RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 RHOXF2Q9BQY4 288 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 PAGR1Q9BTK6 254 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC69A6NI79 296 aa6.27□□□□□ -1.41
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PTPRC-209ENST00000442510 TPPPO94811 219 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 MYL1P05976 194 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 VDRP11473 427 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 GSCP56915 257 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
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PTPRC-209ENST00000442510 STMN1P16949 149 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
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PTPRC-209ENST00000442510 MX1P20591 662 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 ST5P78524 1137 aa6.26□□□□□ -1.41
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PTPRC-209ENST00000442510 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa6.26□□□□□ -1.41
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PTPRC-209ENST00000442510 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
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PTPRC-209ENST00000442510 E7EVH7 732 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 MCF2LO15068 1137 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 CHMP4BP1P59074 171 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 PLCB4Q15147 1175 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC144BQ3MJ40 725 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 TEX9Q8N6V9 391 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 TSNARE1Q96NA8 513 aa6.25□□□□□ -1.41
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PTPRC-209ENST00000442510 KIAA1468Q9P260 1216 aa6.25□□□□□ -1.41
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PTPRC-209ENST00000442510 SART1O43290 800 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
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PTPRC-209ENST00000442510 ABHD8Q96I13 439 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 GORASP1Q9BQQ3 440 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP6.25□□□□□ -1.41
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PTPRC-209ENST00000442510 TOP1P11387 765 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 SEPT2Q15019 361 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 LONRF2Q1L5Z9 754 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 SAPCD2Q86UD0 394 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 SNX21Q969T3 373 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 HAUS7Q99871 368 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 FBXL5Q9UKA1 691 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 GMEB1Q9Y692 573 aa6.25□□□□□ -1.41
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