RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 ADD1P35611 737 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 NT5C2P49902 561 aa9.92□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 TPM4P67936 248 aa9.92□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 APOBRQ0VD83 1088 aa9.92□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 PARP10Q53GL7 1025 aa9.92□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa9.92□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 STOX1Q6ZVD7 989 aa9.92□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 PROM2Q8N271 834 aa9.92□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa9.92□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 WASF1Q92558 559 aa9.92□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 OSBP2Q969R2 916 aa9.92□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 PGBD1Q96JS3 809 aa9.92□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 CNNM1Q9NRU3 951 aa9.92□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 POLR3EQ9NVU0 708 aa9.92□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa9.92□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 RTL9Q8NET4 1388 aa9.91□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 PRC1O43663 620 aa9.91□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 JAK2O60674 1132 aa9.91□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 CTDNEP1O95476 244 aa9.91□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 SLC5A1P13866 664 aa9.91□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 ITGA6P23229 1130 aa9.91□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP9.91□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 ADD2P35612 726 aa9.91□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 MAP3K12Q12852 859 aa9.91□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 ANO6Q4KMQ2 910 aa9.91□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 FLAD1Q8NFF5 587 aa9.91□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 KIAA1524Q8TCG1 905 aa9.91□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa9.91□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 C8orf76Q96K31 380 aa9.91□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 TCEANC2Q96MN5 208 aa9.91□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 TIGD1Q96MW7 591 aa9.91□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 BPIFA3Q9BQP9 254 aa9.91□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 KRT23Q9C075 422 aa9.91□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 CBX8Q9HC52 389 aa9.91□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 TAF6LQ9Y6J9 622 aa9.91□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 LAMA4Q16363 1823 aa9.91□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 BECN2A8MW95 431 aa9.9□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 M0R2C6 588 aa9.9□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 GPAA1O43292 621 aa9.9□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 RPS6KA4O75676 772 aa9.9□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 LIFRP42702 1097 aa9.9□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 KCNQ4P56696 695 aa9.9□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 SLC15A2Q16348 729 aa9.9□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 PLA2G4DQ86XP0 818 aa9.9□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 CEP57L1Q8IYX8 460 aa9.9□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 ZNF34Q8IZ26 560 aa9.9□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 ENGASEQ8NFI3 743 aa9.9□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 MYRIPQ8NFW9 859 aa9.9□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 DDX11Q96FC9 970 aa9.9□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 FAM89AQ96GI7 184 aa9.9□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 NACAP1Q9BZK3 213 aa9.9□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 TRIM5Q9C035 493 aa9.9□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa9.9□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa9.9□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 CASZ1Q86V15 1759 aa9.89□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa9.89□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 SMTNL1A8MU46 457 aa9.89□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 NRDCO43847 1150 aa9.89□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 PPP6R2O75170 966 aa9.89□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 NR1I2O75469 434 aa9.89□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 PCP11498 1178 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 ZAP70P43403 619 aa9.89□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 ME1P48163 572 aa9.89□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 ZNF75DP51815 510 aa9.89□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 GSDMDP57764 484 aa9.89□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 TRIM29Q14134 588 aa9.89□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 SART3Q15020 963 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 STK38Q15208 465 aa9.89□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 ZNF827Q17R98 1081 aa9.89□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa9.89□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 SGMS1Q86VZ5 419 aa9.89□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 DRC7Q8IY82 874 aa9.89□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 IMPACTQ9P2X3 320 aa9.89□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
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