RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421832.2

CTU1-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTU1, Length 2,087 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1-201ENST00000421832 MYH2Q9UKX2 1941 aa28.99■■■□□ 2.23
CTU1-201ENST00000421832 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa28.98■■■□□ 2.23
CTU1-201ENST00000421832 GOLGA6L22H0YM25 854 aa28.98■■■□□ 2.23
CTU1-201ENST00000421832 CREB3L3Q68CJ9 461 aa28.98■■■□□ 2.23
CTU1-201ENST00000421832 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
CTU1-201ENST00000421832 DIXDC1Q155Q3 683 aa28.98■■■□□ 2.23
CTU1-201ENST00000421832 SLC27A2O14975 620 aa28.97■■■□□ 2.23
CTU1-201ENST00000421832 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
CTU1-201ENST00000421832 PRDM4Q9UKN5 801 aa28.97■■■□□ 2.23
CTU1-201ENST00000421832 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa28.97■■■□□ 2.23
CTU1-201ENST00000421832 YDJCA8MPS7 323 aa28.96■■■□□ 2.23
CTU1-201ENST00000421832 NFKBIEO00221 500 aa28.96■■■□□ 2.23
CTU1-201ENST00000421832 KLHL40Q2TBA0 621 aa28.96■■■□□ 2.23
CTU1-201ENST00000421832 KCNB2Q92953 911 aa28.96■■■□□ 2.23
CTU1-201ENST00000421832 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
CTU1-201ENST00000421832 PRKAB2O43741 272 aa28.95■■■□□ 2.23
CTU1-201ENST00000421832 ANAPC15P60006 121 aa28.95■■■□□ 2.23
CTU1-201ENST00000421832 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.23
CTU1-201ENST00000421832 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
CTU1-201ENST00000421832 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa28.94■■■□□ 2.22
CTU1-201ENST00000421832 LARGE2Q8N3Y3 721 aa28.94■■■□□ 2.22
CTU1-201ENST00000421832 IL17RAQ96F46 866 aa28.94■■■□□ 2.22
CTU1-201ENST00000421832 PSME4Q14997 1843 aa28.93■■■□□ 2.22
CTU1-201ENST00000421832 FGAP02671 866 aa28.93■■■□□ 2.22
CTU1-201ENST00000421832 CYP21A2P08686 494 aa28.93■■■□□ 2.22
CTU1-201ENST00000421832 ADCK5Q3MIX3 580 aa28.93■■■□□ 2.22
CTU1-201ENST00000421832 TAOK3Q9H2K8 898 aa28.93■■■□□ 2.22
CTU1-201ENST00000421832 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP28.93■■■□□ 2.22
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CTU1-201ENST00000421832 ZNF445P59923 1031 aa28.92■■■□□ 2.22
CTU1-201ENST00000421832 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
CTU1-201ENST00000421832 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
CTU1-201ENST00000421832 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa28.92■■■□□ 2.22
CTU1-201ENST00000421832 F8W031 263 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
CTU1-201ENST00000421832 DACT2Q5SW24 774 aa28.92■■■□□ 2.22
CTU1-201ENST00000421832 IARSP41252 1262 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
CTU1-201ENST00000421832 RABEP1Q15276 862 aa28.91■■■□□ 2.22
CTU1-201ENST00000421832 GSG1L2A8MUP6 293 aa28.9■■■□□ 2.22
CTU1-201ENST00000421832 APPP05067 770 aa28.9■■■□□ 2.22
CTU1-201ENST00000421832 STRIP1Q5VSL9 837 aa28.9■■■□□ 2.22
CTU1-201ENST00000421832 SYT17Q9BSW7 474 aa28.9■■■□□ 2.22
CTU1-201ENST00000421832 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa28.9■■■□□ 2.22
CTU1-201ENST00000421832 RASSF7Q02833 373 aa28.9■■■□□ 2.22
CTU1-201ENST00000421832 SDR42E1Q8WUS8 393 aa28.9■■■□□ 2.22
CTU1-201ENST00000421832 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
CTU1-201ENST00000421832 USP17L3A6NCW0 530 aa28.89■■■□□ 2.22
CTU1-201ENST00000421832 USP17L4A6NCW7 530 aa28.89■■■□□ 2.22
CTU1-201ENST00000421832 USP17L1Q7RTZ2 530 aa28.89■■■□□ 2.22
