RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 MYSM1Q5VVJ2 828 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 SUSD4Q5VX71 490 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 AMIGO3Q86WK7 504 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNG4Q8TDN1 519 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 NCOA7Q8NI08 942 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 KIF28PB7ZC32 967 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 PTPN14Q15678 1187 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 APPBP2Q92624 585 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF213O14771 459 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 POLR3EQ9NVU0 708 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 GPAA1O43292 621 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 ITGA6P23229 1130 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 YEATS4O95619 227 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 NBPF11Q86T75 865 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 DENND2AQ9ULE3 1009 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 SMC2O95347 1197 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 BRAPQ7Z569 592 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 TTLL11Q8NHH1 800 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 NEDD4P46934 1319 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF202O95125 648 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 NYAP1Q6ZVC0 841 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 SEC31BQ9NQW1 1179 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 SYCP1Q15431 976 aa21.65■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 ANO1Q5XXA6 986 aa21.65■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 ISM2Q6H9L7 571 aa21.65■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 AIFM3Q96NN9 605 aa21.65■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 IFNKQ9P0W0 207 aa21.65■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 CAMTA2O94983 1202 aa21.65■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 RXRAP19793 462 aa21.64■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 CTSWP56202 376 aa21.64■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 PFKFB1P16118 471 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 GSDMDP57764 484 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 TMC6Q7Z403 805 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 NKX2-3Q8TAU0 364 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 MCAMP43121 646 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 DMTNQ08495 405 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 METTL24Q5JXM2 366 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 CNNM1Q9NRU3 951 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP21.63■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 V9GYY5 206 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 TRDNQ13061 729 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF34Q8IZ26 560 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 NBPF3Q9H094 633 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 FBXO3Q9UK99 471 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 APPP05067 770 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 NLRP12P59046 1061 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 SEPT12Q8IYM1 358 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 BPIFA3Q9BQP9 254 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 ALG1Q9BT22 464 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP21.61■■□□□ 1.052e-7■■■□□ 14.6
SH3BP1-202ENST00000417536 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 TAF1P21675 1872 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 CMA1P23946 247 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 CYB5R4Q7L1T6 521 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 TBC1D10CQ8IV04 446 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 IMPACTQ9P2X3 320 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 GNPATO15228 680 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP21.6■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 CSF1RP07333 972 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 ARMCX5Q6P1M9 558 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 C3orf67Q6ZVT6 689 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 PHKBQ93100 1093 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 IDH1O75874 414 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 FEZ1Q99689 392 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 SENP2Q9HC62 589 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 ADD2P35612 726 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 TPM4P67936 248 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 NCAPHQ15003 741 aa21.59■■□□□ 1.05
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