RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484908.1

ATP6AP1-208, Transcript of ATPase H+ transporting accessory protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene ATP6AP1, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1-208ENST00000484908 BRI3BPQ8WY22 251 aa22.27■■□□□ 1.16
ATP6AP1-208ENST00000484908 OTUD5Q96G74 571 aa22.27■■□□□ 1.16
ATP6AP1-208ENST00000484908 WRNIP1Q96S55 665 aa22.27■■□□□ 1.16
ATP6AP1-208ENST00000484908 TRIM17Q9Y577 477 aa22.27■■□□□ 1.16
ATP6AP1-208ENST00000484908 MYH2Q9UKX2 1941 aa22.26■■□□□ 1.15
ATP6AP1-208ENST00000484908 MTX1Q13505 466 aa22.26■■□□□ 1.15
ATP6AP1-208ENST00000484908 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.26■■□□□ 1.15
ATP6AP1-208ENST00000484908 OTOP1Q7RTM1 612 aa22.26■■□□□ 1.15
ATP6AP1-208ENST00000484908 ERO1BQ86YB8 467 aa22.26■■□□□ 1.15
ATP6AP1-208ENST00000484908 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa22.26■■□□□ 1.15
ATP6AP1-208ENST00000484908 SRGAP3O43295 1099 aa22.25■■□□□ 1.15
ATP6AP1-208ENST00000484908 ADORA1P30542 326 aa22.25■■□□□ 1.15
ATP6AP1-208ENST00000484908 CCDC102BQ68D86 513 aa22.25■■□□□ 1.15
ATP6AP1-208ENST00000484908 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
ATP6AP1-208ENST00000484908 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.25■■□□□ 1.15
ATP6AP1-208ENST00000484908 SP3Q02447 781 aa22.24■■□□□ 1.15
ATP6AP1-208ENST00000484908 CD99L2Q8TCZ2 262 aa22.24■■□□□ 1.15
ATP6AP1-208ENST00000484908 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
ATP6AP1-208ENST00000484908 TRIM27P14373 513 aa22.23■■□□□ 1.15
ATP6AP1-208ENST00000484908 TIMM10P62072 90 aa22.23■■□□□ 1.15
ATP6AP1-208ENST00000484908 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
ATP6AP1-208ENST00000484908 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.23■■□□□ 1.15
ATP6AP1-208ENST00000484908 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa22.23■■□□□ 1.15
ATP6AP1-208ENST00000484908 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.23■■□□□ 1.15
ATP6AP1-208ENST00000484908 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
ATP6AP1-208ENST00000484908 CETPP11597 493 aa22.22■■□□□ 1.15
ATP6AP1-208ENST00000484908 NFIAQ12857 509 aa22.22■■□□□ 1.15
ATP6AP1-208ENST00000484908 PPIL2Q13356 520 aa22.22■■□□□ 1.15
ATP6AP1-208ENST00000484908 MIGA2Q7L4E1 593 aa22.22■■□□□ 1.15
ATP6AP1-208ENST00000484908 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.22■■□□□ 1.15
ATP6AP1-208ENST00000484908 EFCC1Q9HA90 598 aa22.22■■□□□ 1.15
ATP6AP1-208ENST00000484908 USP40Q9NVE5 1235 aa22.22■■□□□ 1.15
ATP6AP1-208ENST00000484908 A0A1B0GUL7 405 aa22.21■■□□□ 1.15
ATP6AP1-208ENST00000484908 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
ATP6AP1-208ENST00000484908 BCAR3O75815 825 aa22.21■■□□□ 1.15
ATP6AP1-208ENST00000484908 GNAI2P04899 355 aa22.21■■□□□ 1.15
ATP6AP1-208ENST00000484908 TCP10Q12799 353 aa22.21■■□□□ 1.15
ATP6AP1-208ENST00000484908 TFCP2Q12800 502 aa22.21■■□□□ 1.15
ATP6AP1-208ENST00000484908 SNAPC2Q13487 334 aa22.21■■□□□ 1.15
ATP6AP1-208ENST00000484908 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
ATP6AP1-208ENST00000484908 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
ATP6AP1-208ENST00000484908 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.21■■□□□ 1.15
ATP6AP1-208ENST00000484908 IRF6O14896 467 aa22.2■■□□□ 1.14
ATP6AP1-208ENST00000484908 PPATQ06203 517 aa22.2■■□□□ 1.14
ATP6AP1-208ENST00000484908 RASGRF1Q13972 1273 aa22.2■■□□□ 1.14
ATP6AP1-208ENST00000484908 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
ATP6AP1-208ENST00000484908 XAGE2Q96GT9 111 aa22.2■■□□□ 1.14
ATP6AP1-208ENST00000484908 FAM198AQ9UFP1 575 aa22.2■■□□□ 1.14
ATP6AP1-208ENST00000484908 ZNF112Q9UJU3 913 aa22.2■■□□□ 1.14
ATP6AP1-208ENST00000484908 INPP5BP32019 993 aa22.19■■□□□ 1.14
ATP6AP1-208ENST00000484908 ARHGEF6Q15052 776 aa22.19■■□□□ 1.14
ATP6AP1-208ENST00000484908 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
ATP6AP1-208ENST00000484908 SLF2Q8IX21 1173 aa22.19■■□□□ 1.14
ATP6AP1-208ENST00000484908 ABCF2Q9UG63 623 aa22.19■■□□□ 1.14
ATP6AP1-208ENST00000484908 TNNQ9UQP3 1299 aa22.19■■□□□ 1.14
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ATP6AP1-208ENST00000484908 IDI2Q9BXS1 227 aa22.18■■□□□ 1.14
ATP6AP1-208ENST00000484908 BTBD19C9JJ37 291 aa22.17■■□□□ 1.14
ATP6AP1-208ENST00000484908 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
ATP6AP1-208ENST00000484908 HTTP42858 3142 aa22.17■■□□□ 1.14
ATP6AP1-208ENST00000484908 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
ATP6AP1-208ENST00000484908 ENTPD3O75355 529 aa22.16■■□□□ 1.14
ATP6AP1-208ENST00000484908 CAP1Q01518 475 aa22.16■■□□□ 1.14
ATP6AP1-208ENST00000484908 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
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ATP6AP1-208ENST00000484908 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.16■■□□□ 1.14
ATP6AP1-208ENST00000484908 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.16■■□□□ 1.14
ATP6AP1-208ENST00000484908 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.15■■□□□ 1.14
ATP6AP1-208ENST00000484908 TLR2O60603 784 aa22.15■■□□□ 1.14
ATP6AP1-208ENST00000484908 RGS3P49796 1198 aa22.15■■□□□ 1.14
ATP6AP1-208ENST00000484908 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.15■■□□□ 1.14
ATP6AP1-208ENST00000484908 ZFPM1Q8IX07 1006 aa22.15■■□□□ 1.14
ATP6AP1-208ENST00000484908 KCNH4Q9UQ05 1017 aa22.15■■□□□ 1.14
ATP6AP1-208ENST00000484908 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
ATP6AP1-208ENST00000484908 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
ATP6AP1-208ENST00000484908 RFX7Q2KHR2 1363 aa22.14■■□□□ 1.14
ATP6AP1-208ENST00000484908 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa22.14■■□□□ 1.14
ATP6AP1-208ENST00000484908 GORABQ5T7V8 394 aa22.14■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.14■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 ARMC5Q96C12 935 aa22.14■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 ATRNL1Q5VV63 1379 aa22.13■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 BTDP43251 543 aa22.13■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 ANKRD23Q86SG2 305 aa22.13■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.13■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa22.11■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 MECOMQ03112 1051 aa22.11■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 KIF22Q14807 665 aa22.11■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 SPATA5Q8NB90 893 aa22.11■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 PHF20L1A8MW92 1017 aa22.1■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 CXCL11O14625 94 aa22.1■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 LDHCP07864 332 aa22.1■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 MAP3K10Q02779 954 aa22.1■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
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