RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423048.5

ALMS1-201, Transcript of ALMS1, centrosome and basal body associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ALMS1, Length 5,194 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALMS1-201ENST00000423048 CCDC26Q8TAB7 109 aa8.05□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 NLRP3Q96P20 1036 aa8.05□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 SIL1Q9H173 461 aa8.05□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 MTUS1Q9ULD2 1270 aa8.05□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 CYP26C1Q6V0L0 522 aa8.05□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 RUFY4Q6ZNE9 571 aa8.05□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 PPM1EQ8WY54 764 aa8.05□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 LPIN2Q92539 896 aa8.05□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 AK8Q96MA6 479 aa8.05□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 MYO3AQ8NEV4 1616 aa8.05□□□□□ -1.12
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ALMS1-201ENST00000423048 ANXA13P27216 316 aa8.05□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 MAN1A1P33908 653 aa8.05□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 UBE3CQ15386 1083 aa8.05□□□□□ -1.12
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ALMS1-201ENST00000423048 RASSF4Q9H2L5 321 aa8.05□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 TRIM35Q9UPQ4 493 aa8.05□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 TECPR2O15040 1411 aa8.05□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa8.04□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 TPTE2Q6XPS3 522 aa8.04□□□□□ -1.12
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ALMS1-201ENST00000423048 PRC1O43663 620 aa8.04□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 HSPA6P17066 643 aa8.04□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 MMP14P50281 582 aa8.04□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 MAP3K19Q56UN5 1328 aa8.04□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 BBOF1Q8ND07 529 aa8.04□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 SH3TC1Q8TE82 1336 aa8.04□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 SLC52A2Q9HAB3 445 aa8.04□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 ERBB3P21860 1342 aa8.04□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 TOM1O60784 492 aa8.04□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 STAT6P42226 847 aa8.04□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 CCDC40Q4G0X9 1142 aa8.04□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 ADALQ6DHV7 355 aa8.04□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 NBPF11Q86T75 865 aa8.04□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 USP48Q86UV5 1035 aa8.04□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 MYRIPQ8NFW9 859 aa8.04□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 VWDEQ8N2E2 1590 aa8.04□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 FOXP2O15409 715 aa8.04□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 PFKFB2O60825 505 aa8.04□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 EVCP57679 992 aa8.04□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 ALCAMQ13740 583 aa8.04□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 SPC24Q8NBT2 197 aa8.04□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 NCAPGQ9BPX3 1015 aa8.04□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa8.04□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 BCAP29Q9UHQ4 241 aa8.04□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
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ALMS1-201ENST00000423048 C20orf194Q5TEA3 1177 aa8.03□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 HS2ST1Q7LGA3 356 aa8.03□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP8.03□□□□□ -1.123e-6■■■■■ 50.8
ALMS1-201ENST00000423048 KIFAP3Q92845 792 aa8.03□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 CCDC102AQ96A19 550 aa8.03□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 PLEKHF1Q96S99 279 aa8.03□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa8.03□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 STK36Q9NRP7 1315 aa8.03□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 URI1O94763 535 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 SKILP12757 684 aa8.03□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 TNNI2P48788 182 aa8.03□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 MEIS3Q99687 375 aa8.03□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 BPIFA3Q9BQP9 254 aa8.03□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 QRICH2Q9H0J4 1663 aa8.03□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 ERVV-1B6SEH8 477 aa8.03□□□□□ -1.12
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ALMS1-201ENST00000423048 MYL6BP14649 208 aa8.03□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 ARHGAP25P42331 645 aa8.03□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 MAP7Q14244 749 aa8.03□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 TNNI3KQ59H18 835 aa8.03□□□□□ -1.12
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ALMS1-201ENST00000423048 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa8.03□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
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ALMS1-201ENST00000423048 CCDC14Q49A88 953 aa8.03□□□□□ -1.12
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ALMS1-201ENST00000423048 IFT74Q96LB3 600 aa8.03□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 EYA1Q99502 592 aa8.03□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP8.03□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 TSPY2A6NKD2 308 aa8.02□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 CCDC38Q502W7 563 aa8.02□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 CCDC174Q6PII3 467 aa8.02□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa8.02□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 XAGE3Q8WTP9 111 aa8.02□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 MED4Q9NPJ6 270 aa8.02□□□□□ -1.12
ALMS1-201ENST00000423048 FSD2A1L4K1 749 aa8.02□□□□□ -1.13
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