RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM35Q9UPQ4 493 aa23.78■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 EEF2P13639 858 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF174Q15697 407 aa23.78■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 GPATCH11Q8N954 259 aa23.78■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 MTUS1Q9ULD2 1270 aa23.78■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 B4E1Z4 1266 aa23.77■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa23.77■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 FAM76AQ8TAV0 307 aa23.77■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 PPP1R9BQ96SB3 815 aa23.77■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 DBNDD2Q9BQY9 259 aa23.77■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa23.77■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 SBNO1A3KN83 1393 aa23.77■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 VWA3BQ502W6 1294 aa23.77■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 C19orf44Q9H6X5 657 aa23.77■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF75DP51815 510 aa23.77■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF790Q6PG37 636 aa23.77■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.77■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 RNF123Q5XPI4 1314 aa23.76■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 CPLX4Q7Z7G2 160 aa23.76■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 SELENOSQ9BQE4 189 aa23.76■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 PLCB3Q01970 1234 aa23.76■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.76■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 FANCCQ00597 558 aa23.76■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 CALCOCO2Q13137 446 aa23.76■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 KBTBD3Q8NAB2 608 aa23.76■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa23.76■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 B4DLN1 442 aa23.75■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 PPP2R5BQ15173 497 aa23.75■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 MICALL1Q8N3F8 863 aa23.75■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 TRAF5O00463 557 aa23.75■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 KIF24Q5T7B8 1368 aa23.75■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 MXRA7P84157 204 aa23.75■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 CYP26C1Q6V0L0 522 aa23.75■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 MSANTD4Q8NCY6 345 aa23.75■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 PLIN2Q99541 437 aa23.75■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 CBX8Q9HC52 389 aa23.75■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa23.74■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 ZEB2O60315 1214 aa23.74■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 LETM2Q2VYF4 491 aa23.74■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 CNNM4Q6P4Q7 775 aa23.74■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 TM6SF1Q9BZW5 370 aa23.74■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 ZBTB16Q05516 673 aa23.74■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC50Q8IVM0 306 aa23.74■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 JAKMIP2Q96AA8 810 aa23.74■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 CTNND2Q9UQB3 1225 aa23.74■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 SPATA24Q86W54 205 aa23.74■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC26Q8TAB7 109 aa23.74■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 FAM227BQ96M60 508 aa23.73■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 SMC6Q96SB8 1091 aa23.73■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 CEP83Q9Y592 693 aa23.73■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 PZPP20742 1482 aa23.73■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 PARP10Q53GL7 1025 aa23.73■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 GJC1P36383 396 aa23.73■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 TERF1P54274 439 aa23.73■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 PDE4DQ08499 809 aa23.73■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 LMBRD1Q9NUN5 540 aa23.72■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 TLDC2A0PJX2 215 aa23.72■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 GPAA1O43292 621 aa23.72■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 RAPGEF1Q13905 1077 aa23.72■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 CABLES1Q8TDN4 633 aa23.72■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 ITGA6P23229 1130 aa23.72■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 NLRP12P59046 1061 aa23.72■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 FAM89AQ96GI7 184 aa23.72■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 XAGE2Q96GT9 111 aa23.72■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 NUP58Q9BVL2 599 aa23.72■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 VPS16Q9H269 839 aa23.72■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 TBX22Q9Y458 520 aa23.72■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 FAM173BQ6P4H8 233 aa23.71■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 SAMD15Q9P1V8 674 aa23.71■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 SH3TC1Q8TE82 1336 aa23.71■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGAP6O43182 974 aa23.71■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.71■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF202O95125 648 aa23.71■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 EPB41P11171 864 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 PPP1R7Q15435 360 aa23.71■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa23.71■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa23.71■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 EYA3Q99504 573 aa23.71■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.39
CCSAP-201ENST00000284617 SEL1L2Q5TEA6 688 aa23.7■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 TMTC1Q8IUR5 882 aa23.7■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 GLT8D2Q9H1C3 349 aa23.7■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 USP19O94966 1318 aa23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms