RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297316.4

SOX17-201, Transcript of SRY-box 17, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOX17, Length 2,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17-201ENST00000297316 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
SOX17-201ENST00000297316 NPR1P16066 1061 aa25.19■■□□□ 1.62
SOX17-201ENST00000297316 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
SOX17-201ENST00000297316 ZNF804AQ7Z570 1209 aa25.19■■□□□ 1.62
SOX17-201ENST00000297316 USP48Q86UV5 1035 aa25.19■■□□□ 1.62
SOX17-201ENST00000297316 C6orf229H3BNL8 230 aa25.18■■□□□ 1.62
SOX17-201ENST00000297316 CDC37L1Q7L3B6 337 aa25.18■■□□□ 1.62
SOX17-201ENST00000297316 STK11IPQ8N1F8 1099 aa25.18■■□□□ 1.62
SOX17-201ENST00000297316 NCOA7Q8NI08 942 aa25.18■■□□□ 1.62
SOX17-201ENST00000297316 PODXL2Q9NZ53 605 aa25.18■■□□□ 1.62
SOX17-201ENST00000297316 SMIM22K7EJ46 135 aa25.18■■□□□ 1.62
SOX17-201ENST00000297316 PDE6BP35913 854 aa25.18■■□□□ 1.62
SOX17-201ENST00000297316 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SOX17-201ENST00000297316 SP8Q8IXZ3 490 aa25.18■■□□□ 1.62
SOX17-201ENST00000297316 NEDD4P46934 1319 aa25.18■■□□□ 1.62
SOX17-201ENST00000297316 PRC1O43663 620 aa25.17■■□□□ 1.62
SOX17-201ENST00000297316 TDO2P48775 406 aa25.17■■□□□ 1.62
SOX17-201ENST00000297316 CD209Q9NNX6 404 aa25.17■■□□□ 1.62
SOX17-201ENST00000297316 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa25.17■■□□□ 1.62
SOX17-201ENST00000297316 PFKFB2O60825 505 aa25.17■■□□□ 1.62
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SOX17-201ENST00000297316 GNAT2P19087 354 aa25.16■■□□□ 1.62
SOX17-201ENST00000297316 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa25.16■■□□□ 1.62
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SOX17-201ENST00000297316 PANK2Q9BZ23 570 aa25.16■■□□□ 1.62
SOX17-201ENST00000297316 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
SOX17-201ENST00000297316 B4E1Z4 1266 aa25.15■■□□□ 1.62
SOX17-201ENST00000297316 CYB5R4Q7L1T6 521 aa25.15■■□□□ 1.62
SOX17-201ENST00000297316 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP25.15■■□□□ 1.62
SOX17-201ENST00000297316 ZMYM6O95789 1325 aa25.15■■□□□ 1.62
SOX17-201ENST00000297316 RIMBP2O15034 1052 aa25.15■■□□□ 1.62
SOX17-201ENST00000297316 MCM5P33992 734 aa25.15■■□□□ 1.62
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SOX17-201ENST00000297316 MAST2Q6P0Q8 1798 aa25.15■■□□□ 1.62
SOX17-201ENST00000297316 MASTLQ96GX5 879 aa25.14■■□□□ 1.62
SOX17-201ENST00000297316 QSER1Q2KHR3 1735 aa25.14■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 CTDNEP1O95476 244 aa25.14■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 BAG6P46379 1132 aa25.14■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 CCT2P78371 535 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 FERMT3Q86UX7 667 aa25.14■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 C2CD5Q86YS7 1000 aa25.14■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 DDX11Q96FC9 970 aa25.14■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 NACAP1Q9BZK3 213 aa25.14■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 GRPEL1Q9HAV7 217 aa25.14■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 DUOX1Q9NRD9 1551 aa25.14■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 CHRNA5P30532 468 aa25.13■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 TMEM87AQ8NBN3 555 aa25.13■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 TRDNQ13061 729 aa25.13■■□□□ 1.61
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SOX17-201ENST00000297316 WDR66Q8TBY9 1149 aa25.13■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa25.12■■□□□ 1.61
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SOX17-201ENST00000297316 DIXDC1Q155Q3 683 aa25.12■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa25.12■■□□□ 1.61
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SOX17-201ENST00000297316 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa25.12■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 LDHBP07195 334 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 IL1R1P14778 569 aa25.12■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 FAM173BQ6P4H8 233 aa25.12■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 TMC4Q7Z404 712 aa25.12■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 SLX4Q8IY92 1834 aa25.11■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 SALL1Q9NSC2 1324 aa25.11■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 MINDY4BA8MYZ0 360 aa25.11■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 FIBPO43427 364 aa25.11■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 MRE11P49959 708 aa25.11■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 EVX2Q03828 476 aa25.11■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 TIAM2Q8IVF5 1701 aa25.11■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 MYH2Q9UKX2 1941 aa25.11■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 MBD3O95983 291 aa25.11■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 PDCP20941 246 aa25.11■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 ZNF445P59923 1031 aa25.11■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 FBXL16Q8N461 479 aa25.11■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 SENP2Q9HC62 589 aa25.11■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 ZBTB22O15209 634 aa25.1■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 MPNDQ8N594 471 aa25.1■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa25.1■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 AKNAD1Q5T1N1 836 aa25.09■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 EVCP57679 992 aa25.09■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 PPARAQ07869 468 aa25.09■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 KDM4AO75164 1064 aa25.08■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 FAM43AQ8N2R8 423 aa25.08■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa25.08■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 PTPDC1A2A3K4 754 aa25.08■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 H0YIN7 160 aa25.08■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 TPRNQ4KMQ1 711 aa25.08■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa25.08■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 TOMM22Q9NS69 142 aa25.08■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 ZSWIM5Q9P217 1185 aa25.08■■□□□ 1.61
SOX17-201ENST00000297316 MFSD6Q6ZSS7 791 aa25.07■■□□□ 1.6
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