RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460639.2

ATRX-204, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, humanhuman

TSL 3

Gene ATRX, Length 461 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRX-204ENST00000460639 RASIP1Q5U651 963 aa6.51□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa6.51□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 JAZF1Q86VZ6 243 aa6.51□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.51□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 SULF2Q8IWU5 870 aa6.51□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 WNT8BQ93098 351 aa6.51□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 CEP44Q9C0F1 390 aa6.51□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa6.51□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 KLHL42Q9P2K6 505 aa6.51□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 USP21Q9UK80 565 aa6.51□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 USP31Q70CQ4 1352 aa6.51□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa6.5□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 PARNO95453 639 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 DLGAP3O95886 979 aa6.5□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 APBA3O96018 575 aa6.5□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 ITGAEP38570 1179 aa6.5□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 POU4F3Q15319 338 aa6.5□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa6.5□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 DCAF5Q96JK2 942 aa6.5□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 NRSN2Q9GZP1 204 aa6.5□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 ACBD3Q9H3P7 528 aa6.5□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 COPRSQ9NQ92 184 aa6.5□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 CHRNA4P43681 627 aa6.49□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 GSK3AP49840 483 aa6.49□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 PDE3AQ14432 1141 aa6.49□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 PCNX4Q63HM2 1172 aa6.49□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa6.49□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 SV2BQ7L1I2 683 aa6.49□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 KCNB2Q92953 911 aa6.49□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 CORO1BQ9BR76 489 aa6.49□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 PLEKHD1A6NEE1 506 aa6.48□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 CYP11A1P05108 521 aa6.48□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 LIG1P18858 919 aa6.48□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 BMP6P22004 513 aa6.48□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 NME2P22392 152 aa6.48□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 ARNTP27540 789 aa6.48□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 ZNF76P36508 570 aa6.48□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 ST13P50502 369 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 RASSF7Q02833 373 aa6.48□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 AP3B2Q13367 1082 aa6.48□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 TTBK2Q6IQ55 1244 aa6.48□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 IGF2-ASQ6U949 168 aa6.48□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 TGIF2Q9GZN2 237 aa6.48□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 GGT7Q9UJ14 662 aa6.48□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 TLR6Q9Y2C9 796 aa6.48□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 MINDY4BA8MYZ0 360 aa6.47□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 IREB2P48200 963 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 LIG3P49916 1009 aa6.47□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 PTPROQ16827 1216 aa6.47□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 PDZD3Q86UT5 571 aa6.47□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 ARMC5Q96C12 935 aa6.47□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 RUSC1Q9BVN2 902 aa6.47□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa6.47□□□□□ -1.37
ATRX-204ENST00000460639 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa6.46□□□□□ -1.38
ATRX-204ENST00000460639 F8W735 103 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
ATRX-204ENST00000460639 GDF11O95390 407 aa6.46□□□□□ -1.38
ATRX-204ENST00000460639 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
ATRX-204ENST00000460639 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP6.46□□□□□ -1.38
ATRX-204ENST00000460639 FAM160A1Q05DH4 1040 aa6.46□□□□□ -1.38
ATRX-204ENST00000460639 KCNMA1Q12791 1236 aa6.46□□□□□ -1.38
ATRX-204ENST00000460639 SEPT6Q14141 434 aa6.46□□□□□ -1.38
ATRX-204ENST00000460639 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
ATRX-204ENST00000460639 CD163Q86VB7 1156 aa6.46□□□□□ -1.38
ATRX-204ENST00000460639 TICAM2Q86XR7 235 aa6.46□□□□□ -1.38
ATRX-204ENST00000460639 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
ATRX-204ENST00000460639 ANKRD24Q8TF21 1146 aa6.46□□□□□ -1.38
ATRX-204ENST00000460639 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
ATRX-204ENST00000460639 KBTBD4Q9NVX7 518 aa6.46□□□□□ -1.38
ATRX-204ENST00000460639 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa6.46□□□□□ -1.38
ATRX-204ENST00000460639 C9orf172C9J069 976 aa6.45□□□□□ -1.38
ATRX-204ENST00000460639 ZNF862O60290 1169 aa6.45□□□□□ -1.38
ATRX-204ENST00000460639 GLB1P16278 677 aa6.45□□□□□ -1.38
ATRX-204ENST00000460639 NOS3P29474 1203 aa6.45□□□□□ -1.38
ATRX-204ENST00000460639 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
ATRX-204ENST00000460639 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
ATRX-204ENST00000460639 MBTPS1Q14703 1052 aa6.45□□□□□ -1.38
ATRX-204ENST00000460639 ZNF394Q53GI3 561 aa6.45□□□□□ -1.38
ATRX-204ENST00000460639 AKAP4Q5JQC9 854 aa6.45□□□□□ -1.38
ATRX-204ENST00000460639 LLGL2Q6P1M3 1020 aa6.45□□□□□ -1.38
ATRX-204ENST00000460639 HS2ST1Q7LGA3 356 aa6.45□□□□□ -1.38
ATRX-204ENST00000460639 GPBAR1Q8TDU6 330 aa6.45□□□□□ -1.38
ATRX-204ENST00000460639 DCAF11Q8TEB1 546 aa6.45□□□□□ -1.38
ATRX-204ENST00000460639 WFDC12Q8WWY7 111 aa6.45□□□□□ -1.38
ATRX-204ENST00000460639 RNF34Q969K3 372 aa6.45□□□□□ -1.38
ATRX-204ENST00000460639 ACSBG1Q96GR2 724 aa6.45□□□□□ -1.38
ATRX-204ENST00000460639 NACC1Q96RE7 527 aa6.45□□□□□ -1.38
ATRX-204ENST00000460639 PSMD1Q99460 953 aa6.45□□□□□ -1.38
ATRX-204ENST00000460639 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
ATRX-204ENST00000460639 AKTIPQ9H8T0 292 aa6.45□□□□□ -1.38
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