RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360314.7

CASS4-201, Transcript of Cas scaffold protein family member 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASS4, Length 2,619 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4-201ENST00000360314 TPTE2Q6XPS3 522 aa14.53□□□□□ -0.08
CASS4-201ENST00000360314 NUP62CLQ9H1M0 184 aa14.53□□□□□ -0.08
CASS4-201ENST00000360314 LY9Q9HBG7 655 aa14.53□□□□□ -0.08
CASS4-201ENST00000360314 ZSWIM5Q9P217 1185 aa14.53□□□□□ -0.08
CASS4-201ENST00000360314 GNAT2P19087 354 aa14.53□□□□□ -0.08
CASS4-201ENST00000360314 AKNAD1Q5T1N1 836 aa14.53□□□□□ -0.08
CASS4-201ENST00000360314 VPS37DQ86XT2 251 aa14.53□□□□□ -0.08
CASS4-201ENST00000360314 BICD2Q8TD16 824 aa14.53□□□□□ -0.08
CASS4-201ENST00000360314 SDR42E1Q8WUS8 393 aa14.53□□□□□ -0.08
CASS4-201ENST00000360314 TMEM87BQ96K49 555 aa14.53□□□□□ -0.08
CASS4-201ENST00000360314 NR1I2O75469 434 aa14.52□□□□□ -0.08
CASS4-201ENST00000360314 CDC27P30260 824 aa14.52□□□□□ -0.08
CASS4-201ENST00000360314 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.08
CASS4-201ENST00000360314 SLC51AQ86UW1 340 aa14.52□□□□□ -0.08
CASS4-201ENST00000360314 MICU3Q86XE3 530 aa14.52□□□□□ -0.08
CASS4-201ENST00000360314 STK11IPQ8N1F8 1099 aa14.52□□□□□ -0.08
CASS4-201ENST00000360314 ZNF384Q8TF68 577 aa14.52□□□□□ -0.08
CASS4-201ENST00000360314 C8orf76Q96K31 380 aa14.52□□□□□ -0.08
CASS4-201ENST00000360314 TM4SF1P30408 202 aa14.52□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 TMEM67Q5HYA8 995 aa14.52□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 FAM196AQ6ZSG2 479 aa14.52□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 FBXO33Q7Z6M2 555 aa14.52□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa14.52□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 MYL10Q9BUA6 226 aa14.52□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 NACAP1Q9BZK3 213 aa14.52□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 LRRC4BQ9NT99 713 aa14.52□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 RCOR1Q9UKL0 485 aa14.52□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 ECM29Q5VYK3 1845 aa14.51□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 SMIM22K7EJ46 135 aa14.51□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 HSPA1LP34931 641 aa14.51□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 CLCN1P35523 988 aa14.51□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 SEPT12Q8IYM1 358 aa14.51□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa14.51□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 STAG1Q8WVM7 1258 aa14.51□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 AIFM3Q96NN9 605 aa14.51□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa14.51□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 MYH13Q9UKX3 1938 aa14.51□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa14.51□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 RFC4P35249 363 aa14.51□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 MFSD6Q6ZSS7 791 aa14.51□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 SGMS1Q86VZ5 419 aa14.51□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 MAP3K11Q16584 847 aa14.5□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 NFXL1Q6ZNB6 911 aa14.5□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 CNNM2Q9H8M5 875 aa14.5□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 ZBTB43O43298 467 aa14.5□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 NFIXQ14938 502 aa14.5□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 UVSSAQ2YD98 709 aa14.5□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 TRAPPC3LQ5T215 181 aa14.5□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 CKAP2LQ8IYA6 745 aa14.5□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 PHKBQ93100 1093 aa14.5□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa14.5□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 KRT23Q9C075 422 aa14.5□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 TNMDQ9H2S6 317 aa14.5□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 CLSTN2Q9H4D0 955 aa14.5□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 TOMM22Q9NS69 142 aa14.5□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 USP25Q9UHP3 1055 aa14.5□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 EP400Q96L91 3159 aa14.5□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 KIF28PB7ZC32 967 aa14.49□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 LIFRP42702 1097 aa14.49□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 PPARAQ07869 468 aa14.49□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 KLHL34Q8N239 644 aa14.49□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 GOLGA8AA7E2F4 631 aa14.49□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 NTRK3Q16288 839 aa14.49□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 ATL3Q6DD88 541 aa14.49□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 TXNRD3Q86VQ6 643 aa14.49□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa14.49□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 NPHP1O15259 732 aa14.48□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 CCDC192P0DO97 292 aa14.48□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 ZSCAN30Q86W11 494 aa14.48□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 ANKRD2Q9GZV1 360 aa14.48□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 MINDY4BA8MYZ0 360 aa14.48□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 TYRO3Q06418 890 aa14.48□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 ALG1Q9BT22 464 aa14.48□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 IRS2Q9Y4H2 1338 aa14.47□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 CCDC69A6NI79 296 aa14.47□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 UBE2Q2LH0YL09 131 aa14.47□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 SEMA3EO15041 775 aa14.47□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 HS1BP3Q53T59 392 aa14.47□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 CERKQ8TCT0 537 aa14.47□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 TAOK2Q9UL54 1235 aa14.47□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 SLC12A7Q9Y666 1083 aa14.47□□□□□ -0.09
CASS4-201ENST00000360314 MRVI1Q9Y6F6 885 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms