RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AKNAD1Q5T1N1 836 aa21.86■■□□□ 1.09
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SGMS1Q86VZ5 419 aa21.86■■□□□ 1.09
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CKAP2LQ8IYA6 745 aa21.86■■□□□ 1.09
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SETDB2Q96T68 719 aa21.86■■□□□ 1.09
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LY9Q9HBG7 655 aa21.86■■□□□ 1.09
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TACC3Q9Y6A5 838 aa21.86■■□□□ 1.09
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TAF1LQ8IZX4 1826 aa21.85■■□□□ 1.09
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TDO2P48775 406 aa21.85■■□□□ 1.09
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MRVI1Q9Y6F6 885 aa21.85■■□□□ 1.09
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CACNA1SQ13698 1873 aa21.84■■□□□ 1.09
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KDM4AO75164 1064 aa21.84■■□□□ 1.09
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZPR1O75312 459 aa21.84■■□□□ 1.09
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CAVIN4Q5BKX8 364 aa21.84■■□□□ 1.09
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM67Q5HYA8 995 aa21.84■■□□□ 1.09
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM182BQ5T319 152 aa21.84■■□□□ 1.09
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADGRA1Q86SQ6 560 aa21.84■■□□□ 1.09
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRT23Q9C075 422 aa21.84■■□□□ 1.09
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZSWIM5Q9P217 1185 aa21.84■■□□□ 1.09
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ABCF2Q9UG63 623 aa21.84■■□□□ 1.09
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LY75O60449 1722 aa21.84■■□□□ 1.09
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RXRAP19793 462 aa21.84■■□□□ 1.09
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CYP7A1P22680 504 aa21.84■■□□□ 1.09
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LIFRP42702 1097 aa21.84■■□□□ 1.09
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MFSD6Q6ZSS7 791 aa21.84■■□□□ 1.09
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MICU3Q86XE3 530 aa21.84■■□□□ 1.09
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RGS22Q8NE09 1264 aa21.84■■□□□ 1.09
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa21.84■■□□□ 1.09
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ECM29Q5VYK3 1845 aa21.84■■□□□ 1.09
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa21.84■■□□□ 1.09
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZBTB43O43298 467 aa21.83■■□□□ 1.09
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDKL5O76039 1030 aa21.83■■□□□ 1.09
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADCY5O95622 1261 aa21.83■■□□□ 1.09
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM200AQ8TCP9 573 aa21.83■■□□□ 1.09
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STAG1Q8WVM7 1258 aa21.83■■□□□ 1.09
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NLRP3Q96P20 1036 aa21.83■■□□□ 1.09
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GJB4Q9NTQ9 266 aa21.83■■□□□ 1.09
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RTEL1Q9NZ71 1219 aa21.83■■□□□ 1.09
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAI14Q9P0K7 980 aa21.83■■□□□ 1.09
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDC27P30260 824 aa21.83■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NFXL1Q6ZNB6 911 aa21.83■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BRAPQ7Z569 592 aa21.82■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VPS37DQ86XT2 251 aa21.82■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PTMAP06454 111 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RPS8P62241 208 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AMIGO3Q86WK7 504 aa21.81■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa21.81■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ME1P48163 572 aa21.81■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYH13Q9UKX3 1938 aa21.81■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SBF2Q86WG5 1849 aa21.8■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa21.8■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GOLGA8AA7E2F4 631 aa21.8■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIF28PB7ZC32 967 aa21.8■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NTRK3Q16288 839 aa21.8■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYSM1Q5VVJ2 828 aa21.8■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TPTE2Q6XPS3 522 aa21.8■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa21.8■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYL10Q9BUA6 226 aa21.8■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC12A7Q9Y666 1083 aa21.8■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANO6Q4KMQ2 910 aa21.79■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa21.79■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PHKBQ93100 1093 aa21.79■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AIFM3Q96NN9 605 aa21.79■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ALG1Q9BT22 464 aa21.79■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POLR3EQ9NVU0 708 aa21.79■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC69A6NI79 296 aa21.79■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KLRK1P26718 216 aa21.79■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FBXO33Q7Z6M2 555 aa21.79■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LINC00301Q8NCQ3 95 aa21.79■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SDR42E1Q8WUS8 393 aa21.79■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCDHA7Q9UN72 937 aa21.79■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NID2Q14112 1375 aa21.79■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SEMA3EO15041 775 aa21.78■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM160A1Q05DH4 1040 aa21.78■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPARAQ07869 468 aa21.78■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SASS6Q6UVJ0 657 aa21.78■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC24Q8N4L8 307 aa21.78■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ENGASEQ8NFI3 743 aa21.78■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TOMM22Q9NS69 142 aa21.78■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLIC4Q9Y696 253 aa21.78■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AP5Z1O43299 807 aa21.78■■□□□ 1.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.7 ms