RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409043.5

XIRP2-202, Transcript of xin actin binding repeat containing 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene XIRP2, Length 3,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2-202ENST00000409043 USP28Q96RU2 1077 aa9.52□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 FEZ1Q99689 392 aa9.52□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa9.52□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 SEC31BQ9NQW1 1179 aa9.52□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 RCOR1Q9UKL0 485 aa9.52□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 PTPN14Q15678 1187 aa9.51□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 LRRN4CLQ8ND94 238 aa9.51□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 CLSTN2Q9H4D0 955 aa9.51□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 GJB4Q9NTQ9 266 aa9.51□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 LTBP4Q8N2S1 1624 aa9.51□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 ZNF532Q9HCE3 1301 aa9.51□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 PRC1O43663 620 aa9.51□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 UBE3CQ15386 1083 aa9.51□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 TAF3Q5VWG9 929 aa9.51□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 CEP135Q66GS9 1140 aa9.51□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 CYB5R4Q7L1T6 521 aa9.51□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 ACSBG1Q96GR2 724 aa9.51□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 EPC1Q9H2F5 836 aa9.51□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 SENP2Q9HC62 589 aa9.51□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa9.51□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 GUCY1B3Q02153 619 aa9.51□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 CBX8Q9HC52 389 aa9.51□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 KAT6BQ8WYB5 2073 aa9.5□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 NTSR2O95665 410 aa9.5□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 PRR29P0C7W0 189 aa9.5□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 PDE6AP16499 860 aa9.5□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 RASGRF1Q13972 1273 aa9.5□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa9.5□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa9.5□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 LPIN2Q92539 896 aa9.5□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 INCENPQ9NQS7 918 aa9.5□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 CCDC87Q9NVE4 849 aa9.5□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 LAMB2P55268 1798 aa9.5□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 MROH5Q6ZUA9 1318 aa9.5□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa9.5□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 SMTNL1A8MU46 457 aa9.5□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 ADAMTS2O95450 1211 aa9.5□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 SIK1P57059 783 aa9.5□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 ENGASEQ8NFI3 743 aa9.5□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 AK7Q96M32 723 aa9.5□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 ZNF213O14771 459 aa9.5□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 IDH1O75874 414 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 ATP6V1AP38606 617 aa9.5□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 DDB1Q16531 1140 aa9.5□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 HOMER1Q86YM7 354 aa9.5□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 NCOA7Q8NI08 942 aa9.5□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 NEDD4P46934 1319 aa9.49□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa9.49□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa9.49□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 WDR19Q8NEZ3 1342 aa9.49□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa9.49□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 KCNQ2O43526 872 aa9.49□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa9.49□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa9.49□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 LCMT1Q9UIC8 334 aa9.49□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 CFAP45Q9UL16 551 aa9.49□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa9.49□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 BCORQ6W2J9 1755 aa9.49□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 KIF28PB7ZC32 967 aa9.49□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 SKILP12757 684 aa9.49□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa9.49□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 SPATA5Q8NB90 893 aa9.49□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 CCDC34Q96HJ3 373 aa9.49□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 CASZ1Q86V15 1759 aa9.49□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 C3orf67Q6ZVT6 689 aa9.48□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 A0A1B0GUL6 1792 aa9.48□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 EP400Q96L91 3159 aa9.48□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 TIAM2Q8IVF5 1701 aa9.48□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 ECM29Q5VYK3 1845 aa9.48□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 RTL9Q8NET4 1388 aa9.48□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 GOLGA8BA8MQT2 603 aa9.48□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 PTPN21Q16825 1174 aa9.48□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 CCDC144BQ3MJ40 725 aa9.48□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa9.48□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa9.48□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa9.48□□□□□ -0.89
XIRP2-202ENST00000409043 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms