RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 MBD4O95243 580 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXA4-202ENST00000428284 EPS15P42566 896 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXA4-202ENST00000428284 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXA4-202ENST00000428284 SAMD7Q7Z3H4 446 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXA4-202ENST00000428284 RAD50Q92878 1312 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXA4-202ENST00000428284 GPAA1O43292 621 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXA4-202ENST00000428284 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
HOXA4-202ENST00000428284 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
HOXA4-202ENST00000428284 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXA4-202ENST00000428284 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
HOXA4-202ENST00000428284 LCORLQ8N3X6 602 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXA4-202ENST00000428284 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
HOXA4-202ENST00000428284 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXA4-202ENST00000428284 IL25Q9H293 177 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXA4-202ENST00000428284 ARMT1Q9H993 441 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXA4-202ENST00000428284 HACL1Q9UJ83 578 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC171Q6TFL3 1326 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXA4-202ENST00000428284 SPDYE2BA6NHP3 402 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXA4-202ENST00000428284 EGFRP00533 1210 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXA4-202ENST00000428284 SPDYE6P0CI01 402 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
HOXA4-202ENST00000428284 MTMR14Q8NCE2 650 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXA4-202ENST00000428284 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
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HOXA4-202ENST00000428284 SGSM2O43147 1006 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXA4-202ENST00000428284 PLCG2P16885 1265 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXA4-202ENST00000428284 PPP4CP60510 307 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXA4-202ENST00000428284 CERS3Q8IU89 383 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXA4-202ENST00000428284 NAV1Q8NEY1 1877 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXA4-202ENST00000428284 IQCA1LA6NCM1 817 aa24.73■■□□□ 1.55
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HOXA4-202ENST00000428284 C8orf34Q49A92 452 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXA4-202ENST00000428284 TRPM4Q8TD43 1214 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXA4-202ENST00000428284 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
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HOXA4-202ENST00000428284 WNT10BO00744 389 aa24.72■■□□□ 1.55
HOXA4-202ENST00000428284 MYO1BO43795 1136 aa24.72■■□□□ 1.55
HOXA4-202ENST00000428284 NBPF9Q3BBW0 867 aa24.72■■□□□ 1.55
HOXA4-202ENST00000428284 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa24.72■■□□□ 1.55
HOXA4-202ENST00000428284 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
HOXA4-202ENST00000428284 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
HOXA4-202ENST00000428284 USP40Q9NVE5 1235 aa24.72■■□□□ 1.55
HOXA4-202ENST00000428284 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
HOXA4-202ENST00000428284 MYH1P12882 1939 aa24.72■■□□□ 1.55
HOXA4-202ENST00000428284 RHBDL3P58872 404 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXA4-202ENST00000428284 TEX11Q8IYF3 940 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXA4-202ENST00000428284 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
HOXA4-202ENST00000428284 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
HOXA4-202ENST00000428284 EPHX2P34913 555 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXA4-202ENST00000428284 NMRK2Q9NPI5 230 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXA4-202ENST00000428284 TMOD2Q9NZR1 351 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXA4-202ENST00000428284 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXA4-202ENST00000428284 CLRN2A0PK11 232 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXA4-202ENST00000428284 GNAT2P19087 354 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXA4-202ENST00000428284 RRAGCQ9HB90 399 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXA4-202ENST00000428284 POTECB2RU33 542 aa24.68■■□□□ 1.54
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HOXA4-202ENST00000428284 SPDYE2Q495Y8 402 aa24.68■■□□□ 1.54
HOXA4-202ENST00000428284 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa24.68■■□□□ 1.54
HOXA4-202ENST00000428284 SDR42E1Q8WUS8 393 aa24.68■■□□□ 1.54
HOXA4-202ENST00000428284 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
HOXA4-202ENST00000428284 ANO2Q9NQ90 1003 aa24.68■■□□□ 1.54
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
HOXA4-202ENST00000428284 APPP05067 770 aa24.67■■□□□ 1.54
HOXA4-202ENST00000428284 USP5P45974 858 aa24.67■■□□□ 1.54
HOXA4-202ENST00000428284 CACNB3P54284 484 aa24.67■■□□□ 1.54
HOXA4-202ENST00000428284 VPS53Q5VIR6 699 aa24.67■■□□□ 1.54
HOXA4-202ENST00000428284 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa24.67■■□□□ 1.54
HOXA4-202ENST00000428284 VEZTQ9HBM0 779 aa24.67■■□□□ 1.54
HOXA4-202ENST00000428284 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
HOXA4-202ENST00000428284 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
HOXA4-202ENST00000428284 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
HOXA4-202ENST00000428284 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
HOXA4-202ENST00000428284 REC8O95072 547 aa24.66■■□□□ 1.54
HOXA4-202ENST00000428284 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
HOXA4-202ENST00000428284 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
HOXA4-202ENST00000428284 PICALMQ13492 652 aa24.66■■□□□ 1.54
HOXA4-202ENST00000428284 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
HOXA4-202ENST00000428284 LAMB1P07942 1786 aa24.66■■□□□ 1.54
HOXA4-202ENST00000428284 KIF3CO14782 793 aa24.65■■□□□ 1.54
HOXA4-202ENST00000428284 NFIAQ12857 509 aa24.65■■□□□ 1.54
HOXA4-202ENST00000428284 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
HOXA4-202ENST00000428284 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa24.65■■□□□ 1.54
HOXA4-202ENST00000428284 DDRGK1Q96HY6 314 aa24.65■■□□□ 1.54
HOXA4-202ENST00000428284 GSG1L2A8MUP6 293 aa24.64■■□□□ 1.54
HOXA4-202ENST00000428284 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
HOXA4-202ENST00000428284 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
HOXA4-202ENST00000428284 NACAP1Q9BZK3 213 aa24.64■■□□□ 1.54
HOXA4-202ENST00000428284 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa24.64■■□□□ 1.54
HOXA4-202ENST00000428284 GGA3Q9NZ52 723 aa24.64■■□□□ 1.54
HOXA4-202ENST00000428284 FLT1P17948 1338 aa24.64■■□□□ 1.53
HOXA4-202ENST00000428284 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
HOXA4-202ENST00000428284 LAMA4Q16363 1823 aa24.64■■□□□ 1.53
HOXA4-202ENST00000428284 TCP10L2B9ZVM9 353 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXA4-202ENST00000428284 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
HOXA4-202ENST00000428284 PTH1RQ03431 593 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXA4-202ENST00000428284 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
HOXA4-202ENST00000428284 IDI2Q9BXS1 227 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXA4-202ENST00000428284 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
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