RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
PTPRJ-201ENST00000418331 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
PTPRJ-201ENST00000418331 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
PTPRJ-201ENST00000418331 PLS1Q14651 629 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRJ-201ENST00000418331 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRJ-201ENST00000418331 NEK11Q8NG66 645 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRJ-201ENST00000418331 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
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PTPRJ-201ENST00000418331 GPCPD1Q9NPB8 672 aa24.19■■□□□ 1.46
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PTPRJ-201ENST00000418331 SV2BQ7L1I2 683 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRJ-201ENST00000418331 TM6SF1Q9BZW5 370 aa24.17■■□□□ 1.46
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PTPRJ-201ENST00000418331 B4DLN1 442 aa24.16■■□□□ 1.46
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PTPRJ-201ENST00000418331 SYNCQ9H7C4 482 aa24.16■■□□□ 1.46
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PTPRJ-201ENST00000418331 CCDC24Q8N4L8 307 aa24.16■■□□□ 1.46
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PTPRJ-201ENST00000418331 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
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PTPRJ-201ENST00000418331 SH2D4AQ9H788 454 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRJ-201ENST00000418331 CEP112Q8N8E3 955 aa24.15■■□□□ 1.46
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PTPRJ-201ENST00000418331 CLSTN2Q9H4D0 955 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRJ-201ENST00000418331 PRPHP41219 470 aa24.15■■□□□ 1.46
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PTPRJ-201ENST00000418331 LZTFL1Q9NQ48 299 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRJ-201ENST00000418331 FSD2A1L4K1 749 aa24.14■■□□□ 1.46
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PTPRJ-201ENST00000418331 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP24.14■■□□□ 1.45
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PTPRJ-201ENST00000418331 AATKQ6ZMQ8 1374 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRJ-201ENST00000418331 E7EWF7 191 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRJ-201ENST00000418331 HSF2BPO75031 334 aa24.14■■□□□ 1.45
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PTPRJ-201ENST00000418331 LMBR1Q8WVP7 490 aa24.13■■□□□ 1.45
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PTPRJ-201ENST00000418331 MICALCLQ6ZW33 695 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRJ-201ENST00000418331 KRT40Q6A162 431 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRJ-201ENST00000418331 CTSWP56202 376 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRJ-201ENST00000418331 JAK2O60674 1132 aa24.12■■□□□ 1.45
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PTPRJ-201ENST00000418331 ABCA8O94911 1581 aa24.11■■□□□ 1.45
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PTPRJ-201ENST00000418331 CLEC11AQ9Y240 323 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRJ-201ENST00000418331 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
PTPRJ-201ENST00000418331 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
PTPRJ-201ENST00000418331 MYOM2P54296 1465 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRJ-201ENST00000418331 KRT222Q8N1A0 295 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRJ-201ENST00000418331 TRAF5O00463 557 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRJ-201ENST00000418331 PDE4DQ08499 809 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF569Q5MCW4 686 aa24.1■■□□□ 1.45
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