RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587914.1

EFTUD2-208, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-208	ENST00000587914	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	ZNF492	Q9P255	531 aa		5.69	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	POLE	Q07864	2286 aa		5.69	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	FAM231B	A6NCW3	169 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	SLC17A3	O00476	420 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	LTA	P01374	205 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	IGKV1-17	P01599	117 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	FAM106CP	P0CH98	169 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	PSG1	P11464	419 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	HNF1A	P20823	631 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	BRS3	P32247	399 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	UBE2E1	P51965	193 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	MFAP4	P55083	255 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	PKIA	P61925	76 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	OR5I1	Q13606	314 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	ARPC1A	Q92747	370 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	PGP	A6NDG6	321 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914		B5MCH6	92 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	TSTD3	H0UI37	97 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914		H3BRN7	92 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914		K7EQM0	130 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	OVOL3	O00110	214 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	LY6H	O94772	140 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	SCGB1D1	O95968	90 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	IGHV3-48	P01763	117 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	HLA-DRB1	P01911	266 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	TCRA	P04437	139 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	CRISP2	P16562	243 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	CBLN1	P23435	193 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	IER3	P46695	156 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	DLX1	P56177	255 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	TPPP2	P59282	170 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	LYZ	P61626	148 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	PDE6H	Q13956	83 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	TSKU	Q8WUA8	353 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	NUDT11	Q96G61	164 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	MLST8	Q9BVC4	326 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914		Q9H3A6	140 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914		A8MWL6	223 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	SNURFL	B1AK76	121 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	LINC00587	B1AMM8	73 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	IGLC2	P0DOY2	106 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	GZMB	P10144	247 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	PAX1	P15863	534 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	TMEM11	P17152	192 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	KLRD1	Q13241	179 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	HES1	Q14469	280 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	ATP6V0B	Q99437	205 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
EFTUD2-208	ENST00000587914	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		5.66	□□□□□ -1.5

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms