RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478914.1

XRCC6-208, Transcript of X-ray repair cross complementing 6, human

TSL 2

Gene XRCC6, Length 550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
XRCC6-208	ENST00000478914	SLF2	Q8IX21	1173 aa		10.8	□□□□□ -0.68
XRCC6-208	ENST00000478914	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		10.8	□□□□□ -0.68
XRCC6-208	ENST00000478914	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		10.8	□□□□□ -0.68
XRCC6-208	ENST00000478914	TNN	Q9UQP3	1299 aa		10.8	□□□□□ -0.68
XRCC6-208	ENST00000478914	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		10.8	□□□□□ -0.68
XRCC6-208	ENST00000478914		A0A1B0GUL7	405 aa		10.79	□□□□□ -0.68
XRCC6-208	ENST00000478914	ADORA1	P30542	326 aa		10.79	□□□□□ -0.68
XRCC6-208	ENST00000478914	RGS19	P49795	217 aa		10.79	□□□□□ -0.68
XRCC6-208	ENST00000478914	VGLL4	Q14135	290 aa		10.79	□□□□□ -0.68
XRCC6-208	ENST00000478914	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		10.79	□□□□□ -0.68
XRCC6-208	ENST00000478914	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		10.79	□□□□□ -0.68
XRCC6-208	ENST00000478914	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		10.79	□□□□□ -0.68
XRCC6-208	ENST00000478914	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	10.79	□□□□□ -0.68
XRCC6-208	ENST00000478914	XAGE2	Q96GT9	111 aa		10.79	□□□□□ -0.68
XRCC6-208	ENST00000478914	WRNIP1	Q96S55	665 aa		10.79	□□□□□ -0.68
XRCC6-208	ENST00000478914	ABCF2	Q9UG63	623 aa		10.79	□□□□□ -0.68
XRCC6-208	ENST00000478914	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
XRCC6-208	ENST00000478914	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	10.78	□□□□□ -0.68
XRCC6-208	ENST00000478914	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
XRCC6-208	ENST00000478914	GJA5	P36382	358 aa		10.78	□□□□□ -0.68
XRCC6-208	ENST00000478914	GTF2A2	P52657	109 aa		10.78	□□□□□ -0.68
XRCC6-208	ENST00000478914	TCP10	Q12799	353 aa		10.78	□□□□□ -0.68
XRCC6-208	ENST00000478914	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
XRCC6-208	ENST00000478914	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		10.78	□□□□□ -0.68
XRCC6-208	ENST00000478914	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
XRCC6-208	ENST00000478914	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		10.78	□□□□□ -0.68
XRCC6-208	ENST00000478914	FAM151A	Q8WW52	585 aa		10.78	□□□□□ -0.68
XRCC6-208	ENST00000478914	OTUD5	Q96G74	571 aa		10.78	□□□□□ -0.68
XRCC6-208	ENST00000478914	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		10.78	□□□□□ -0.68
XRCC6-208	ENST00000478914	USP40	Q9NVE5	1235 aa		10.78	□□□□□ -0.68
XRCC6-208	ENST00000478914	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		10.78	□□□□□ -0.68
XRCC6-208	ENST00000478914	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		10.77	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		10.77	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	ZBTB22	O15209	634 aa		10.77	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	RASGRF1	Q13972	1273 aa		10.77	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	CCL15	Q16663	113 aa		10.77	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		10.77	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	ERO1B	Q86YB8	467 aa		10.77	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	ERO1A	Q96HE7	468 aa		10.77	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		10.77	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		10.76	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		10.76	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	CETP	P11597	493 aa		10.76	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	CRHR2	Q13324	411 aa		10.76	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		10.76	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		10.76	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		10.76	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		10.76	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		10.76	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	DOCK1	Q14185	1865 aa		10.76	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		10.75	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	LDHC	P07864	332 aa		10.75	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	SOX10	P56693	466 aa		10.75	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	GSTO1	P78417	241 aa		10.75	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	ATP8B2	P98198	1209 aa		10.75	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	SNAPC2	Q13487	334 aa		10.75	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	SPATA5	Q8NB90	893 aa		10.75	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		10.75	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		10.75	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	TRIM17	Q9Y577	477 aa		10.75	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		10.75	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	GAK	O14976	1311 aa		10.75	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		10.74	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		10.74	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	ENTPD3	O75355	529 aa		10.74	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	MS4A1	P11836	297 aa		10.74	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	BTD	P43251	543 aa		10.74	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	RGS3	P49796	1198 aa		10.74	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	SP3	Q02447	781 aa		10.74	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	MECOM	Q03112	1051 aa		10.74	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	PPAT	Q06203	517 aa		10.74	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	NFIA	Q12857	509 aa		10.74	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	PPIL2	Q13356	520 aa		10.74	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	POLA2	Q14181	598 aa		10.74	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	ARHGEF6	Q15052	776 aa		10.74	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		10.74	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		10.74	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	SSH3	Q8TE77	659 aa		10.74	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		10.74	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	PTPN18	Q99952	460 aa		10.74	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	IDI2	Q9BXS1	227 aa		10.74	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		10.74	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	RAI14	Q9P0K7	980 aa		10.74	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		10.74	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		10.74	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		10.74	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		10.73	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	IRF6	O14896	467 aa		10.73	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	INPP5B	P32019	993 aa		10.73	□□□□□ -0.69
XRCC6-208	ENST00000478914	PICALM	Q13492	652 aa		10.73	□□□□□ -0.69

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