RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC102BQ68D86 513 aa26.05■■□□□ 1.76
LIMS1-208ENST00000428064 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa26.05■■□□□ 1.76
LIMS1-208ENST00000428064 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa26.05■■□□□ 1.76
LIMS1-208ENST00000428064 ERO1AQ96HE7 468 aa26.05■■□□□ 1.76
LIMS1-208ENST00000428064 WRNIP1Q96S55 665 aa26.05■■□□□ 1.76
LIMS1-208ENST00000428064 DIXDC1Q155Q3 683 aa26.04■■□□□ 1.76
LIMS1-208ENST00000428064 ERO1BQ86YB8 467 aa26.04■■□□□ 1.76
LIMS1-208ENST00000428064 BRI3BPQ8WY22 251 aa26.04■■□□□ 1.76
LIMS1-208ENST00000428064 OTUD5Q96G74 571 aa26.04■■□□□ 1.76
LIMS1-208ENST00000428064 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa26.03■■□□□ 1.76
LIMS1-208ENST00000428064 OTOP1Q7RTM1 612 aa26.03■■□□□ 1.76
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF341Q9BYN7 854 aa26.03■■□□□ 1.76
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LIMS1-208ENST00000428064 CCL15Q16663 113 aa26.02■■□□□ 1.76
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM17Q9Y577 477 aa26.02■■□□□ 1.76
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LIMS1-208ENST00000428064 MYH2Q9UKX2 1941 aa26.01■■□□□ 1.75
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1B0GUL7 405 aa26■■□□□ 1.75
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LIMS1-208ENST00000428064 GNAI2P04899 355 aa26■■□□□ 1.75
LIMS1-208ENST00000428064 SP3Q02447 781 aa26■■□□□ 1.75
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LIMS1-208ENST00000428064 RASGRF1Q13972 1273 aa26■■□□□ 1.75
LIMS1-208ENST00000428064 MVPQ14764 893 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
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LIMS1-208ENST00000428064 RFX7Q2KHR2 1363 aa25.99■■□□□ 1.75
LIMS1-208ENST00000428064 CETPP11597 493 aa25.99■■□□□ 1.75
LIMS1-208ENST00000428064 TIMM10P62072 90 aa25.99■■□□□ 1.75
LIMS1-208ENST00000428064 TFCP2Q12800 502 aa25.99■■□□□ 1.75
LIMS1-208ENST00000428064 NFIAQ12857 509 aa25.99■■□□□ 1.75
LIMS1-208ENST00000428064 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa25.99■■□□□ 1.75
LIMS1-208ENST00000428064 FAM198AQ9UFP1 575 aa25.99■■□□□ 1.75
LIMS1-208ENST00000428064 DOCK2Q92608 1830 aa25.99■■□□□ 1.75
LIMS1-208ENST00000428064 PPATQ06203 517 aa25.98■■□□□ 1.75
LIMS1-208ENST00000428064 SNAPC2Q13487 334 aa25.98■■□□□ 1.75
LIMS1-208ENST00000428064 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
LIMS1-208ENST00000428064 FAM43AQ8N2R8 423 aa25.98■■□□□ 1.75
LIMS1-208ENST00000428064 CD99L2Q8TCZ2 262 aa25.98■■□□□ 1.75
LIMS1-208ENST00000428064 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
LIMS1-208ENST00000428064 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
LIMS1-208ENST00000428064 XAGE2Q96GT9 111 aa25.98■■□□□ 1.75
LIMS1-208ENST00000428064 IDI2Q9BXS1 227 aa25.98■■□□□ 1.75
LIMS1-208ENST00000428064 USP40Q9NVE5 1235 aa25.98■■□□□ 1.75
LIMS1-208ENST00000428064 CENPFP49454 3210 aa25.98■■□□□ 1.75
LIMS1-208ENST00000428064 IRF6O14896 467 aa25.97■■□□□ 1.75
LIMS1-208ENST00000428064 TCP10Q12799 353 aa25.97■■□□□ 1.75
LIMS1-208ENST00000428064 SLF2Q8IX21 1173 aa25.97■■□□□ 1.75
LIMS1-208ENST00000428064 PTPN22Q9Y2R2 807 aa25.97■■□□□ 1.75
