RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423243.5

ATE1-204, Transcript of arginyltransferase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATE1, Length 2,031 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1-204ENST00000423243 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa13.47□□□□□ -0.25
ATE1-204ENST00000423243 CLRN2A0PK11 232 aa13.47□□□□□ -0.25
ATE1-204ENST00000423243 MYO1BO43795 1136 aa13.47□□□□□ -0.25
ATE1-204ENST00000423243 LDHCP07864 332 aa13.47□□□□□ -0.25
ATE1-204ENST00000423243 CYP7A1P22680 504 aa13.47□□□□□ -0.25
ATE1-204ENST00000423243 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
ATE1-204ENST00000423243 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP13.47□□□□□ -0.25
ATE1-204ENST00000423243 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
ATE1-204ENST00000423243 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa13.46□□□□□ -0.25
ATE1-204ENST00000423243 ADM5C9JUS6 153 aa13.46□□□□□ -0.25
ATE1-204ENST00000423243 SLFNL1Q499Z3 407 aa13.46□□□□□ -0.25
ATE1-204ENST00000423243 KBTBD3Q8NAB2 608 aa13.46□□□□□ -0.25
ATE1-204ENST00000423243 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
ATE1-204ENST00000423243 FSD1Q9BTV5 496 aa13.46□□□□□ -0.25
ATE1-204ENST00000423243 VEZTQ9HBM0 779 aa13.46□□□□□ -0.25
ATE1-204ENST00000423243 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
ATE1-204ENST00000423243 ZNF532Q9HCE3 1301 aa13.46□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 CELF2O95319 508 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 CHGBP05060 677 aa13.46□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 PDE6AP16499 860 aa13.46□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 BTDP43251 543 aa13.46□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa13.46□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 ADGRA1Q86SQ6 560 aa13.46□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 EVI5LQ96CN4 794 aa13.46□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 KLRG1Q96E93 195 aa13.46□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 TTC22Q5TAA0 569 aa13.45□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa13.45□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 SULF1Q8IWU6 871 aa13.45□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 MIGA1Q8NAN2 632 aa13.45□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 USP40Q9NVE5 1235 aa13.45□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP13.45□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 GAKO14976 1311 aa13.44□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 ADD2P35612 726 aa13.44□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 CACNB3P54284 484 aa13.44□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa13.44□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 IGSF3O75054 1194 aa13.44□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 BAG3O95817 575 aa13.44□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa13.44□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa13.43□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 TCP10L2B9ZVM9 353 aa13.43□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 GRM1Q13255 1194 aa13.43□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 SPDYE2Q495Y8 402 aa13.43□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 TMOD2Q9NZR1 351 aa13.43□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 MYH2Q9UKX2 1941 aa13.42□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa13.42□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 SDSP20132 328 aa13.42□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 UBE3CQ15386 1083 aa13.42□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 DEFB115Q30KQ5 88 aa13.42□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 DOCK2Q92608 1830 aa13.42□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 MAST2Q6P0Q8 1798 aa13.41□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 VEGFBP49765 207 aa13.41□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 TCP10Q12799 353 aa13.41□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 PICALMQ13492 652 aa13.41□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 SAPCD2Q86UD0 394 aa13.41□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa13.41□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 RHBDL3P58872 404 aa13.4□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 PPP4CP60510 307 aa13.4□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 TEX11Q8IYF3 940 aa13.4□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 PLCG2P16885 1265 aa13.4□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 TNNI2P48788 182 aa13.4□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 NFIAQ12857 509 aa13.4□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 RASA3Q14644 834 aa13.4□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 APPBP2Q92624 585 aa13.4□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 CDCA5Q96FF9 252 aa13.4□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 DEFB129Q9H1M3 183 aa13.4□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 ARMT1Q9H993 441 aa13.4□□□□□ -0.26
ATE1-204ENST00000423243 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
ATE1-204ENST00000423243 MBD4O95243 580 aa13.39□□□□□ -0.27
ATE1-204ENST00000423243 TNFAIP1Q13829 316 aa13.39□□□□□ -0.27
ATE1-204ENST00000423243 CYP4F22Q6NT55 531 aa13.39□□□□□ -0.27
ATE1-204ENST00000423243 LCORLQ8N3X6 602 aa13.39□□□□□ -0.27
ATE1-204ENST00000423243 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa13.39□□□□□ -0.27
ATE1-204ENST00000423243 OSBP2Q969R2 916 aa13.39□□□□□ -0.27
ATE1-204ENST00000423243 AIDAQ96BJ3 306 aa13.39□□□□□ -0.27
ATE1-204ENST00000423243 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
ATE1-204ENST00000423243 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
ATE1-204ENST00000423243 CNTNAP1P78357 1384 aa13.39□□□□□ -0.27
ATE1-204ENST00000423243 RASSF10A6NK89 507 aa13.39□□□□□ -0.27
ATE1-204ENST00000423243 M0R2C6 588 aa13.39□□□□□ -0.27
ATE1-204ENST00000423243 TMEM39BQ9GZU3 492 aa13.39□□□□□ -0.27
ATE1-204ENST00000423243 TLL2Q9Y6L7 1015 aa13.39□□□□□ -0.27
ATE1-204ENST00000423243 USP5P45974 858 aa13.38□□□□□ -0.27
ATE1-204ENST00000423243 HUNKP57058 714 aa13.38□□□□□ -0.27
ATE1-204ENST00000423243 PRKG1Q13976 671 aa13.38□□□□□ -0.27
ATE1-204ENST00000423243 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 198.3 ms