RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476612.1

UBE2Q1-204, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, human

TSL 3

Gene UBE2Q1, Length 301 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2Q1-204	ENST00000476612	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE2Q1-204	ENST00000476612	GAK	O14976	1311 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE2Q1-204	ENST00000476612	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2Q1-204	ENST00000476612	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2Q1-204	ENST00000476612	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
UBE2Q1-204	ENST00000476612	MYO1B	O43795	1136 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TBC1D8	O95759	1140 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2Q1-204	ENST00000476612	INPP5B	P32019	993 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ZAP70	P43403	619 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2Q1-204	ENST00000476612	MAP3K10	Q02779	954 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TCP10	Q12799	353 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PDE3A	Q14432	1141 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2Q1-204	ENST00000476612	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBE2Q1-204	ENST00000476612	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2Q1-204	ENST00000476612	FAM83A	Q86UY5	434 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2Q1-204	ENST00000476612	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TNS4	Q8IZW8	715 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2Q1-204	ENST00000476612	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
UBE2Q1-204	ENST00000476612	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBE2Q1-204	ENST00000476612	AIDA	Q96BJ3	306 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2Q1-204	ENST00000476612	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBE2Q1-204	ENST00000476612	WNK4	Q96J92	1243 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBE2Q1-204	ENST00000476612	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBE2Q1-204	ENST00000476612	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ABCF2	Q9UG63	623 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBE2Q1-204	ENST00000476612	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2Q1-204	ENST00000476612	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		4.9	□□□□□ -1.62
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	UNCX	A6NJT0	531 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CHGB	P05060	677 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	NF2	P35240	595 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	BTD	P43251	543 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	JAG1	P78504	1218 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	MAP3K9	P80192	1104 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	MOGS	Q13724	837 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	VGLL4	Q14135	290 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	IDI2	Q9BXS1	227 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ELP3	Q9H9T3	547 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	FAM196B	A6NMK8	535 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	APBB1	O00213	710 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	IRF6	O14896	467 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CA12	O43570	354 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	MS4A1	P11836	297 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TNNI2	P48788	182 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	RGS3	P49796	1198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PPP4C	P60510	307 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	EVX2	Q03828	476 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TNFAIP1	Q13829	316 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	GORAB	Q5T7V8	394 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	AACS	Q86V21	672 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	IFNL1	Q8IU54	200 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	OPTN	Q96CV9	577 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	RAI14	Q9P0K7	980 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	MAST3	O60307	1309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	BTBD19	C9JJ37	291 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SMIM22	K7EJ46	135 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	GPR25	O00155	361 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ENTPD3	O75355	529 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CAPN15	O75808	1086 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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