LIMS1-208ENST00000428064 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
LIMS1-208ENST00000428064 ATRNL1Q5VV63 1379 aa25.96■■□□□ 1.75
LIMS1-208ENST00000428064 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
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LIMS1-208ENST00000428064 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
LIMS1-208ENST00000428064 MIGA2Q7L4E1 593 aa25.96■■□□□ 1.75
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LIMS1-208ENST00000428064 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
LIMS1-208ENST00000428064 AK9Q5TCS8 1911 aa25.94■■□□□ 1.74
LIMS1-208ENST00000428064 INPP5BP32019 993 aa25.94■■□□□ 1.74
LIMS1-208ENST00000428064 ARHGEF6Q15052 776 aa25.94■■□□□ 1.74
LIMS1-208ENST00000428064 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa25.93■■□□□ 1.74
LIMS1-208ENST00000428064 TLR2O60603 784 aa25.93■■□□□ 1.74
LIMS1-208ENST00000428064 CLUAP1Q96AJ1 413 aa25.93■■□□□ 1.74
LIMS1-208ENST00000428064 ABCF2Q9UG63 623 aa25.93■■□□□ 1.74
LIMS1-208ENST00000428064 KCNH4Q9UQ05 1017 aa25.93■■□□□ 1.74
LIMS1-208ENST00000428064 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
LIMS1-208ENST00000428064 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa25.92■■□□□ 1.74
LIMS1-208ENST00000428064 BTBD19C9JJ37 291 aa25.92■■□□□ 1.74
LIMS1-208ENST00000428064 CAP1Q01518 475 aa25.92■■□□□ 1.74
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM57Q8N5G2 664 aa25.92■■□□□ 1.74
LIMS1-208ENST00000428064 BRCA2P51587 3418 aa25.91■■□□□ 1.74
LIMS1-208ENST00000428064 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
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LIMS1-208ENST00000428064 MAP3K10Q02779 954 aa25.91■■□□□ 1.74
LIMS1-208ENST00000428064 ARMC5Q96C12 935 aa25.91■■□□□ 1.74
LIMS1-208ENST00000428064 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP25.9■■□□□ 1.74
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LIMS1-208ENST00000428064 ZFPM1Q8IX07 1006 aa25.9■■□□□ 1.74
LIMS1-208ENST00000428064 NEUROD6Q96NK8 337 aa25.9■■□□□ 1.74
LIMS1-208ENST00000428064 HMG20BQ9P0W2 317 aa25.9■■□□□ 1.74
LIMS1-208ENST00000428064 NPM3O75607 178 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
LIMS1-208ENST00000428064 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
LIMS1-208ENST00000428064 BTDP43251 543 aa25.89■■□□□ 1.74
LIMS1-208ENST00000428064 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.89■■□□□ 1.74
LIMS1-208ENST00000428064 MECOMQ03112 1051 aa25.89■■□□□ 1.74
LIMS1-208ENST00000428064 POLA2Q14181 598 aa25.89■■□□□ 1.74
LIMS1-208ENST00000428064 ANKRD23Q86SG2 305 aa25.89■■□□□ 1.74
LIMS1-208ENST00000428064 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
LIMS1-208ENST00000428064 SPATA5Q8NB90 893 aa25.89■■□□□ 1.74
LIMS1-208ENST00000428064 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa25.88■■□□□ 1.73
LIMS1-208ENST00000428064 PHF20L1A8MW92 1017 aa25.88■■□□□ 1.73
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF384Q8TF68 577 aa25.88■■□□□ 1.73
LIMS1-208ENST00000428064 GPR108Q9NPR9 543 aa25.88■■□□□ 1.73
LIMS1-208ENST00000428064 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa25.88■■□□□ 1.73
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