RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327359.7

BRF1-201, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene BRF1, Length 2,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-201ENST00000327359 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa18.51■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 LRP6O75581 1613 aa18.51■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 TUBB4AP04350 444 aa18.51■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 TRIM65Q6PJ69 517 aa18.51■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 CARMIL3Q8ND23 1372 aa18.5■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 A0A1B0GUL7 405 aa18.5■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 KCNQ2O43526 872 aa18.5■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 TADA3O75528 432 aa18.5■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 NEK11Q8NG66 645 aa18.5■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 HAUS7Q99871 368 aa18.5■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 RTEL1Q9NZ71 1219 aa18.5■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 CEP126Q9P2H0 1117 aa18.5■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 A0A0G2JLW4 131 aa18.49■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 A0A1W2PQ27 194 aa18.49■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 A0A1W2PQ64 194 aa18.49■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 A0A1W2PQD8 194 aa18.49■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 NRDCO43847 1150 aa18.49■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa18.49■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 NGLY1Q96IV0 654 aa18.49■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 CLIC4Q9Y696 253 aa18.49■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 GOLIM4O00461 696 aa18.49■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 NLRP12P59046 1061 aa18.49■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 LINC00301Q8NCQ3 95 aa18.49■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 MNS1Q8NEH6 495 aa18.49■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 RFX7Q2KHR2 1363 aa18.49■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 CIAO1O76071 339 aa18.48■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 ATP1A3P13637 1013 aa18.48■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 FANCCQ00597 558 aa18.48■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 CARD6Q9BX69 1037 aa18.48■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 AGXT2Q9BYV1 514 aa18.48■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 EPC1Q9H2F5 836 aa18.48■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa18.48■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 URI1O94763 535 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 FDPSP14324 419 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 CRKLP46109 303 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 SIK1P57059 783 aa18.48■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 TPM4P67936 248 aa18.48■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa18.48■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 CHST3Q7LGC8 479 aa18.48■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 HSD3B7Q9H2F3 369 aa18.48■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 SASH3O75995 380 aa18.47■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 CSF1RP07333 972 aa18.47■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 ST5P78524 1137 aa18.47■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa18.47■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 ITPK1Q13572 414 aa18.47■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 STK38Q15208 465 aa18.47■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 ISM2Q6H9L7 571 aa18.47■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 UBXN6Q9BZV1 441 aa18.47■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 GREM2Q9H772 168 aa18.47■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 GPR108Q9NPR9 543 aa18.47■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 PARP3Q9Y6F1 533 aa18.47■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 TEX35Q5T0J7 233 aa18.47■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 BARGINQ6ZT62 677 aa18.47■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 REXO1L1PQ8IX06 675 aa18.47■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 DPF2Q92785 391 aa18.47■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 PLA2G12BQ9BX93 195 aa18.47■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 CCDC87Q9NVE4 849 aa18.47■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 EFCAB8A8MWE9 144 aa18.46■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 CCP110O43303 1012 aa18.46■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 ITGA6P23229 1130 aa18.46■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 ADORA1P30542 326 aa18.46■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 GOLGA8FQ08AF8 430 aa18.46■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa18.46■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 CERS3Q8IU89 383 aa18.46■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 TTLL11Q8NHH1 800 aa18.46■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 SMARCE1Q969G3 411 aa18.46■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 PAG1Q9NWQ8 432 aa18.46■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 SLIT2O94813 1529 aa18.46■□□□□ 0.55
BRF1-201ENST00000327359 ZNF202O95125 648 aa18.46■□□□□ 0.54
BRF1-201ENST00000327359 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.54
BRF1-201ENST00000327359 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.54
BRF1-201ENST00000327359 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.54
BRF1-201ENST00000327359 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.54
BRF1-201ENST00000327359 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.54
BRF1-201ENST00000327359 UBN2Q6ZU65 1347 aa18.45■□□□□ 0.54
BRF1-201ENST00000327359 TBC1D8O95759 1140 aa18.45■□□□□ 0.54
BRF1-201ENST00000327359 EIF5P55010 431 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
BRF1-201ENST00000327359 CTSWP56202 376 aa18.45■□□□□ 0.54
BRF1-201ENST00000327359 EVCP57679 992 aa18.45■□□□□ 0.54
BRF1-201ENST00000327359 PTPN21Q16825 1174 aa18.45■□□□□ 0.54
BRF1-201ENST00000327359 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
BRF1-201ENST00000327359 CCDC158Q5M9N0 1113 aa18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms