ 0.68
NISCH-213ENST00000489895 CCDC65Q8IXS2 484 aa19.27■□□□□ 0.68
NISCH-213ENST00000489895 LARGE2Q8N3Y3 721 aa19.27■□□□□ 0.68
NISCH-213ENST00000489895 LMBR1Q8WVP7 490 aa19.27■□□□□ 0.68
NISCH-213ENST00000489895 SYNCQ9H7C4 482 aa19.27■□□□□ 0.68
NISCH-213ENST00000489895 SV2BQ7L1I2 683 aa19.27■□□□□ 0.68
NISCH-213ENST00000489895 TMOD4Q9NZQ9 345 aa19.27■□□□□ 0.68
NISCH-213ENST00000489895 SPECC1Q5M775 1068 aa19.27■□□□□ 0.68
NISCH-213ENST00000489895 FAM227BQ96M60 508 aa19.27■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 FAM160A1Q05DH4 1040 aa19.26■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 KIAA0753Q2KHM9 967 aa19.26■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 CCDC186Q7Z3E2 898 aa19.26■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 SELENOOQ9BVL4 669 aa19.26■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 BAG6P46379 1132 aa19.26■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 GJA3Q9Y6H8 435 aa19.26■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 CARD10Q9BWT7 1032 aa19.26■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 TACC1O75410 805 aa19.25■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 LETM2Q2VYF4 491 aa19.25■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 HS1BP3Q53T59 392 aa19.25■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP19.25■□□□□ 0.676e-7■■□□□ 14
NISCH-213ENST00000489895 APBA3O96018 575 aa19.25■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 ZAP70P43403 619 aa19.25■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 GPCPD1Q9NPB8 672 aa19.25■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 ZNF532Q9HCE3 1301 aa19.25■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 KIF4AO95239 1232 aa19.25■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 SEC24BO95487 1268 aa19.25■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 TM6SF1Q9BZW5 370 aa19.25■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 CLASP1Q7Z460 1538 aa19.25■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 HAUS3Q68CZ6 603 aa19.25■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 USP44Q9H0E7 712 aa19.25■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP19.24■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 NEK11Q8NG66 645 aa19.24■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 BACH1O14867 736 aa19.24■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 CCDC175P0C221 793 aa19.24■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 ANO1Q5XXA6 986 aa19.24■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 ARHGEF25Q86VW2 580 aa19.24■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 VTI1AQ96AJ9 217 aa19.24■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 V9GY48 417 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 VWA3AA6NCI4 1184 aa19.24■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 TMX1Q9H3N1 280 aa19.24■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 TUBB4BP68371 445 aa19.23■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 ZNF174Q15697 407 aa19.23■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 KRT86O43790 486 aa19.23■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 CPA1P15085 419 aa19.23■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 SPDYE4A6NLX3 237 aa19.23■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 HECW2Q9P2P5 1572 aa19.23■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 KRT25Q7Z3Z0 450 aa19.23■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 CCDC42Q96M95 316 aa19.23■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 TTC37Q6PGP7 1564 aa19.22■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 MRVI1Q9Y6F6 885 aa19.22■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 ERVK-7P63135 1459 aa19.22■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 PREX2Q70Z35 1606 aa19.22■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP19.22■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 KIF5AQ12840 1032 aa19.22■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP19.22■□□□□ 0.671e-6■■□□□ 14
NISCH-213ENST00000489895 LRRC45Q96CN5 670 aa19.22■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 DYNC1I1O14576 645 aa19.22■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 HSPA4P34932 840 aa19.22■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 MSANTD4Q8NCY6 345 aa19.22■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 IGSF1Q8N6C5 1336 aa19.22■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 UBXN1Q04323 297 aa19.22■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa19.22■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 BEND3Q5T5X7 828 aa19.22■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 NIM1KQ8IY84 436 aa19.22■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 SYNMO15061 1565 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 FSD2A1L4K1 749 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 CUTAO60888 179 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 ATP2B4P23634 1241 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 MYL5Q02045 173 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 SLC1A4P43007 532 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 WWC3Q9ULE0 1092 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 SSH2Q76I76 1423 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 CTAGE15A4D2H0 777 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 CTAGE8P0CG41 777 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 CTAGE6Q86UF2 777 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 CTAGE4Q8IX94 777 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 USP6P35125 1406 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-213ENST00000489895 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
NISCH-213ENST00000489895 KCNQ3O43525 872 aa19.2■□□□□ 0.66
NISCH-213ENST00000489895 AKNAD1Q5T1N1 836 aa19.2■□□□□ 0.66
NISCH-213ENST00000489895 PRDM1O75626 825 aa19.2■□□□□ 0.66
NISCH-213ENST00000489895 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP19.2■□□□□ 0.66
NISCH-213ENST00000489895 CNNM4Q6P4Q7 775 aa19.2■□□□□ 0.66
NISCH-213ENST00000489895 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa19.2■□□□□ 0.66
NISCH-213ENST00000489895 PLEKHF1Q96S99 279 aa19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.2 ms