RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263434.5

PTPRH-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type H, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRH, Length 3,343 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRH-201ENST00000263434 MYL5Q02045 173 aa17.7■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 SLC39A14Q15043 492 aa17.7■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 KARSQ15046 597 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 TEX35Q5T0J7 233 aa17.7■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 CPLX3Q8WVH0 158 aa17.7■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 STRN4Q9NRL3 753 aa17.7■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 ETF1P62495 437 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 CTDSPL2Q05D32 466 aa17.7■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 PDE4BQ07343 736 aa17.7■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 GOLGA8AA7E2F4 631 aa17.69■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 IARSP41252 1262 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 GNG11P61952 73 aa17.69■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 GRIN1Q05586 938 aa17.69■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa17.69■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 MCAMP43121 646 aa17.69■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 KLHL10Q6JEL2 608 aa17.69■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 CCDC34Q96HJ3 373 aa17.69■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 ATF3P18847 181 aa17.69■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 CCDC191Q8NCU4 936 aa17.69■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 COBLO75128 1261 aa17.68■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 TMEM67Q5HYA8 995 aa17.68■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 HSD3B7Q9H2F3 369 aa17.68■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa17.68■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 KCNH3Q9ULD8 1083 aa17.68■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 BTBD18B2RXH4 712 aa17.67■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 FANCGO15287 622 aa17.67■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 ZBTB43O43298 467 aa17.67■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 CHMP4CQ96CF2 233 aa17.67■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 NBPF3Q9H094 633 aa17.67■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 AKAP2Q9Y2D5 859 aa17.67■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 CCDC102BQ68D86 513 aa17.67■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 TMCO3Q6UWJ1 677 aa17.67■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 NUP133Q8WUM0 1156 aa17.67■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 GPR108Q9NPR9 543 aa17.67■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 APOA5Q6Q788 366 aa17.67■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 ZNF532Q9HCE3 1301 aa17.66■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa17.66■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 GUCY1A2P33402 732 aa17.66■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 STX17P56962 302 aa17.66■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 EVCP57679 992 aa17.66■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 WWC3Q9ULE0 1092 aa17.66■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 PRR29P0C7W0 189 aa17.66■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 JMYQ8N9B5 988 aa17.66■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP17.66■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP17.66■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP17.65■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 CASP1P29466 404 aa17.65■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 AIDAQ96BJ3 306 aa17.65■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 WDR24Q96S15 920 aa17.65■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 GREM2Q9H772 168 aa17.65■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP17.65■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa17.65■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 L2HGDHQ9H9P8 463 aa17.65■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 CBFA2T2O43439 604 aa17.65■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa17.65■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 MYH15Q9Y2K3 1946 aa17.64■□□□□ 0.42
PTPRH-201ENST00000263434 BMP6P22004 513 aa17.64■□□□□ 0.41
PTPRH-201ENST00000263434 ITGA6P23229 1130 aa17.64■□□□□ 0.41
PTPRH-201ENST00000263434 PHKA1P46020 1223 aa17.64■□□□□ 0.41
PTPRH-201ENST00000263434 MTF1Q14872 753 aa17.64■□□□□ 0.41
PTPRH-201ENST00000263434 BPIFA3Q9BQP9 254 aa17.64■□□□□ 0.41
PTPRH-201ENST00000263434 LZTFL1Q9NQ48 299 aa17.64■□□□□ 0.41
PTPRH-201ENST00000263434 PRDM11Q9NQV5 511 aa17.64■□□□□ 0.41
PTPRH-201ENST00000263434 SERTAD1Q9UHV2 236 aa17.64■□□□□ 0.41
PTPRH-201ENST00000263434 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa17.64■□□□□ 0.41
PTPRH-201ENST00000263434 FHOD1Q9Y613 1164 aa17.64■□□□□ 0.41
PTPRH-201ENST00000263434 ZMYM6O95789 1325 aa17.64■□□□□ 0.41
PTPRH-201ENST00000263434 AFMP43652 599 aa17.64■□□□□ 0.41
PTPRH-201ENST00000263434 NR5A1Q13285 461 aa17.64■□□□□ 0.41
PTPRH-201ENST00000263434 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP17.64■□□□□ 0.41
PTPRH-201ENST00000263434 SLC12A7Q9Y666 1083 aa17.64■□□□□ 0.41
PTPRH-201ENST00000263434 GYS2P54840 703 aa17.64■□□□□ 0.41
PTPRH-201ENST00000263434 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP17.64■□□□□ 0.41
PTPRH-201ENST00000263434 TRIM65Q6PJ69 517 aa17.64■□□□□ 0.41
PTPRH-201ENST00000263434 KRBA2Q6ZNG9 492 aa17.64■□□□□ 0.41
PTPRH-201ENST00000263434 USP49Q70CQ1 688 aa17.64■□□□□ 0.41
PTPRH-201ENST00000263434 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP17.64■□□□□ 0.41
PTPRH-201ENST00000263434 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
PTPRH-201ENST00000263434 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP17.63■□□□□ 0.41
PTPRH-201ENST00000263434 CASQ1P31415 396 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRH-201ENST00000263434 VSTM4Q8IW00 320 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRH-201ENST00000263434 DNAJC10Q8IXB1 793 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRH-201ENST00000263434 STAMQ92783 540 aa17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms