RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Oxr1Q4KMM3 866 aa14.56□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Emilin1Q99K41 1017 aa14.56□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NapaQ9DB05 295 aa14.56□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Eya3P97480 510 aa14.56□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kcnh4A2A5F7 1018 aa14.55□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm28047Q3US59 414 aa14.55□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Uba5Q8VE47 403 aa14.55□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa14.55□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ugt1a5B2RT14 529 aa14.55□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 GabrdP22933 449 aa14.55□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ift88Q61371 824 aa14.55□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tcp11l1Q8BTG3 509 aa14.55□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Otud6bQ8K2H2 294 aa14.55□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gja10Q9WUS4 505 aa14.55□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PcQ05920 1178 aa14.55□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Aox1O54754 1333 aa14.55□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pcdhb9E9Q5G2 828 aa14.54□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pde11aP0C1Q2 933 aa14.54□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kif5bQ61768 963 aa14.54□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fbxo2Q80UW2 297 aa14.54□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cyp4f39Q8BGU0 532 aa14.54□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Klhl30Q8C3F7 581 aa14.54□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kcnj14Q8JZN3 434 aa14.54□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccdc105Q9D4K7 499 aa14.54□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Col15a1O35206 1367 aa14.54□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sap30bpQ02614 308 aa14.54□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lrrc36Q3V0M2 755 aa14.54□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Usp37Q8C0R0 979 aa14.54□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gimap7Q8R379 293 aa14.54□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 HibadhQ99L13 335 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tfcp2Q9ERA0 502 aa14.54□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Aox2Q5SGK3 1345 aa14.54□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cd248Q91V98 765 aa14.54□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dpp7Q9ET22 506 aa14.54□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tacc2Q9JJG0 1149 aa14.54□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AmfrQ9R049 643 aa14.54□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Arhgef28P97433 1693 aa14.54□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tbc1d2B1AVH7 922 aa14.54□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zbtb7aO88939 569 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Traf1P39428 409 aa14.54□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Erlin2Q8BFZ9 340 aa14.54□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hip1rQ9JKY5 1068 aa14.54□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Exoc3Q6KAR6 755 aa14.53□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Taok2Q6ZQ29 1240 aa14.53□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Stac3Q8BZ71 360 aa14.53□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Frat2Q8K025 231 aa14.53□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Chd1lQ9CXF7 900 aa14.53□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Atp7bQ64446 1462 aa14.53□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Glt1d1A4FUP9 346 aa14.53□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Eddm13E9Q7F5 164 aa14.53□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ankrd40Q5SUE8 363 aa14.53□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kidins220E9Q9B7 1793 aa14.53□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NpcdF8VQB8 469 aa14.53□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cetn1P41209 172 aa14.53□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AbraQ8BUZ1 375 aa14.53□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Plcd1Q8R3B1 756 aa14.53□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 OscarQ8VBT3 265 aa14.53□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rreb1Q3UH06 1700 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prex1Q69ZK0 1650 aa14.53□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pagr1bF6V0H0 108 aa14.53□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Leo1Q5XJE5 667 aa14.53□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hook2Q7TMK6 716 aa14.53□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Usp33Q8R5K2 909 aa14.53□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pagr1aQ99L02 253 aa14.53□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sept14Q9DA97 430 aa14.53□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mettl5Q8K1A0 209 aa14.52□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rbm10Q99KG3 930 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Popdc2Q9ES82 367 aa14.52□□□□□ -0.08
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cyp3a57D3YYZ0 503 aa14.52□□□□□ -0.09
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cyp26a1O55127 497 aa14.52□□□□□ -0.09
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cfap157Q0VFX2 523 aa14.52□□□□□ -0.09
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam178bQ24JP3 464 aa14.52□□□□□ -0.09
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Atad2Q8CDM1 1040 aa14.52□□□□□ -0.09
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hexim1Q8R409 356 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lman1Q9D0F3 517 aa14.52□□□□□ -0.09
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cxcl11Q9JHH5 100 aa14.52□□□□□ -0.09
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Syt10Q9R0N4 523 aa14.52□□□□□ -0.09
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Akap12Q9WTQ5 1684 aa14.52□□□□□ -0.09
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MypnQ5DTJ9 1315 aa14.52□□□□□ -0.09
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Iqgap1Q9JKF1 1657 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccdc174Q3U155 467 aa14.52□□□□□ -0.09
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AcrbpQ3V140 540 aa14.52□□□□□ -0.09
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zscan18E9PUD6 809 aa14.51□□□□□ -0.09
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wdr93Q402B2 695 aa14.51□□□□□ -0.09
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Riox2Q8CD15 465 aa14.51□□□□□ -0.09
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Osbpl5Q9ER64 874 aa14.51□□□□□ -0.09
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NcapgE9PWG6 1004 aa14.51□□□□□ -0.09
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SsbP32067 415 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm5592Q3V0A6 857 aa14.51□□□□□ -0.09
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ifit1Q64282 463 aa14.51□□□□□ -0.09
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Me3Q8BMF3 604 aa14.51□□□□□ -0.09
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kiaa1524Q8BWY9 907 aa14.51□□□□□ -0.09
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccdc113Q8C5T8 377 aa14.51□□□□□ -0.09
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kcnh3Q9WVJ0 1095 aa14.51□□□□□ -0.09
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mroh1E0CZ22 1640 aa14.51□□□□□ -0.09
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccdc191J3QQ27 883 aa14.51□□□□□ -0.09
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gjc1P28229 396 aa14.51□□□□□ -0.09
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Strip1Q8C079 837 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 44.2 ms