RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-222ENST00000540445 C1orf194Q5T5A4 169 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 C2CD4CQ8TF44 421 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 SLC25A22Q9H936 323 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 PSENENQ9NZ42 101 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 IGLL5B9A064 214 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 H3BMM0 161 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 SSSCA1O60232 199 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 SCGB1D2O95969 90 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 RBMY1CP0DJD4 496 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 S100A7P31151 101 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 FXYD7P58549 80 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 ID3Q02535 119 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 GSG1LQ6UXU4 331 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 THAP8Q8NA92 274 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 Q8NAQ8 132 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 BPIFCQ8NFQ6 507 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 OR4B1Q8NGF8 309 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 OR1B1Q8NGR6 318 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 C16orf92Q96LL3 132 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 GSKIPQ9P0R6 139 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.53□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 C11orf94C9JXX5 98 aa6.53□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 IL5P05113 134 aa6.53□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 IL7P13232 177 aa6.53□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 HLA-DRB4P13762 266 aa6.53□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 HLA-DMBP28068 263 aa6.53□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 GALR1P47211 349 aa6.53□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 PSMB3P49720 205 aa6.53□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 DEFB1P60022 68 aa6.53□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 CNPY1Q3B7I2 92 aa6.53□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 EBLN2Q6P2I7 272 aa6.53□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.53□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 SMIM8Q96KF7 97 aa6.53□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 RSG1Q9BU20 258 aa6.53□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 TMEM147Q9BVK8 224 aa6.53□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 NDUFA13Q9P0J0 144 aa6.53□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.53□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 X6R8D5 127 aa6.53□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 DNAH2Q9P225 4427 aa6.53□□□□□ -1.36
LMO3-222ENST00000540445 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 ZNF98A6NK75 572 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 PRSS46E5RG02 174 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 ISLRO14498 428 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 METTL15P1P0C7V9 234 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 MEOX2P50222 304 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 RAP2BP61225 183 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 FGL1Q08830 312 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 TMEM144Q7Z5S9 345 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 OR10P1Q8NGE3 313 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 OR4D5Q8NGN0 318 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 HRH4Q9H3N8 390 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 RPRMQ9NS64 109 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 DOK5Q9P104 306 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 TRAV6A0A075B6T7 132 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 FAM25EA8MYX2 175 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 F6UB75 175 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 LYRM1O43325 122 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 HYPMO75409 117 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 OR5G3P0C626 314 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 BTCP35070 178 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 EMP1P54849 157 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 TCTAP57738 103 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 ZNF846Q147U1 533 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 FAM78BQ5VT40 261 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 Q6ZTC4 211 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 ZNF767PQ75MW2 155 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 GPR82Q96P67 336 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 SLC25A32Q9H2D1 315 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 NPVFQ9HCQ7 196 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 MGAT4CQ9UBM8 478 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 SLC45A2Q9UMX9 530 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 C5orf51A6NDU8 294 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 PMS2P5A8MQ11 134 aa6.5□□□□□ -1.37
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