RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557013.1

SAMD4A-211, Transcript of sterile alpha motif domain containing 4A, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SAMD4A, Length 3,637 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4A-211ENST00000557013 U3KQA8 63 aa6.7□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa6.69□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 DEFB108AA8MXU0 73 aa6.69□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa6.69□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 IGHV3-43DP0DP04 118 aa6.69□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 CACNG7P62955 275 aa6.69□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 ZNF645Q8N7E2 425 aa6.69□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 NUP35Q8NFH5 326 aa6.69□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 RFESDQ8TAC1 157 aa6.69□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 PLPPR2Q96GM1 343 aa6.69□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 RTL8AQ9BWD3 113 aa6.69□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 OSTCQ9NRP0 149 aa6.69□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 DNAJC13O75165 2243 aa6.69□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 DSPP15924 2871 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 GAGE2BQ13066 116 aa6.69□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 GAGE2EQ4V326 116 aa6.69□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 ENY2Q9NPA8 101 aa6.69□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.69□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 OR4X2Q8NGF9 303 aa6.69□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 TXNDC17Q9BRA2 123 aa6.69□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 PKIBQ9C010 78 aa6.69□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.69□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 PMS2P5A8MQ11 134 aa6.68□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 CT45A10P0DMU9 189 aa6.68□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 RAB1BQ9H0U4 201 aa6.68□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa6.68□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 ABCA1O95477 2261 aa6.68□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 TMEM189A5PLL7 270 aa6.68□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 NCR2O95944 276 aa6.68□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 APOHP02749 345 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 OR9G9P0C7N8 305 aa6.68□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 OR1C1Q15619 314 aa6.68□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.68□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa6.68□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 TTC9CQ8N5M4 171 aa6.68□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 KIR2DL4Q99706 377 aa6.68□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa6.68□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 C12orf77C9JDV5 145 aa6.68□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 TM4SF5O14894 197 aa6.68□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 SNCGO76070 127 aa6.68□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 TFF1P04155 84 aa6.68□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 Q0VFX4 171 aa6.68□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 ZNF766Q5HY98 468 aa6.68□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 RAB1CQ92928 201 aa6.68□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 PTH2Q96A98 100 aa6.68□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 VCX2Q9H322 139 aa6.68□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa6.67□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa6.67□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 VWC2LB2RUY7 222 aa6.67□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 C9JCJ5 164 aa6.67□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 OPRK1P41145 380 aa6.67□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 SPXQ9BT56 116 aa6.67□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 OBP2BQ9NPH6 170 aa6.67□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 NAV2Q8IVL1 2488 aa6.67□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 PSPNO60542 156 aa6.67□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.67□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.67□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 Q6ZR03 302 aa6.67□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 MIR17HGQ75NE6 70 aa6.67□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 WDR86Q86TI4 376 aa6.67□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 Q8IYB0 196 aa6.67□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 ZBTB34Q8NCN2 500 aa6.67□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6.67□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 HES7Q9BYE0 225 aa6.67□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 WDR83OSQ9Y284 106 aa6.67□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 ADAMTS20P59510 1910 aa6.67□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 C15orf62A8K5M9 175 aa6.67□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 HBBP68871 147 aa6.67□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 PLGLB1Q02325 96 aa6.67□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 MDP1Q86V88 176 aa6.67□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 C18orf15Q96N68 181 aa6.67□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 TAAR6Q96RI8 345 aa6.67□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 POLEQ07864 2286 aa6.66□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa6.66□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 WNT9BO14905 357 aa6.66□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 FCGR3BO75015 233 aa6.66□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 IGHV3-13P01766 116 aa6.66□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 EVI2AP22794 236 aa6.66□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 FOXI1Q12951 378 aa6.66□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 ZNF826PQ6ZT77 177 aa6.66□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 NGBQ9NPG2 151 aa6.66□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 SPG11Q96JI7 2443 aa6.66□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 LAMA5O15230 3695 aa6.66□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 CHD6Q8TD26 2715 aa6.66□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 LINC00473A8K010 186 aa6.66□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 FABP5P3A8MUU1 101 aa6.66□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 MAGEA5P43359 124 aa6.66□□□□□ -1.34
SAMD4A-211ENST00000557013 PSMB2P49721 201 aa6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.9 ms