CTU1-201ENST00000421832 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
CTU1-201ENST00000421832 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.21
CTU1-201ENST00000421832 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.21
CTU1-201ENST00000421832 MCM5P33992 734 aa28.89■■■□□ 2.21
CTU1-201ENST00000421832 PRELPP51888 382 aa28.89■■■□□ 2.21
CTU1-201ENST00000421832 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.21
CTU1-201ENST00000421832 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa28.88■■■□□ 2.21
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CTU1-201ENST00000421832 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
CTU1-201ENST00000421832 GSTO1P78417 241 aa28.88■■■□□ 2.21
CTU1-201ENST00000421832 RNF20Q5VTR2 975 aa28.88■■■□□ 2.21
CTU1-201ENST00000421832 HAND2P61296 217 aa28.87■■■□□ 2.21
CTU1-201ENST00000421832 IFNL3Q8IZI9 196 aa28.87■■■□□ 2.21
CTU1-201ENST00000421832 VPS33BQ9H267 617 aa28.87■■■□□ 2.21
CTU1-201ENST00000421832 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
CTU1-201ENST00000421832 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
CTU1-201ENST00000421832 IGSF3O75054 1194 aa28.87■■■□□ 2.21
CTU1-201ENST00000421832 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa28.87■■■□□ 2.21
CTU1-201ENST00000421832 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
CTU1-201ENST00000421832 RAD17O75943 681 aa28.86■■■□□ 2.21
CTU1-201ENST00000421832 STOX1Q6ZVD7 989 aa28.86■■■□□ 2.21
CTU1-201ENST00000421832 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
CTU1-201ENST00000421832 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa28.86■■■□□ 2.21
CTU1-201ENST00000421832 LAMA4Q16363 1823 aa28.86■■■□□ 2.21
CTU1-201ENST00000421832 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa28.86■■■□□ 2.21
CTU1-201ENST00000421832 SCNN1DP51172 638 aa28.85■■■□□ 2.21
CTU1-201ENST00000421832 NEK4P51957 841 aa28.85■■■□□ 2.21
CTU1-201ENST00000421832 KIAA0825Q8IV33 1275 aa28.85■■■□□ 2.21
CTU1-201ENST00000421832 GNAT2P19087 354 aa28.85■■■□□ 2.21
CTU1-201ENST00000421832 TSGA10IPQ3SY00 556 aa28.85■■■□□ 2.21
CTU1-201ENST00000421832 PDLIM2Q96JY6 352 aa28.85■■■□□ 2.21
CTU1-201ENST00000421832 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
CTU1-201ENST00000421832 DYNC1I1O14576 645 aa28.84■■■□□ 2.21
CTU1-201ENST00000421832 LDHCP07864 332 aa28.84■■■□□ 2.21
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CTU1-201ENST00000421832 ALX1Q15699 326 aa28.84■■■□□ 2.21
CTU1-201ENST00000421832 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
CTU1-201ENST00000421832 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa28.84■■■□□ 2.21
CTU1-201ENST00000421832 BTDP43251 543 aa28.83■■■□□ 2.21
CTU1-201ENST00000421832 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
CTU1-201ENST00000421832 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
CTU1-201ENST00000421832 NBPF3Q9H094 633 aa28.83■■■□□ 2.21
CTU1-201ENST00000421832 LTBP3Q9NS15 1303 aa28.83■■■□□ 2.21
CTU1-201ENST00000421832 ZNRF3Q9ULT6 936 aa28.83■■■□□ 2.21
CTU1-201ENST00000421832 PSMD14O00487 310 aa28.82■■■□□ 2.2
CTU1-201ENST00000421832 NAPBQ9H115 298 aa28.82■■■□□ 2.2
CTU1-201ENST00000421832 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa28.82■■■□□ 2.2
CTU1-201ENST00000421832 PPP4CP60510 307 aa28.82■■■□□ 2.2
CTU1-201ENST00000421832 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
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