RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317243.9

ZNF554-201, Transcript of zinc finger protein 554, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF554, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554-201ENST00000317243 SLC20A2Q08357 652 aa22.49■■□□□ 1.19
ZNF554-201ENST00000317243 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
ZNF554-201ENST00000317243 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa22.48■■□□□ 1.19
ZNF554-201ENST00000317243 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
ZNF554-201ENST00000317243 AIFM3Q96NN9 605 aa22.48■■□□□ 1.19
ZNF554-201ENST00000317243 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa22.48■■□□□ 1.19
ZNF554-201ENST00000317243 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.48■■□□□ 1.19
ZNF554-201ENST00000317243 CCZ1BP86790 482 aa22.48■■□□□ 1.19
ZNF554-201ENST00000317243 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
ZNF554-201ENST00000317243 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
ZNF554-201ENST00000317243 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.48■■□□□ 1.19
ZNF554-201ENST00000317243 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
ZNF554-201ENST00000317243 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.48■■□□□ 1.19
ZNF554-201ENST00000317243 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
ZNF554-201ENST00000317243 ADD2P35612 726 aa22.47■■□□□ 1.19
ZNF554-201ENST00000317243 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.47■■□□□ 1.19
ZNF554-201ENST00000317243 FHOD1Q9Y613 1164 aa22.47■■□□□ 1.19
ZNF554-201ENST00000317243 SALL1Q9NSC2 1324 aa22.47■■□□□ 1.19
ZNF554-201ENST00000317243 DDB1Q16531 1140 aa22.47■■□□□ 1.19
ZNF554-201ENST00000317243 STX1AQ16623 288 aa22.47■■□□□ 1.19
ZNF554-201ENST00000317243 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.47■■□□□ 1.19
ZNF554-201ENST00000317243 MYH7P12883 1935 aa22.46■■□□□ 1.19
ZNF554-201ENST00000317243 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
ZNF554-201ENST00000317243 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.46■■□□□ 1.19
ZNF554-201ENST00000317243 GOLGA8BA8MQT2 603 aa22.46■■□□□ 1.19
ZNF554-201ENST00000317243 NEMFO60524 1076 aa22.46■■□□□ 1.19
ZNF554-201ENST00000317243 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
ZNF554-201ENST00000317243 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
ZNF554-201ENST00000317243 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa22.46■■□□□ 1.19
ZNF554-201ENST00000317243 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.45■■□□□ 1.19
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF213O14771 459 aa22.45■■□□□ 1.19
ZNF554-201ENST00000317243 KINO60870 393 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.19
ZNF554-201ENST00000317243 CLCN6P51797 869 aa22.45■■□□□ 1.19
ZNF554-201ENST00000317243 MYL10Q9BUA6 226 aa22.45■■□□□ 1.19
ZNF554-201ENST00000317243 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.45■■□□□ 1.19
ZNF554-201ENST00000317243 SMIM22K7EJ46 135 aa22.45■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 PDE6AP16499 860 aa22.45■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 ME1P48163 572 aa22.45■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 RASGRF1Q13972 1273 aa22.45■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa22.45■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 TAF1P21675 1872 aa22.45■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 CAVIN2O95810 425 aa22.44■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 BCAMP50895 628 aa22.44■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.44■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 SIK1P57059 783 aa22.44■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 FBXO3Q9UK99 471 aa22.44■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 SPEF2Q9C093 1822 aa22.44■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 B4E1Z4 1266 aa22.44■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 PRKAB2O43741 272 aa22.44■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 SARM1Q6SZW1 724 aa22.44■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.44■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 AOPEPQ8N6M6 819 aa22.44■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.43■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.43■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 PLA2G4AP47712 749 aa22.43■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 PIP4K2BP78356 416 aa22.43■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.43■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa22.43■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 MAGEB6Q8N7X4 407 aa22.43■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 NEK11Q8NG66 645 aa22.43■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.43■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 NEDD4P46934 1319 aa22.42■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 FAM193AP78312 1265 aa22.42■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.42■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 FSIP1Q8NA03 581 aa22.42■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 ARMT1Q9H993 441 aa22.42■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 SYT10Q6XYQ8 523 aa22.42■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa22.41■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 KIF28PB7ZC32 967 aa22.41■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 CAMTA2O94983 1202 aa22.41■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 FGFR2P21802 821 aa22.41■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa22.41■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 RCOR1Q9UKL0 485 aa22.41■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.41■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 CREBRFQ8IUR6 639 aa22.41■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 NCOA7Q8NI08 942 aa22.41■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.4■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 CTAGE5O15320 804 aa22.4■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 FAM182BQ5T319 152 aa22.4■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 MIGA1Q8NAN2 632 aa22.4■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 PHKBQ93100 1093 aa22.4■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.4■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 SDF4Q9BRK5 362 aa22.4■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 ANO10Q9NW15 660 aa22.4■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 CLIC4Q9Y696 253 aa22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.5 ms