RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394272.7

HDDC3-202, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HDDC3, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-202ENST00000394272 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
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HDDC3-202ENST00000394272 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa24.11■■□□□ 1.45
HDDC3-202ENST00000394272 LDHCP07864 332 aa24.1■■□□□ 1.45
HDDC3-202ENST00000394272 TDO2P48775 406 aa24.1■■□□□ 1.45
HDDC3-202ENST00000394272 AOC3Q16853 763 aa24.1■■□□□ 1.45
HDDC3-202ENST00000394272 CERS5Q8N5B7 392 aa24.1■■□□□ 1.45
HDDC3-202ENST00000394272 ECE2O60344 883 aa24.09■■□□□ 1.45
HDDC3-202ENST00000394272 PPP4CP60510 307 aa24.09■■□□□ 1.45
HDDC3-202ENST00000394272 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
HDDC3-202ENST00000394272 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
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HDDC3-202ENST00000394272 ILDR2Q71H61 639 aa24.09■■□□□ 1.45
HDDC3-202ENST00000394272 TBC1D10CQ8IV04 446 aa24.09■■□□□ 1.45
HDDC3-202ENST00000394272 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
HDDC3-202ENST00000394272 ANKRD1Q15327 319 aa24.09■■□□□ 1.45
HDDC3-202ENST00000394272 SOGA3Q5TF21 947 aa24.09■■□□□ 1.45
HDDC3-202ENST00000394272 FOXD4L1Q9NU39 408 aa24.09■■□□□ 1.45
HDDC3-202ENST00000394272 GAKO14976 1311 aa24.08■■□□□ 1.45
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HDDC3-202ENST00000394272 PSME4Q14997 1843 aa24.08■■□□□ 1.44
HDDC3-202ENST00000394272 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
HDDC3-202ENST00000394272 NCOA7Q8NI08 942 aa24.07■■□□□ 1.44
HDDC3-202ENST00000394272 FBXW7Q969H0 707 aa24.07■■□□□ 1.44
HDDC3-202ENST00000394272 KCNQ5Q9NR82 932 aa24.07■■□□□ 1.44
HDDC3-202ENST00000394272 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa24.07■■□□□ 1.44
HDDC3-202ENST00000394272 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa24.07■■□□□ 1.44
HDDC3-202ENST00000394272 PPIP5K2O43314 1243 aa24.07■■□□□ 1.44
HDDC3-202ENST00000394272 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
HDDC3-202ENST00000394272 STRIP1Q5VSL9 837 aa24.07■■□□□ 1.44
HDDC3-202ENST00000394272 SLF2Q8IX21 1173 aa24.07■■□□□ 1.44
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HDDC3-202ENST00000394272 AGXT2Q9BYV1 514 aa24.07■■□□□ 1.44
HDDC3-202ENST00000394272 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
HDDC3-202ENST00000394272 BAG3O95817 575 aa24.06■■□□□ 1.44
HDDC3-202ENST00000394272 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
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HDDC3-202ENST00000394272 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa24.06■■□□□ 1.44
HDDC3-202ENST00000394272 TPCN1Q9ULQ1 816 aa24.06■■□□□ 1.44
HDDC3-202ENST00000394272 LARGE1O95461 756 aa24.05■■□□□ 1.44
HDDC3-202ENST00000394272 Q6ZUG5 572 aa24.05■■□□□ 1.44
HDDC3-202ENST00000394272 CERS3Q8IU89 383 aa24.05■■□□□ 1.44
HDDC3-202ENST00000394272 FBXL16Q8N461 479 aa24.05■■□□□ 1.44
HDDC3-202ENST00000394272 MXD3Q9BW11 206 aa24.05■■□□□ 1.44
HDDC3-202ENST00000394272 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
HDDC3-202ENST00000394272 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
HDDC3-202ENST00000394272 ANAPC4Q9UJX5 808 aa24.05■■□□□ 1.44
HDDC3-202ENST00000394272 LAMB1P07942 1786 aa24.05■■□□□ 1.44
HDDC3-202ENST00000394272 DACT2Q5SW24 774 aa24.04■■□□□ 1.44
HDDC3-202ENST00000394272 CHMP5Q9NZZ3 219 aa24.04■■□□□ 1.44
HDDC3-202ENST00000394272 BTDP43251 543 aa24.04■■□□□ 1.44
HDDC3-202ENST00000394272 CTDSPL2Q05D32 466 aa24.04■■□□□ 1.44
HDDC3-202ENST00000394272 PPARAQ07869 468 aa24.04■■□□□ 1.44
HDDC3-202ENST00000394272 ME3Q16798 604 aa24.04■■□□□ 1.44
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HDDC3-202ENST00000394272 VPS33BQ9H267 617 aa24.04■■□□□ 1.44
HDDC3-202ENST00000394272 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
HDDC3-202ENST00000394272 TACC3Q9Y6A5 838 aa24.04■■□□□ 1.44
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HDDC3-202ENST00000394272 AKNAD1Q5T1N1 836 aa24.03■■□□□ 1.44
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HDDC3-202ENST00000394272 COL4A5P29400 1685 aa24.03■■□□□ 1.44
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HDDC3-202ENST00000394272 YDJCA8MPS7 323 aa24.02■■□□□ 1.44
HDDC3-202ENST00000394272 MCM5P33992 734 aa24.02■■□□□ 1.44
HDDC3-202ENST00000394272 USP17L1Q7RTZ2 530 aa24.02■■□□□ 1.44
HDDC3-202ENST00000394272 KLHL34Q8N239 644 aa24.02■■□□□ 1.44
HDDC3-202ENST00000394272 NKX2-3Q8TAU0 364 aa24.02■■□□□ 1.44
HDDC3-202ENST00000394272 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
HDDC3-202ENST00000394272 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa24.02■■□□□ 1.44
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HDDC3-202ENST00000394272 CHST3Q7LGC8 479 aa24.02■■□□□ 1.44
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
HDDC3-202ENST00000394272 NAV1Q8NEY1 1877 aa24.02■■□□□ 1.44
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HDDC3-202ENST00000394272 USP17L12C9JPN9 530 aa24■■□□□ 1.43
HDDC3-202ENST00000394272 USP17L21D6R901 530 aa24■■□□□ 1.43
HDDC3-202ENST00000394272 F8W031 263 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
HDDC3-202ENST00000394272 PLCG2P16885 1265 aa24■■□□□ 1.43
HDDC3-202ENST00000394272 RHBDL3P58872 404 aa24■■□□□ 1.43
HDDC3-202ENST00000394272 ST3GAL1Q11201 340 aa24■■□□□ 1.43
HDDC3-202ENST00000394272 SBK1Q52WX2 424 aa24■■□□□ 1.43
HDDC3-202ENST00000394272 BRF1Q92994 677 aa24■■□□□ 1.43
HDDC3-202ENST00000394272 CNNM2Q9H8M5 875 aa24■■□□□ 1.43
HDDC3-202ENST00000394272 INCENPQ9NQS7 918 aa24■■□□□ 1.43
HDDC3-202ENST00000394272 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa24■■□□□ 1.43
HDDC3-202ENST00000394272 PRC1O43663 620 aa24■■□□□ 1.43
HDDC3-202ENST00000394272 MFSD6Q6ZSS7 791 aa24■■□□□ 1.43
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