RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571409.1

CTDNEP1-206, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 741 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-206ENST00000571409 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
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CTDNEP1-206ENST00000571409 LINC00052Q96N35 136 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDNEP1-206ENST00000571409 C20orf85Q9H1P6 137 aa22.02■■□□□ 1.12
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CTDNEP1-206ENST00000571409 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa22.01■■□□□ 1.11
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CTDNEP1-206ENST00000571409 SOCS3O14543 225 aa22■■□□□ 1.11
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CTDNEP1-206ENST00000571409 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa22■■□□□ 1.11
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CTDNEP1-206ENST00000571409 PMS2P5A8MQ11 134 aa21.99■■□□□ 1.11
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CTDNEP1-206ENST00000571409 OR1B1Q8NGR6 318 aa21.97■■□□□ 1.11
CTDNEP1-206ENST00000571409 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
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CTDNEP1-206ENST00000571409 IGKV3-20P01619 116 aa21.95■■□□□ 1.1
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CTDNEP1-206ENST00000571409 METTL15P1P0C7V9 234 aa21.95■■□□□ 1.1
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CTDNEP1-206ENST00000571409 C16orf92Q96LL3 132 aa21.93■■□□□ 1.1
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CTDNEP1-206ENST00000571409 LINC00869P0C866 280 aa21.89■■□□□ 1.09
CTDNEP1-206ENST00000571409 RAP2BP61225 183 aa21.89■■□□□ 1.09
CTDNEP1-206ENST00000571409 SELENOTP62341 195 aa21.89■■□□□ 1.09
CTDNEP1-206ENST00000571409 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa21.89■■□□□ 1.09
CTDNEP1-206ENST00000571409 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
CTDNEP1-206ENST00000571409 HIGD1AQ9Y241 93 aa21.89■■□□□ 1.09
CTDNEP1-206ENST00000571409 A0A0J9YX75 114 aa21.88■■□□□ 1.09
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