RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP22.63■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.62■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 STYK1Q6J9G0 422 aa22.62■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 MAST2Q6P0Q8 1798 aa22.61■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 NEDD4P46934 1319 aa22.61■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 B4E1Z4 1266 aa22.61■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 PTMSP20962 102 aa22.61■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 CNNM2Q9H8M5 875 aa22.61■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 INCENPQ9NQS7 918 aa22.61■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 MCTP1Q6DN14 999 aa22.61■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 MFSD6Q6ZSS7 791 aa22.61■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.61■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 NKX2-3Q8TAU0 364 aa22.61■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.61■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 RIMBP2O15034 1052 aa22.6■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 TRAK2O60296 914 aa22.6■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 PPARAQ07869 468 aa22.6■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 GRIK5Q16478 980 aa22.6■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 GIMAP6Q6P9H5 292 aa22.6■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.6■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 GSTO1P78417 241 aa22.59■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 KRT23Q9C075 422 aa22.59■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 COA1Q9GZY4 146 aa22.59■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.59■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 MINDY4BA8MYZ0 360 aa22.59■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 TIAM2Q8IVF5 1701 aa22.58■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 PDCP20941 246 aa22.58■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 CHRNA5P30532 468 aa22.58■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 CCT2P78371 535 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.58■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 DUOX1Q9NRD9 1551 aa22.57■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 JAK2O60674 1132 aa22.57■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.57■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.57■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 TMEM87BQ96K49 555 aa22.57■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 ZSWIM5Q9P217 1185 aa22.57■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.57■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa22.57■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 KDM4AO75164 1064 aa22.57■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 LDHCP07864 332 aa22.57■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.57■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.57■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.57■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22.57■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 MTMR6Q9Y217 621 aa22.57■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 CHD4Q14839 1912 aa22.56■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 CTR9Q6PD62 1173 aa22.56■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa22.56■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 CNKSR1Q969H4 720 aa22.56■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.56■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.55■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa22.55■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 TOMM22Q9NS69 142 aa22.55■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 CTDNEP1O95476 244 aa22.55■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 BAG3O95817 575 aa22.55■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 F13A1P00488 732 aa22.55■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 GTF2IP78347 998 aa22.55■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 EYA3Q99504 573 aa22.55■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 USP17L12C9JPN9 530 aa22.54■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 USP17L21D6R901 530 aa22.54■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 PPP4CP60510 307 aa22.54■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.54■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa22.54■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa22.53■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 GOLGA8BA8MQT2 603 aa22.53■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 GSE1Q14687 1217 aa22.53■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 CCDC125Q86Z20 511 aa22.53■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 DDX11Q96FC9 970 aa22.53■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.53■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.53■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 SMIM22K7EJ46 135 aa22.53■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 DOK7Q18PE1 504 aa22.53■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 TMEM67Q5HYA8 995 aa22.53■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 SLX4Q8IY92 1834 aa22.53■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 PTPDC1A2A3K4 754 aa22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms