RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486042.1

PHC3-211, Transcript of polyhomeotic homolog 3, humanhuman

TSL 3

Gene PHC3, Length 680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC3-211ENST00000486042 C1QL4Q86Z23 238 aa6.96□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 SNX29Q8TEQ0 813 aa6.96□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa6.96□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 B8ZZF3 427 aa6.95□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 ZNF423Q2M1K9 1284 aa6.95□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 SLC23A3Q6PIS1 610 aa6.95□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 ZSWIM9Q86XI8 627 aa6.95□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 CORO1BQ9BR76 489 aa6.95□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 EHHADHQ08426 723 aa6.94□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 AOC3Q16853 763 aa6.94□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.94□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 HELQQ8TDG4 1101 aa6.94□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 HRASLS5Q96KN8 279 aa6.94□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 SEPT3Q9UH03 358 aa6.94□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 TMEM265A0A087WTH1 108 aa6.93□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 A0A096LPE4 126 aa6.93□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 A0A1W2PPZ6 126 aa6.93□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.93□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 METTL12A8MUP2 240 aa6.93□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 AOC2O75106 756 aa6.93□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 FAM87AP0C7U9 286 aa6.93□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 MLANAQ16655 118 aa6.93□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 TMEM164Q5U3C3 297 aa6.93□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 ANKLE2Q86XL3 938 aa6.93□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 FAM181AQ8N9Y4 354 aa6.93□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 LGR6Q9HBX8 967 aa6.93□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa6.93□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 ATG7O95352 703 aa6.92□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 CD96P40200 585 aa6.92□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 KCNMB1Q16558 191 aa6.92□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 ALKBH2Q6NS38 261 aa6.92□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 CCNJLQ8IV13 435 aa6.92□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.92□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 LATS2Q9NRM7 1088 aa6.92□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 TTLL10Q6ZVT0 673 aa6.91□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 WDR18Q9BV38 432 aa6.91□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.91□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 CRIM1Q9NZV1 1036 aa6.91□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa6.91□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 USP5P45974 858 aa6.9□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 OXCT1P55809 520 aa6.9□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 CDK5R2Q13319 367 aa6.9□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 POLIQ9UNA4 740 aa6.9□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 SNX11Q9Y5W9 270 aa6.9□□□□□ -1.3
PHC3-211ENST00000486042 ECEL1O95672 775 aa6.89□□□□□ -1.31
PHC3-211ENST00000486042 B3GALT4O96024 378 aa6.89□□□□□ -1.31
PHC3-211ENST00000486042 CEACAM5P06731 702 aa6.89□□□□□ -1.31
PHC3-211ENST00000486042 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa6.89□□□□□ -1.31
PHC3-211ENST00000486042 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa6.89□□□□□ -1.31
PHC3-211ENST00000486042 ATP2B4P23634 1241 aa6.88□□□□□ -1.31
PHC3-211ENST00000486042 GRIA4P48058 902 aa6.88□□□□□ -1.31
PHC3-211ENST00000486042 AMIGO3Q86WK7 504 aa6.88□□□□□ -1.31
PHC3-211ENST00000486042 ATXN3LQ9H3M9 355 aa6.88□□□□□ -1.31
PHC3-211ENST00000486042 PIDD1Q9HB75 910 aa6.88□□□□□ -1.31
PHC3-211ENST00000486042 LMCD1Q9NZU5 365 aa6.88□□□□□ -1.31
PHC3-211ENST00000486042 PLAGL2Q9UPG8 496 aa6.88□□□□□ -1.31
PHC3-211ENST00000486042 U3KQE9 123 aa6.88□□□□□ -1.31
PHC3-211ENST00000486042 TMPRSS2O15393 492 aa6.87□□□□□ -1.31
PHC3-211ENST00000486042 PDE3AQ14432 1141 aa6.87□□□□□ -1.31
PHC3-211ENST00000486042 SPRED3Q2MJR0 410 aa6.87□□□□□ -1.31
PHC3-211ENST00000486042 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PHC3-211ENST00000486042 TCF12Q99081 682 aa6.87□□□□□ -1.31
PHC3-211ENST00000486042 TNKS2Q9H2K2 1166 aa6.87□□□□□ -1.31
PHC3-211ENST00000486042 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PHC3-211ENST00000486042 SLFN14P0C7P3 912 aa6.86□□□□□ -1.31
PHC3-211ENST00000486042 MPSTP25325 297 aa6.86□□□□□ -1.31
PHC3-211ENST00000486042 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PHC3-211ENST00000486042 AFMP43652 599 aa6.86□□□□□ -1.31
PHC3-211ENST00000486042 AP3B2Q13367 1082 aa6.86□□□□□ -1.31
PHC3-211ENST00000486042 ECM1Q16610 540 aa6.86□□□□□ -1.31
PHC3-211ENST00000486042 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PHC3-211ENST00000486042 ASB11Q8WXH4 323 aa6.86□□□□□ -1.31
PHC3-211ENST00000486042 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PHC3-211ENST00000486042 DUSP23Q9BVJ7 150 aa6.86□□□□□ -1.31
PHC3-211ENST00000486042 LIN7BQ9HAP6 207 aa6.86□□□□□ -1.31
PHC3-211ENST00000486042 SLAIN2Q9P270 581 aa6.86□□□□□ -1.31
PHC3-211ENST00000486042 A0A1W2PP55 124 aa6.85□□□□□ -1.31
PHC3-211ENST00000486042 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.85□□□□□ -1.31
PHC3-211ENST00000486042 C1orf115Q9H7X2 142 aa6.85□□□□□ -1.31
PHC3-211ENST00000486042 CTNND2Q9UQB3 1225 aa6.85□□□□□ -1.31
PHC3-211ENST00000486042 ARID3CA6NKF2 412 aa6.84□□□□□ -1.31
PHC3-211ENST00000486042 LEFTY1O75610 366 aa6.84□□□□□ -1.31
PHC3-211ENST00000486042 GLI1P08151 1106 aa6.84□□□□□ -1.31
PHC3-211ENST00000486042 ID3Q02535 119 aa6.84□□□□□ -1.31
PHC3-211ENST00000486042 GALNT12Q8IXK2 581 aa6.84□□□□□ -1.31
PHC3-211ENST00000486042 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa6.84□□□□□ -1.31
PHC3-211ENST00000486042 NFIBO00712 420 aa6.83□□□□□ -1.32
PHC3-211ENST00000486042 KRT1P04264 644 aa6.83□□□□□ -1.32
PHC3-211ENST00000486042 C1QTNF9P0C862 333 aa6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 239.1 ms