RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047904.3

Hoxd4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Hoxd4, Length 2,560 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 HellsQ60848 821 aa19.75■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 4930504O13RikQ8C5Z9 145 aa19.75■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ccdc186Q8C9S4 917 aa19.75■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ccdc73Q8CDM4 1066 aa19.75■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Eif3bQ8JZQ9 803 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Irgm2A0A140LIF8 407 aa19.74■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ehd2Q8BH64 543 aa19.74■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Abca15E9PWH4 1668 aa19.74■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm6588E9Q3K0 461 aa19.74■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Dpf2Q61103 391 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ccdc82Q6PG04 518 aa19.74■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Nxf7Q80SZ6 620 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Lrrc1Q80VQ1 524 aa19.74■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Dydc1Q9D9T0 175 aa19.74■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tpcn1Q9EQJ0 817 aa19.74■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Exoc5Q3TPX4 708 aa19.73■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 MmeQ61391 750 aa19.73■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Zfp202Q8C879 641 aa19.73■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Paf1Q8K2T8 535 aa19.73■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ccdc12Q8R344 166 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tmc2Q8R4P4 888 aa19.73■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ssfa2Q922B9 1252 aa19.73■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cdhr2E9Q7P9 1308 aa19.73■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Myo3bQ1EG27 1305 aa19.73■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 MypnQ5DTJ9 1315 aa19.73■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cep63Q3UPP8 700 aa19.73■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 PsdQ5DTT2 1024 aa19.73■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ppp1r1bQ60829 194 aa19.73■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cadps2Q8BYR5 1297 aa19.73■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Znrd1-asQ8R0E5 213 aa19.73■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 FocadA2AKG8 1798 aa19.73■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cct2P80314 535 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Fam107bQ3TGF2 131 aa19.72■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Clic4Q9QYB1 253 aa19.72■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Letm1Q9Z2I0 738 aa19.72■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Adora1Q60612 326 aa19.72■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Q8BT18 775 aa19.72■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Krt222Q8CCX5 294 aa19.72■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Slc26a8Q8R0C3 999 aa19.72■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Osbpl1aQ91XL9 950 aa19.72■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tulp1Q9Z273 543 aa19.72■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Bcl9lQ67FY2 1494 aa19.71■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Slc7a3P70423 618 aa19.71■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cct5P80316 541 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ppm1eQ80TL0 749 aa19.71■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 SyncQ9EPM5 470 aa19.71■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 NpcdF8VQB8 469 aa19.71■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ccdc191J3QQ27 883 aa19.71■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 ItpripQ3TNL8 555 aa19.71■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Usp27Q8CEG8 438 aa19.71■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rrs1Q9CYH6 365 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ccdc47Q9D024 483 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Dctpp1Q9QY93 170 aa19.71■□□□□ 0.75
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tbx2Q60707 711 aa19.7■□□□□ 0.74
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Large1Q9Z1M7 756 aa19.7■□□□□ 0.74
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm43638A0A0J9YU36 694 aa19.7■□□□□ 0.74
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Plekhd1B2RPU2 505 aa19.7■□□□□ 0.74
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Vsnl1P62761 191 aa19.7■□□□□ 0.74
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 GclcP97494 637 aa19.7■□□□□ 0.74
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rassf10Q8BL43 508 aa19.7■□□□□ 0.74
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Stk38Q91VJ4 465 aa19.7■□□□□ 0.74
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Syf2Q9D198 242 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 RabggtaQ9JHK4 567 aa19.7■□□□□ 0.74
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Klra9Q2TJJ8 266 aa19.69■□□□□ 0.74
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rnf40Q3U319 1001 aa19.69■□□□□ 0.74
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Klra3Q64329 266 aa19.69■□□□□ 0.74
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Dhx38Q80X98 1228 aa19.69■□□□□ 0.74
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Nat10Q8K224 1024 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Desi2Q9D291 194 aa19.69■□□□□ 0.74
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Klra10Q9R1G6 266 aa19.69■□□□□ 0.74
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Serpinb6Q60854 378 aa19.69■□□□□ 0.74
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 SarnpQ9D1J3 210 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ehd4Q9EQP2 541 aa19.69■□□□□ 0.74
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Nlrp9bQ66X22 1003 aa19.68■□□□□ 0.74
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Card14Q99KF0 999 aa19.68■□□□□ 0.74
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Klc4Q9DBS5 619 aa19.68■□□□□ 0.74
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Kiaa0232Q80U59 1396 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Eif3aP23116 1344 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Sptlc2P97363 560 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gtf2f1Q3THK3 508 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 GpkowQ56A08 488 aa19.68■□□□□ 0.74
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ripor2Q80U16 1078 aa19.68■□□□□ 0.74
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 LratQ9JI60 231 aa19.68■□□□□ 0.74
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Soga3Q6NZL0 945 aa19.67■□□□□ 0.74
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Usp44Q8C2S0 711 aa19.67■□□□□ 0.74
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ppfibp1Q8C8U0 969 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 PhaxQ9JJT9 385 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tjp1P39447 1745 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ubr2Q6WKZ8 1755 aa19.67■□□□□ 0.74
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Akap2O54931 893 aa19.67■□□□□ 0.74
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Pfkfb1P70266 471 aa19.67■□□□□ 0.74
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tex11Q14AT2 947 aa19.67■□□□□ 0.74
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ccdc158Q8CDI6 1109 aa19.67■□□□□ 0.74
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rhot2Q8JZN7 620 aa19.67■□□□□ 0.74
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Hip1rQ9JKY5 1068 aa19.67■□□□□ 0.74
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Mst1rQ62190 1378 aa19.66■□□□□ 0.74
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 LyarQ08288 388 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Znf653Q6YND2 615 aa19.66■□□□□ 0.74
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cdc23Q8BGZ4 597 aa19.66■□□□□ 0.74
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ccdc40Q8BI79 1192 aa19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.4 ms