RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486889.1

CTPS1-210, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTPS1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-210ENST00000486889 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 CERS5Q8N5B7 392 aa11.68□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 GMLQ99445 158 aa11.68□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 USP40Q9NVE5 1235 aa11.68□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 CTNNA3Q9UI47 895 aa11.68□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 MAST2Q6P0Q8 1798 aa11.67□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 GAKO14976 1311 aa11.67□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 AKAP11Q9UKA4 1901 aa11.67□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa11.67□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 MCCP23508 829 aa11.67□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 CHMLP26374 656 aa11.67□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 EPHX2P34913 555 aa11.67□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 PPP4CP60510 307 aa11.67□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa11.67□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 TEX11Q8IYF3 940 aa11.67□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 MXD3Q9BW11 206 aa11.67□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 TRIM34Q9BYJ4 488 aa11.67□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF287Q9HBT7 754 aa11.67□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa11.67□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP11.67□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 CLEC11AQ9Y240 323 aa11.67□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 SPDYE2BA6NHP3 402 aa11.66□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 SPDYE6P0CI01 402 aa11.66□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 NF2P35240 595 aa11.66□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 DIXDC1Q155Q3 683 aa11.66□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 RNF20Q5VTR2 975 aa11.66□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 FKBP1CQ5VVH2 108 aa11.66□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 GIMAP6Q6P9H5 292 aa11.66□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 SULF1Q8IWU6 871 aa11.66□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 MIGA1Q8NAN2 632 aa11.66□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 TAOK2Q9UL54 1235 aa11.66□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa11.66□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa11.66□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa11.66□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 COL4A5P29400 1685 aa11.65□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 CCDC171Q6TFL3 1326 aa11.65□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 GPAA1O43292 621 aa11.65□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 MBD4O95243 580 aa11.65□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 HLA-DOAP06340 250 aa11.65□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 TDO2P48775 406 aa11.65□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 TTC6Q86TZ1 520 aa11.65□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 VEZTQ9HBM0 779 aa11.65□□□□□ -0.54
CTPS1-210ENST00000486889 SCN4AP35499 1836 aa11.65□□□□□ -0.55
CTPS1-210ENST00000486889 DOCK2Q92608 1830 aa11.65□□□□□ -0.55
CTPS1-210ENST00000486889 MYH7P12883 1935 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-210ENST00000486889 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-210ENST00000486889 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-210ENST00000486889 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-210ENST00000486889 WNT10BO00744 389 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-210ENST00000486889 ENTPD3O75355 529 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-210ENST00000486889 EPS15P42566 896 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-210ENST00000486889 SAMD7Q7Z3H4 446 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-210ENST00000486889 NAPBQ9H115 298 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-210ENST00000486889 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-210ENST00000486889 ANO2Q9NQ90 1003 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-210ENST00000486889 SCN9AQ15858 1988 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-210ENST00000486889 MYH2Q9UKX2 1941 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-210ENST00000486889 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-210ENST00000486889 ATXN8OSP0DMR3 200 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-210ENST00000486889 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-210ENST00000486889 NT5C2P49902 561 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-210ENST00000486889 FSTL1Q12841 308 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-210ENST00000486889 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-210ENST00000486889 SPDYE2Q495Y8 402 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-210ENST00000486889 FAM83AQ86UY5 434 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-210ENST00000486889 LDHDQ86WU2 507 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-210ENST00000486889 SKAP1Q86WV1 359 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-210ENST00000486889 SMC1BQ8NDV3 1235 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-210ENST00000486889 OSBP2Q969R2 916 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-210ENST00000486889 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-210ENST00000486889 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-210ENST00000486889 DSCC1Q9BVC3 393 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-210ENST00000486889 IDI2Q9BXS1 227 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-210ENST00000486889 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-210ENST00000486889 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-210ENST00000486889 ARMT1Q9H993 441 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-210ENST00000486889 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-210ENST00000486889 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-210ENST00000486889 WDR90Q96KV7 1748 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-210ENST00000486889 SGSM2O43147 1006 aa11.62□□□□□ -0.55
CTPS1-210ENST00000486889 PICALMQ13492 652 aa11.62□□□□□ -0.55
CTPS1-210ENST00000486889 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
CTPS1-210ENST00000486889 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
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