RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000396123.2

GREB1-206, Transcript of growth regulating estrogen receptor binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GREB1, Length 5,296 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1-206ENST00000396123 DSCC1Q9BVC3 393 aa14.77□□□□□ -0.04
GREB1-206ENST00000396123 NEK11Q8NG66 645 aa14.77□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 JAK2O60674 1132 aa14.77□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 ZNF75DP51815 510 aa14.77□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 LPIN2Q92539 896 aa14.77□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 ME3Q16798 604 aa14.76□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 SYNMO15061 1565 aa14.76□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 NEO1Q92859 1461 aa14.76□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 BICD1Q96G01 975 aa14.76□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 PLIN2Q99541 437 aa14.76□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 JAG2Q9Y219 1238 aa14.76□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 ZNF202O95125 648 aa14.76□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 FAM135BQ49AJ0 1406 aa14.76□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 DTNBO60941 627 aa14.75□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 PLCD1P51178 756 aa14.75□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 ARID5AQ03989 594 aa14.75□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 HDAC9Q9UKV0 1011 aa14.75□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 V9GY48 417 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 AATKQ6ZMQ8 1374 aa14.75□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 TTC6Q86TZ1 520 aa14.75□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 OGFOD1Q8N543 542 aa14.75□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 C8orf37Q96NL8 207 aa14.75□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 TUBBP07437 444 aa14.75□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 ZAP70P43403 619 aa14.75□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 LMBR1Q8WVP7 490 aa14.75□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 E7EWF7 191 aa14.75□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 KCNQ3O43525 872 aa14.75□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 CALRP27797 417 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 PRPHP41219 470 aa14.75□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 PPP1R2P41236 205 aa14.75□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 FANCCQ00597 558 aa14.75□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 BEND3Q5T5X7 828 aa14.75□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 PALD1Q9ULE6 856 aa14.75□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 KDRP35968 1356 aa14.75□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 KRT40Q6A162 431 aa14.74□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 INCENPQ9NQS7 918 aa14.74□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 PPP2R5BQ15173 497 aa14.74□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 LETM2Q2VYF4 491 aa14.74□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 MLKLQ8NB16 471 aa14.74□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 GTF3C6Q969F1 213 aa14.74□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 HSPA2P54652 639 aa14.74□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 DNAJC10Q8IXB1 793 aa14.74□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 IGSF22Q8N9C0 903 aa14.74□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 FERMT2Q96AC1 680 aa14.74□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 ERO1AQ96HE7 468 aa14.74□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 PTH1RQ03431 593 aa14.74□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 HS2ST1Q7LGA3 356 aa14.74□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 OPA1O60313 960 aa14.73□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 SV2BQ7L1I2 683 aa14.73□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 FSD2A1L4K1 749 aa14.73□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 NLRP12P59046 1061 aa14.73□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 CAPZA3Q96KX2 299 aa14.73□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 MYO5CQ9NQX4 1742 aa14.73□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa14.73□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 TEX11Q8IYF3 940 aa14.73□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 CCDC155Q8N6L0 562 aa14.73□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 ZNF532Q9HCE3 1301 aa14.73□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 LTKP29376 864 aa14.73□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 PHKBQ93100 1093 aa14.73□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 IMPACTQ9P2X3 320 aa14.73□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 A0A0D9SFI3 127 aa14.72□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 PRDM1O75626 825 aa14.72□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 FAM13AO94988 1023 aa14.72□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa14.72□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 TIGD1Q96MW7 591 aa14.72□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 MYOM2P54296 1465 aa14.72□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 TAF5LO75529 589 aa14.72□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 SPATA5Q8NB90 893 aa14.72□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 MYL10Q9BUA6 226 aa14.72□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa14.72□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 CTNND2Q9UQB3 1225 aa14.72□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 MROH5Q6ZUA9 1318 aa14.72□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 CCDC122Q5T0U0 273 aa14.72□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 GNPATO15228 680 aa14.72□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 IVLP07476 585 aa14.72□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 UBE4AQ14139 1066 aa14.72□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 TRIM14Q14142 442 aa14.72□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 STAP2Q9UGK3 403 aa14.72□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 ABCA8O94911 1581 aa14.72□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 TTC37Q6PGP7 1564 aa14.72□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 RHOXF2BP0C7M4 288 aa14.72□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa14.72□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 TCIRG1Q13488 830 aa14.72□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 RHOXF2Q9BQY4 288 aa14.72□□□□□ -0.05
GREB1-206ENST00000396123 RASAL2Q9UJF2 1139 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms