RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444685.1

CBX1-204, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 5

Gene CBX1, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-204ENST00000444685 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP6.61□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 DDX58O95786 925 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 KCNJ4P48050 445 aa6.61□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 GTF2A2P52657 109 aa6.61□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP6.61□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 MAP3K11Q16584 847 aa6.61□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 DACT2Q5SW24 774 aa6.61□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 CCDC191Q8NCU4 936 aa6.61□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 PLEKHF1Q96S99 279 aa6.61□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 EPAS1Q99814 870 aa6.61□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 TMUB1Q9BVT8 246 aa6.61□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 ANKRD2Q9GZV1 360 aa6.61□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 C1orf115Q9H7X2 142 aa6.61□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 GOPCQ9HD26 462 aa6.61□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 LEMD3Q9Y2U8 911 aa6.61□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 LAMB4A4D0S4 1761 aa6.61□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 ZNF609O15014 1411 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 CCT4P50991 539 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 PRMT2P55345 433 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 GTF2IP78347 998 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 TNFAIP1Q13829 316 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 NLRP7Q8WX94 980 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 CLMNQ96JQ2 1002 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 MPHOSPH8Q99549 860 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 MXD3Q9BW11 206 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 VEZTQ9HBM0 779 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 APBB1O00213 710 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 CHL1O00533 1208 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 USP2O75604 605 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 HOXB7P09629 217 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 CAPN2P17655 700 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 FLIIQ13045 1269 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 RAET1EQ8TD07 263 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 OPTNQ96CV9 577 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 MYD88Q99836 296 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 ELP3Q9H9T3 547 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 MINPP1Q9UNW1 487 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 FZD1Q9UP38 647 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 CSADQ9Y600 493 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 DUOX1Q9NRD9 1551 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 LAMB2P55268 1798 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
CBX1-204ENST00000444685 MED23Q9ULK4 1368 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1-204ENST00000444685 ZNF804BA4D1E1 1349 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1-204ENST00000444685 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1-204ENST00000444685 A0A1W2PPC1 479 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1-204ENST00000444685 F8W031 263 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CBX1-204ENST00000444685 CETPP11597 493 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1-204ENST00000444685 CLCN1P35523 988 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1-204ENST00000444685 TMPOP42166 694 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CBX1-204ENST00000444685 TNNI2P48788 182 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1-204ENST00000444685 UBXN2AP68543 259 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1-204ENST00000444685 NEXNQ0ZGT2 675 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1-204ENST00000444685 CCL15Q16663 113 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1-204ENST00000444685 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CBX1-204ENST00000444685 MTMR14Q8NCE2 650 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1-204ENST00000444685 SH3TC2Q8TF17 1288 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1-204ENST00000444685 TRIM47Q96LD4 638 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1-204ENST00000444685 PTPN18Q99952 460 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1-204ENST00000444685 RNF208Q9H0X6 261 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1-204ENST00000444685 POLR3EQ9NVU0 708 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1-204ENST00000444685 SCN9AQ15858 1988 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1-204ENST00000444685 KDM3BQ7LBC6 1761 aa6.57□□□□□ -1.36
CBX1-204ENST00000444685 LRRC37AA6NMS7 1700 aa6.57□□□□□ -1.36
CBX1-204ENST00000444685 CLRN2A0PK11 232 aa6.57□□□□□ -1.36
CBX1-204ENST00000444685 TLR2O60603 784 aa6.57□□□□□ -1.36
CBX1-204ENST00000444685 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
CBX1-204ENST00000444685 CTSWP56202 376 aa6.57□□□□□ -1.36
CBX1-204ENST00000444685 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
CBX1-204ENST00000444685 RASA3Q14644 834 aa6.57□□□□□ -1.36
CBX1-204ENST00000444685 CFAP100Q494V2 611 aa6.57□□□□□ -1.36
CBX1-204ENST00000444685 DUSP27Q5VZP5 1158 aa6.57□□□□□ -1.36
CBX1-204ENST00000444685 TYW1BQ6NUM6 668 aa6.57□□□□□ -1.36
CBX1-204ENST00000444685 ZNF804AQ7Z570 1209 aa6.57□□□□□ -1.36
CBX1-204ENST00000444685 TTLL11Q8NHH1 800 aa6.57□□□□□ -1.36
CBX1-204ENST00000444685 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
CBX1-204ENST00000444685 WNT2BQ93097 391 aa6.57□□□□□ -1.36
CBX1-204ENST00000444685 CLUAP1Q96AJ1 413 aa6.57□□□□□ -1.36
CBX1-204ENST00000444685 HOOK2Q96ED9 719 aa6.57□□□□□ -1.36
CBX1-204ENST00000444685 GPCPD1Q9NPB8 672 aa6.57□□□□□ -1.36
CBX1-204ENST00000444685 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa6.57□□□□□ -1.36
CBX1-204ENST00000444685 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
CBX1-204ENST00000444685 SZT2Q5T011 3432 aa6.57□□□□□ -1.36
CBX1-204ENST00000444685 TFRCP02786 760 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CBX1-204ENST00000444685 GJB1P08034 283 aa6.56□□□□□ -1.36
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