RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RRN3-205	ENST00000563559	FAM231B	A6NCW3	169 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RRN3-205	ENST00000563559	HSBP1	O75506	76 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RRN3-205	ENST00000563559	PSG1	P11464	419 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RRN3-205	ENST00000563559	COX7A1	P24310	79 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RRN3-205	ENST00000563559	HBB	P68871	147 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RRN3-205	ENST00000563559	PLGLA	Q15195	96 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RRN3-205	ENST00000563559	MMD	Q15546	238 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RRN3-205	ENST00000563559	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	14.66	□□□□□ -0.06
RRN3-205	ENST00000563559	LY6L	H3BQJ8	138 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RRN3-205	ENST00000563559		I3L2K1	104 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RRN3-205	ENST00000563559		K7ENP7	123 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RRN3-205	ENST00000563559	C3orf79	P0CE67	100 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RRN3-205	ENST00000563559	CAMP	P49913	170 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RRN3-205	ENST00000563559	LYZ	P61626	148 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RRN3-205	ENST00000563559	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RRN3-205	ENST00000563559	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RRN3-205	ENST00000563559	OR8B2	Q96RD0	313 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RRN3-205	ENST00000563559	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
RRN3-205	ENST00000563559	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	14.65	□□□□□ -0.06
RRN3-205	ENST00000563559	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RRN3-205	ENST00000563559	NTF3	P20783	257 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RRN3-205	ENST00000563559	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	14.65	□□□□□ -0.06
RRN3-205	ENST00000563559	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RRN3-205	ENST00000563559	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RRN3-205	ENST00000563559	LIPF	P07098	398 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RRN3-205	ENST00000563559	LYNX1	P0DP58	116 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RRN3-205	ENST00000563559	CTRL	P40313	264 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RRN3-205	ENST00000563559	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RRN3-205	ENST00000563559	SGK494	Q96LW2	274 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RRN3-205	ENST00000563559	DLX1	P56177	255 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	PMCHL1	Q16048	86 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	SPATA45	Q537H7	98 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	LEMD1	Q68G75	181 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	CNIH1	O95406	144 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	SPTBN2	O15020	2390 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	VWC2L	B2RUY7	222 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	14.63	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	ABCA1	O95477	2261 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559		M0R2Z0	102 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	14.62	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	TCF24	Q7RTU0	167 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	LINC01560	Q8TB33	94 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	14.62	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	HTR1D	P28221	377 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	14.62	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	14.62	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	S100A7A	Q86SG5	101 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559		Q86TA4	180 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		14.61	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559		H3BTX0	84 aa		14.61	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	IGKV1-17	P01599	117 aa		14.61	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	CEACAM3	P40198	252 aa		14.61	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	14.61	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		14.61	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	GTSF1	Q8WW33	167 aa		14.61	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	14.61	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		14.6	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	TIMM23	O14925	209 aa		14.6	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	14.6	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	14.6	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		14.6	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		14.6	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		14.6	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	DPM3	Q9P2X0	92 aa		14.6	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	COL8A1	P27658	744 aa		14.6	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	FOXC1	Q12948	553 aa		14.6	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		14.6	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559		K7EIM0	57 aa		14.59	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559		K7EQM0	130 aa		14.59	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	NBR2	O15453	112 aa		14.59	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	14.59	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	TIMD4	Q96H15	378 aa		14.59	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		14.59	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		14.59	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	C20orf202	A1L168	122 aa		14.59	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		14.59	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	14.59	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		14.59	□□□□□ -0.07
RRN3-205	ENST00000563559	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		14.58	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		14.58	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	IGLC2	P0DOY2	106 aa		14.58	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	IGLC3	P0DOY3	106 aa		14.58	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		14.58	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	NPB	Q8NG41	125 aa		14.58	□□□□□ -0.08

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