RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000108593.7

Ctdnep1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctdnep1, Length 1,627 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mum1l1Q4VA55 681 aa36.4■■■■□ 3.42
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zcchc17Q9ESX4 241 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Igf2bp3Q9CPN8 579 aaKnown RBP36.39■■■■□ 3.42
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 UtrnE9Q6R7 3430 aa36.38■■■■□ 3.41
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Flvcr1B2RXV4 560 aa36.37■■■■□ 3.41
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Sept14Q9DA97 430 aa36.37■■■■□ 3.41
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Bnip3O55003 187 aa36.36■■■■□ 3.41
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 DnttP09838 530 aa36.36■■■■□ 3.41
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Prss40A6H6T1 365 aa36.35■■■■□ 3.41
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slc27a3O88561 667 aa36.35■■■■□ 3.41
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Kcnq3Q8K3F6 873 aa36.35■■■■□ 3.41
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Klhdc9Q3USL1 350 aa36.34■■■■□ 3.41
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ubxn10Q8BG34 277 aa36.34■■■■□ 3.41
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Q3UJP5 209 aa36.33■■■■□ 3.41
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pmfbp1Q9WVQ0 1022 aa36.33■■■■□ 3.41
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tsc2Q61037 1814 aa36.33■■■■□ 3.41
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Prpf38aQ4FK66 312 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.4
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ehmt1Q5DW34 1296 aa36.32■■■■□ 3.4
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Klrg2Q3UM83 387 aa36.31■■■■□ 3.4
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Lrrfip2Q91WK0 415 aa36.31■■■■□ 3.4
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Bcorl1A2AQH4 1781 aa36.31■■■■□ 3.4
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Dennd3A2RT67 1274 aa36.3■■■■□ 3.4
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Yy1Q00899 414 aa36.3■■■■□ 3.4
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tmem39bQ810L4 492 aa36.3■■■■□ 3.4
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 PaoxQ8C0L6 504 aa36.3■■■■□ 3.4
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Aldh1b1Q9CZS1 519 aa36.3■■■■□ 3.4
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ak7Q9D2H2 614 aa36.3■■■■□ 3.4
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ifit2Q64112 472 aa36.3■■■■□ 3.4
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pramel6Q810Y9 485 aa36.3■■■■□ 3.4
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ccdc39Q9D5Y1 937 aa36.3■■■■□ 3.4
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ddx20Q9JJY4 825 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Lgr6Q3UVD5 967 aa36.29■■■■□ 3.4
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ctr9Q62018 1173 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fam178bQ24JP3 464 aa36.28■■■■□ 3.4
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Abhd15Q5F2F2 459 aa36.28■■■■□ 3.4
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 MccE9PWI3 1003 aa36.27■■■■□ 3.4
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Akap4Q60662 849 aa36.27■■■■□ 3.4
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 HelbQ6NVF4 1074 aa36.27■■■■□ 3.4
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 AfdnQ9QZQ1 1820 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ppip5k2Q6ZQB6 1129 aa36.26■■■■□ 3.4
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mlh1Q9JK91 760 aa36.26■■■■□ 3.4
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 B3galt4Q9Z0F0 371 aa36.26■■■■□ 3.4
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rad50P70388 1312 aa36.26■■■■□ 3.4
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Polr2aP08775 1970 aaKnown RBP36.26■■■■□ 3.4
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pcdh15Q99PJ1 1943 aa36.26■■■■□ 3.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ppm1gQ61074 542 aa36.26■■■■□ 3.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fam186bD3Z420 943 aa36.25■■■■□ 3.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tmc4Q7TQ65 694 aa36.25■■■■□ 3.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Atxn7Q8R4I1 867 aa36.25■■■■□ 3.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ak2Q9WTP6 239 aa36.25■■■■□ 3.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Scn10aQ6QIY3 1958 aa36.24■■■■□ 3.39
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Vcam1P29533 739 aa36.24■■■■□ 3.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr118Q7TRJ6 321 aa36.24■■■■□ 3.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rbm8aQ9CWZ3 174 aa36.24■■■■□ 3.39
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tll1Q62381 1013 aa36.19■■■■□ 3.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ttc12Q8BW49 704 aa36.19■■■■□ 3.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tmod2Q9JKK7 351 aa36.19■■■■□ 3.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ugt1a5B2RT14 529 aa36.19■■■■□ 3.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tbc1d32Q3URV1 1296 aa36.19■■■■□ 3.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 GorabQ8BRM2 368 aa36.19■■■■□ 3.38
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Txnrd2Q9JLT4 524 aa36.19■■■■□ 3.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Vmn2r68L7N2B3 851 aa36.18■■■■□ 3.38
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